当前蛋白身份：Q13421
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4F3F Crystal Structure of Msln7-64 MORAb-009 FAB complex 提交 2012-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
302–359（58 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；0.1 M Trisodium citrate pH 5.6, 17% Polyethylene glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 2.65 Å R-free 0.222 |
| 7U8C Crystal structure of Mesothelin C-terminal peptide-MORAb 15B6 FAB complex 提交 2022-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 BA2
590–606（17 aa）
片段：C-terminal peptide (UNP residues 590-606)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.5, 26% PEG550 MME, 6% 2-propanol
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分辨率 1.74 Å R-free 0.238 |
| 7U9J Crystal structure of Mesothelin-207 fragment 提交 2022-03-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
296–501（206 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 100 mM potassium chloride, 12.5% PEG3350, 100 mM lithium sulfate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.216 |
| 7U9J Crystal structure of Mesothelin-207 fragment 提交 2022-03-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
296–501（206 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 100 mM potassium chloride, 12.5% PEG3350, 100 mM lithium sulfate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.216 |
| 7UED Crystal structure of full length mesothelin bound with MORAb-009 Fab 提交 2022-03-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
295–599（305 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；0.1 M Tris, pH 7, 150 mM sodium citrate, 16.4% PEG3350, 100 mM lithium sulfate
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分辨率 3.00 Å R-free 0.237 |
| 8CX3 Crystal structure of full-length mesothelin 提交 2022-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
295–599（305 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；0.9-1.1 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.310 |
| 8CX3 Crystal structure of full-length mesothelin 提交 2022-05-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
295–599（305 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；0.9-1.1 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.310 |
| 8CX3 Crystal structure of full-length mesothelin 提交 2022-05-19 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
295–599（305 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；0.9-1.1 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.310 |
| 8CX3 Crystal structure of full-length mesothelin 提交 2022-05-19 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
295–599（305 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；0.9-1.1 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.310 |
| 8CX3 Crystal structure of full-length mesothelin 提交 2022-05-19 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
295–599（305 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；0.9-1.1 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.310 |
| 8CX3 Crystal structure of full-length mesothelin 提交 2022-05-19 | Assembly 6 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
295–599（305 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；0.9-1.1 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.310 |
| 8CXC Novel Anti-Mesothelin Antibodies Enable Crystallography of the Intact Mesothelin Ectodo- main and Engineering of Potent, T cell-engaging Bispecific Therapeutics 提交 2022-05-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric（5） 待复核 |
链 M
296–605（310 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；tris 8.0, zinc chloride, ammonium sulfate
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分辨率 4.31 Å R-free 0.300 |
| 8CYH Novel Anti-Mesothelin Antibodies Enable Crystallography of the Intact Mesothelin Ectodo- main and Engineering of Potent, T cell-engaging Bispecific Therapeutics 提交 2022-05-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
296–605（310 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；Tris (8.0), sodium citrate, Peg3350
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分辨率 3.38 Å R-free 0.268 |
| 8CZ8 Novel Anti-Mesothelin Antibodies Enable Crystallography of the Intact Mesothelin Ectodo- main and Engineering of Potent, T cell-engaging Bispecific Therapeutics 提交 2022-05-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
434–590（157 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；bicine (9.0), glycerol, ammonium sulfate
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分辨率 2.60 Å R-free 0.224 |
| 8CZ8 Novel Anti-Mesothelin Antibodies Enable Crystallography of the Intact Mesothelin Ectodo- main and Engineering of Potent, T cell-engaging Bispecific Therapeutics 提交 2022-05-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
434–590（157 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；bicine (9.0), glycerol, ammonium sulfate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.224 |
| 8FSL Human Mesothelin bound to a neutralizing VH domain antibody 提交 2023-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
300–584（285 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；PEG3350 20%
0.15 M ammonium nitrate
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分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 8FSL Human Mesothelin bound to a neutralizing VH domain antibody 提交 2023-01-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
300–584（285 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；PEG3350 20%
0.15 M ammonium nitrate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 8VM1 Structural Elucidation of the Mesothelin Mucin16 CA125 Interaction 提交 2024-01-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
296–359（64 aa）
片段：residues 296-359 of mesothelin (Uniprot numbering),SEA 10 domain of mucin-16
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Bis-Tris, NH4CL, PEG3350
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.298 |
| 9P4C Crystal structure of Mesothelin C-terminal peptide-RO4 Fab complex 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
590–606（17 aa）
片段：C-terminal peptide (UNP residues 590-606)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.5 and 16% PEG 10000
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分辨率 1.52 Å R-free 0.180 |
| 9Z3B Structure C-terminal human Mesothelin Peptide bound to MSLNB703 Fab 提交 2025-11-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
590–606（17 aa）
片段：C-terminal peptide (UNP residues 590-606)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG1500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.278 |
| 9Z3B Structure C-terminal human Mesothelin Peptide bound to MSLNB703 Fab 提交 2025-11-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
590–606（17 aa）
片段：C-terminal peptide (UNP residues 590-606)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG1500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.278 |
| 9Z3B Structure C-terminal human Mesothelin Peptide bound to MSLNB703 Fab 提交 2025-11-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
590–606（17 aa）
片段：C-terminal peptide (UNP residues 590-606)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG1500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.278 |
| 9Z3B Structure C-terminal human Mesothelin Peptide bound to MSLNB703 Fab 提交 2025-11-06 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
590–606（17 aa）
片段：C-terminal peptide (UNP residues 590-606)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG1500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.278 |