当前蛋白身份：Q00959
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2A5S Crystal Structure Of The NR2A Ligand Binding Core In Complex With Glutamate 提交 2005-06-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
401–539（139 aa）
片段：S1S2 ligand-binding core
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；277 K；PEG 8000, HEPES, calcium acetate, pH 7, EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 2A5S Crystal Structure Of The NR2A Ligand Binding Core In Complex With Glutamate 提交 2005-06-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
401–539（139 aa）
片段：S1S2 ligand-binding core
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；277 K；PEG 8000, HEPES, calcium acetate, pH 7, EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 2A5T Crystal Structure Of The NR1/NR2A ligand-binding cores complex 提交 2005-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
401–539（139 aa）
片段：S1S2 ligand-binding core
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；277 K；PEG 8000, HEPES, Calcium acetate, pH 7., EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 4NF4 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with DCKA and glutamate 提交 2013-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：Ligand-binding domain; unp residues 402-539; unp residues 661-802
链 B
661–802（142 aa）
片段：Ligand-binding domain; unp residues 402-539; unp residues 661-802
|
突变：S758T 突变：S758T | 2JK 4-hydroxy-5,7-dimethylquinoline-2-carboxylic acid × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MME, HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 4NF5 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and D-AP5 提交 2013-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：unp residues 402-539; unp residues 661-802
链 B
661–802（142 aa）
片段：unp residues 402-539; unp residues 661-802
|
突变：S758T 突变：S758T | GLY GLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 2JJ 5-phosphono-D-norvaline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MME, HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.213 |
| 4NF6 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and PPDA 提交 2013-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：Ligand-binding domain; unp residues 402-539; unp residues 661-802
链 B
661–802（142 aa）
片段：Ligand-binding domain; unp residues 402-539; unp residues 661-802
|
突变：S758T 突变：S758T | GLY GLYCINE × 1 2JL (2S,3R)-1-(phenanthren-2-ylcarbonyl)piperazine-2,3-dicarboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MMG and HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.215 |
| 4NF8 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and glutamate in PEG2000MME 提交 2013-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：Ligand-binding domain; unp residues 402-539; unp residues 661-802
链 B
661–802（142 aa）
片段：Ligand-binding domain; unp residues 402-539; unp residues 661-802
|
突变：S758T 突变：S758T | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MME and HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 5DEX Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-ACEPC 提交 2015-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：UNP residues 402-539, 661-802
链 B
661–802（142 aa）
片段：UNP residues 402-539, 661-802
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5E0 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-phenyl-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；AMMONIUM ACETATE, PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.285 |
| 5I56 Agonist-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with TCN201 提交 2016-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
661–800（140 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 67P N-({4-[2-(benzenecarbonyl)hydrazinecarbonyl]phenyl}methyl)-3-chloro-4-fluorobenzene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.239 |
| 5I57 Glutamate- and glycine-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains 提交 2016-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：unp residues 402-539; 661-800
链 B
661–800（140 aa）
片段：unp residues 402-539; 661-800
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 5I58 GLUTAMATE- AND GLYCINE-BOUND GLUN1/GLUN2A AGONIST BINDING DOMAINS WITH MPX-004 提交 2016-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
661–800（140 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 67R 5-({[(3-chloro-4-fluorophenyl)sulfonyl]amino}methyl)-N-[(2-methyl-1,3-thiazol-5-yl)methyl]pyrazine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.292 |
| 5I59 Glutamate- and glycine-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with MPX 007 提交 2016-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
661–800（140 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 67Q 5-({[(3,4-difluorophenyl)sulfonyl]amino}methyl)-6-methyl-N-[(2-methyl-4H-1lambda~4~,3-thiazol-5-yl)methyl]pyrazine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.264 |
| 5JTY Glutamate- and DCKA-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with MPX-007 提交 2016-05-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：unp residues 402-539; 661-800
链 B
661–800（140 aa）
片段：unp residues 402-539; 661-800
|
未记录 | 2JK 4-hydroxy-5,7-dimethylquinoline-2-carboxylic acid × 1 6ND 5-({[(3,4-difluorophenyl)sulfonyl]amino}methyl)-6-methyl-N-[(2-methyl-1,3-thiazol-5-yl)methyl]pyrazine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.278 |
| 5TPW Crystal structure of amino terminal domains of the NMDA receptor subunit GluN1 and GluN2A in complex with zinc at the GluN2A 提交 2016-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
34–393（360 aa）
片段：residues 34-393
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8M Ammonium sulfate
2.5% Isopropanol
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.245 |
| 5TQ0 Crystal structure of amino terminal domains of the NMDA receptor subunit GluN1 and GluN2A in the presence of EDTA 提交 2016-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
34–393（360 aa）
片段：residues 34-393
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 12 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8 M Ammonium sulfate, 2.5% Isopropanol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 5TQ2 Crystal structure of amino terminal domains of the NMDA receptor subunit GluN1 and GluN2A in complex with zinc at GluN1 and GluN2A 提交 2016-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
34–393（360 aa）
片段：residues 34-393
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.8M Ammonium sulfate, 2.5% Isopropanol
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.261 |
| 5VIH Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-fluorophenyl-ACEPC 提交 2017-04-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
661–802（142 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5DZ 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonia Acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 5VII Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-(3-fluoropropyl)phenyl-ACEPC 提交 2017-04-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5DY 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-[4-(3-fluoropropyl)phenyl]-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonia Acetate, PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.259 |
| 5VIJ Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-bromophenyl-ACEPC 提交 2017-04-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
661–802（142 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5DX 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(4-bromophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonia Acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.255 |
| 6MM9 Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '1-Knuckle' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 6.1 提交 2018-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.97 Å |
| 6MMA Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Extended' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 6.1 提交 2018-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.31 Å |
| 6MMB Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Super-Splayed' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 6.1 提交 2018-09-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 12.70 Å |
| 6MMG Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar EDTA, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.23 Å |
| 6MMH Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Extended-2' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 8.21 Å |
| 6MMI Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Splayed-Open' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 8.93 Å |
| 6MMJ Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Super-Splayed' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 16.50 Å |
| 6MMK Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '1-Knuckle' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.08 Å |
| 6MML Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Asymmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 7.14 Å |
| 6MMM Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Extended-1' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.84 Å |
| 6MMN Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 8.0 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 7.51 Å |
| 6MMP Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 0.1 millimolar EDTA, and at pH 8.0 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.88 Å |
| 6MMR Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, 3 millimolar EDTA, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.13 Å |
| 6MMS Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar EDTA, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
突变：H128S, N687Q 突变：H128S, N687Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.38 Å |
| 6MMT Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '1-Knuckle' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
突变：H128S, N687Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 7.46 Å |
| 6MMU Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '2-Knuckle-Asymmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
突变：H128S, N687Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.30 Å |
| 6MMV Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* Extracellular Domain in the '2-Knuckle-Asymmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–800（800 aa）
片段：UNP residues 1-800
链 D
1–800（800 aa）
片段：UNP residues 1-800
|
突变：H128S, N687Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 4.71 Å |
| 6MMW Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
突变：H128S, N687Q 突变：H128S, N687Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.20 Å |
| 6MMX Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the 'Extended' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
链 D
1–837（837 aa）
片段：UNP residues 1-837
|
突变：H128S, N687Q 突变：H128S, N687Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.99 Å |
| 6ODL Crystal structure of GluN2A agonist binding domain with 4-butyl-(S)-CCG-IV 提交 2019-03-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
404–539（136 aa）
链 B
404–539（136 aa）
|
未记录 | M7V (1S,2R)-2-[(S)-amino(carboxy)methyl]-1-butylcyclopropane-1-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.283 |
| 6OVD Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 3-ethylphenyl-ACEPC 提交 2019-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
661–802（142 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 N9A (3S,5S)-5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(3-ethylphenyl)pyrazolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 6OVE Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-propylphenyl-ACEPC 提交 2019-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
662–801（140 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 N9D (3R,5S)-5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(4-propylphenyl)pyrazolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 6OVE Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-propylphenyl-ACEPC 提交 2019-05-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
662–801（140 aa）
|
未记录 | N9D (3R,5S)-5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(4-propylphenyl)pyrazolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 6USU Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with L689,560 and glutamate 提交 2019-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：UNP residues 402-539, 661-802
链 B
661–802（142 aa）
片段：UNP residues 402-539, 661-802
|
未记录 | QGM (2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；291 K；0.2 M HEPES, pH 7.0, 60-90 mM sodium chloride, 15-20% PEG2000 MME
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.222 |
| 6USV Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and SDZ 220-040 提交 2019-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：UNP residues 402-539, 661-802
链 B
661–802（142 aa）
片段：UNP residues 402-539, 661-802
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 QGP (2S)-2-amino-3-[2',4'-dichloro-4-hydroxy-5-(phosphonomethyl)biphenyl-3-yl]propanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；291 K；0.2 M HEPES, pH 7.0, 60-90 mM sodium chloride, 15-20% PEG2000 MME
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 6UZ6 Crystal structure of GLUN1/GLUN2A-4M mutant ligand-binding domain in complex with glycine and glutamate 提交 2019-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-800)
链 B
661–800（140 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-800)
|
突变：A414R, K738M, G740R, R741K 突变：A414R, K738M, G740R, R741K | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.212 |
| 6UZG Crystal structure of GLUN1/GLUN2A-4M mutant ligand-binding domain in complex with glycine and homoquinolinic acid 提交 2019-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
链 B
661–802（142 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
|
突变：A414R, K738M, G740R, R741K 突变：A414R, K738M, G740R, R741K | GLY GLYCINE × 1 QM1 3-(carboxymethyl)pyridine-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.250 |
| 6UZR Crystal structure of GLUN1/GLUN2A ligand-binding domain in complex with glycine and homoquinolinic acid 提交 2019-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
链 B
661–802（142 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 QM1 3-(carboxymethyl)pyridine-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.207 |
| 6UZW Crystal structure of GLUN1/GLUN2A ligand-binding domain in complex with glycine and UBP791 提交 2019-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
链 B
661–802（142 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 QM4 (2S,3R)-1-[7-(2-carboxyethyl)phenanthrene-2-carbonyl]piperazine-2,3-dicarboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.247 |
| 6UZX Crystal structure of GLUN1/GLUN2A-4M mutant ligand-binding domain in complex with glycine and UBP791 提交 2019-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
链 B
661–802（142 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 402-539,661-802)
|
突变：A414R, K738M, G740R, R741K 突变：A414R, K738M, G740R, R741K | GOL GLYCEROL × 2 GLY GLYCINE × 1 QM4 (2S,3R)-1-[7-(2-carboxyethyl)phenanthrene-2-carbonyl]piperazine-2,3-dicarboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.245 |
| 8JF7 Triheteromeric NMDA receptor GluN1-GluN2A-GluN3A in complex with glycine, glutamate, a GluN1-specific Fab,and a GluN2A-specific Fab 提交 2023-05-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 B
1–842（842 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.73 Å |
| 8XLK Structure of native tri-heteromeric GluN1-GluN2A-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus 提交 2023-12-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
1–1464（1464 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 7RC (2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9C7C Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in nanodisc complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123, open conformation 提交 2024-06-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–865（865 aa）
链 D
1–865（865 aa）
|
未记录 | A1AUV 4-cyclohexyl-N-[(8R)-2-cyclopropyl-7-hydroxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]benzene-1-sulfonamide × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 HP6 HEPTANE × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 8 GLY GLYCINE × 2 D12 DODECANE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 D10 DECANE × 2 HEX HEXANE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9C7E Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in nanodisc complex with glycine, glutamate, and GNE-4123, open conformation, C2 symmetry 提交 2024-06-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
链 D
1–866（866 aa）
|
未记录 | A1AUV 4-cyclohexyl-N-[(8R)-2-cyclopropyl-7-hydroxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]benzene-1-sulfonamide × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 D12 DODECANE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9C7P Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in digitonin complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123 提交 2024-06-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
链 D
1–866（866 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.61 Å |
| 9C7Q Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A, in complex with glycine and glutamate 提交 2024-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
链 D
1–866（866 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |
| 9C7R Diheteromeric GluN1/GluN2A (M817V) in digitonin complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123 提交 2024-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
链 D
1–866（866 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9DA9 Crystal structure of GluN1/GluN2A agonist-binding domains in complex with 7CKA and glutamate 提交 2024-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–802（401 aa）
|
未记录 | CKA 7-Chlorokynurenic acid × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium acetate and 14-18% PEG 4000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 9NYZ Crystal structure of DCKA/glutamate-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with UCM-101 提交 2025-03-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
402–539（138 aa）
链 B
661–802（142 aa）
|
未记录 | DK1 5,7-DICHLORO-4-HYDROXYQUINOLINE-2-CARBOXYLIC ACID × 1 A1B7E N-(cyclohexylmethyl)-2-[(5-{[(1R)-1-phenylpropyl]amino}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfanyl]acetamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；ammonium acetate, PEG 4000
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.202 |
| 9PZQ GluN1/GluN2A in complex with polyclonal autoantibody Fab fragments (class 1), glycine- and glutamate-bound state 提交 2025-08-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
链 D
1–866（866 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.07 Å |
| 9PZR GluN1/GluN2A in complex with polyclonal autoantibody Fab fragments (class 2), glycine- and glutamate-bound state 提交 2025-08-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
链 D
1–866（866 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 9PZW GluN1/GluN2A in complex with 3D2 Fab, glycine and glutamate-bound state 提交 2025-08-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
链 D
1–866（866 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9PZX GluN1/GluN2A in complex with 3D2 Fab, local ATD dimer 提交 2025-08-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–866（866 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |