当前蛋白身份：P75958
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7ARH LolCDE in complex with lipoprotein 提交 2020-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7ARI LolCDE apo structure 提交 2020-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7ARJ LolCDE in complex with lipoprotein and AMPPNP complex undimerized form 提交 2020-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7ARK LolCDE in complex with AMP-PNP in the closed NBD state 提交 2020-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7ARL LolCDE in complex with lipoprotein and ADP 提交 2020-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7ARM LolCDE in complex with lipoprotein and LolA 提交 2020-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7MDX LolCDE nucleotide-free 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
6–408（403 aa）
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 1 ZM5 (2R)-2-(tridecanoyloxy)propyl hexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7V8I LolCD(E171Q)E with bound AMPPNP in nanodiscs 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.60 Å |
| 7V8L LolCDE with bound RcsF in nanodiscs 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | PCJ (2R)-3-{[(2S)-3-HYDROXY-2-(PALMITOYLAMINO)PROPYL]THIO}PROPANE-1,2-DIYL DIHEXADECANOATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.50 Å |
| 7V8M LolCDE-apo in nanodiscs 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.20 Å |
| 9GRC Cryo-EM structure of lipoprotein-bound LolCDE in nanodiscs 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9GVK Cryo-EM structure of endogenous ATP-bound LolCDE with LolD-E171Q mutations in nanodiscs 提交 2024-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9RLC LolCDE complex with Lpp lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9RLD LolCDE complex with Lpp lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9RLE LolCDE complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9RLF LolCDE complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 9RLG LolCDE complex with LolB lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 9RLH LolCDE complex with del 9-15 LolB lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 9RLI LolCDEdelta(235-252) complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–234（234 aa）
链 E
253–414（162 aa）
|
突变：delta 235-252 突变：delta 235-252 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 9RLJ LolCDE with bound ATPgammaS 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9RLK LolCDE(delta 235-252) complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–234（234 aa）
链 E
253–414（162 aa）
|
突变：delta 235-252 (inclusive) with GS linker 突变：delta 235-252 (inclusive) with GS linker | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 9XRO LolCDE in complex with SMT-738_3 提交 2025-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
1–414（414 aa）
|
未记录 | A1ER4 2-azanyl-1-[6-[2-azanyl-5-(3-methylpyridin-4-yl)-1H-imidazol-4-yl]-2,3-dihydro-1,4-benzoxazin-4-yl]-2-methyl-propan-1-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |