当前蛋白身份:Q01860
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–360(360 aa)
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–360(360 aa)
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 7U0G structure of LIN28b nucleosome bound 3 OCT4 提交 2022-02-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致 |
链 K
138–290(153 aa)
链 L
138–290(153 aa)
链 M
138–290(153 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7U0I Structure of LIN28b nucleosome bound 2 OCT4 提交 2022-02-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致 |
链 L
138–292(155 aa)
链 M
138–292(155 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8G87 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence (focused refinement of Oct4 bound region) 提交 2023-02-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–360(360 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.10 Å |
| 8G88 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence 提交 2023-02-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–360(360 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8G8B Nucleosome with human nMatn1 sequence in complex with Human Oct4 提交 2023-02-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–360(360 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8G8E Human Oct4 bound to nucleosome with human LIN28B sequence 提交 2023-02-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–360(360 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8G8G Interaction of H3 tail in LIN28B nucleosome with Oct4 提交 2023-02-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–360(360 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–273(273 aa)
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8SPS High resolution structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site a and site b 提交 2023-05-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致 |
链 L
138–290(153 aa)
链 M
138–290(153 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8SPU Structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site c 提交 2023-05-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 L
138–290(153 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–360(360 aa)
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–360(360 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–360(360 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–360(360 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |