当前蛋白身份:Q01860 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 K 1–360(360 aa)
未记录 PTD PENTANEDIAL × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 K 1–360(360 aa)
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7U0G structure of LIN28b nucleosome bound 3 OCT4 提交 2022-02-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 K 138–290(153 aa)
链 L 138–290(153 aa)
链 M 138–290(153 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7U0I Structure of LIN28b nucleosome bound 2 OCT4 提交 2022-02-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 L 138–292(155 aa)
链 M 138–292(155 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8G87 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence (focused refinement of Oct4 bound region) 提交 2023-02-17 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 X 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
8G88 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence 提交 2023-02-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 X 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8G8B Nucleosome with human nMatn1 sequence in complex with Human Oct4 提交 2023-02-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 X 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8G8E Human Oct4 bound to nucleosome with human LIN28B sequence 提交 2023-02-17 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 X 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8G8G Interaction of H3 tail in LIN28B nucleosome with Oct4 提交 2023-02-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 X 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 K 1–273(273 aa)
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SPS High resolution structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site a and site b 提交 2023-05-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 L 138–290(153 aa)
链 M 138–290(153 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8SPU Structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site c 提交 2023-05-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 L 138–290(153 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 V 1–360(360 aa)
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 V 1–360(360 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 V 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 V 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å