当前蛋白身份：Q02554
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5GM6 Cryo-EM structure of the activated spliceosome (Bact complex) at 3.5 angstrom resolution 提交 2016-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric（46） 与全部聚合物一致 |
链 H
1–436（436 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 13 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |
| 5LSB Crystal structure of yeast Hsh49p in complex with Cus1p binding domain. 提交 2016-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
290–368（79 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Equal volumes of 10-15 mg/ml protein solution were mixed with an equal volume of reservoir solution containing 2.45-2.65 M NaCl in 0.1M sodium acetate pH 4.8-4.9
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分辨率 2.70 Å R-free 0.233 |
| 5LSB Crystal structure of yeast Hsh49p in complex with Cus1p binding domain. 提交 2016-08-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
290–368（79 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Equal volumes of 10-15 mg/ml protein solution were mixed with an equal volume of reservoir solution containing 2.45-2.65 M NaCl in 0.1M sodium acetate pH 4.8-4.9
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.233 |
| 5LSB Crystal structure of yeast Hsh49p in complex with Cus1p binding domain. 提交 2016-08-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
290–368（79 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Equal volumes of 10-15 mg/ml protein solution were mixed with an equal volume of reservoir solution containing 2.45-2.65 M NaCl in 0.1M sodium acetate pH 4.8-4.9
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分辨率 2.70 Å R-free 0.233 |
| 5LSL Crystal structure of yeast Hsh49p in complex with Cus1p binding domain. 提交 2016-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
290–368（79 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；18% PEG4000, 0.1M Tris HCl pH 8.5, 45 mM LiSO4
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分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 5LSL Crystal structure of yeast Hsh49p in complex with Cus1p binding domain. 提交 2016-09-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
290–368（79 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；18% PEG4000, 0.1M Tris HCl pH 8.5, 45 mM LiSO4
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分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 5LSL Crystal structure of yeast Hsh49p in complex with Cus1p binding domain. 提交 2016-09-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
290–368（79 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；18% PEG4000, 0.1M Tris HCl pH 8.5, 45 mM LiSO4
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分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 5LSL Crystal structure of yeast Hsh49p in complex with Cus1p binding domain. 提交 2016-09-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
290–368（79 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；18% PEG4000, 0.1M Tris HCl pH 8.5, 45 mM LiSO4
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 5NRL Structure of a pre-catalytic spliceosome 提交 2017-04-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–435（435 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；Buffer pH: HEPES, 7.9; EDTA, 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were glow-discharged for 15 s before deposition of 3 microliter sample (~1.5 mg mL-1), and subsequently incubated for 2-3.5 s before blotting and vitrification by plunging into liquid ethane with a Vitrobot Mark III (FEI) operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity.
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分辨率 7.20 Å |
| 5ZWM Cryo-EM structure of the yeast pre-B complex at an average resolution of 3.4~4.6 angstrom (tri-snRNP and U2 snRNP Part) 提交 2018-05-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 2
1–436（436 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |
| 5ZWO Cryo-EM structure of the yeast B complex at average resolution of 3.9 angstrom 提交 2018-05-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 2
1–436（436 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.90 Å |
| 6G90 Prespliceosome structure provides insight into spliceosome assembly and regulation (map A2) 提交 2018-04-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric（38） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–435（435 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2-3.5 s and vitrified by plunging into liquid ethane with a FEI Vitrobot Mark III operated at 4 degree Celsius and 100% humidity.
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分辨率 4.00 Å |
| 7OQB The U2 part of Saccharomyces cerevisiae spliceosomal pre-A complex (delta BS-A ACT1) 提交 2021-06-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–436（436 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 9.00 Å |
| 7OQE Saccharomyces cerevisiae spliceosomal pre-A complex (delta BS-A ACT1) 提交 2021-06-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric（39） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–436（436 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |