当前蛋白身份:Q15306
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21IE The MIDN Catch-IRF4 (A8S) fusion protein 提交 2025-12-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–226(22 aa)
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突变:A222M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;4%(v/v) tacsimate (pH 4.0) and 12%(w/v) PEG 3,350
|
分辨率 3.24 Å R-free 0.294 |
| 21IK The MIDN Catch-IRF4 (V2T) fusion protein 提交 2025-12-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
突变:V216T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;4% (v/v) tacsimate (pH 4.0) and 20% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3,350.
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.281 |
| 21IP The MIDN Catch-IRF4 (A8C) fusion protein 提交 2025-12-14 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
突变:A222C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;4% (v/v) tacsimate (pH 4.0) and 12% (w/v) PEG 3,350
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.291 |
| 2DLL Solution structure of the IRF domain of human interferon regulator factors 4 提交 2006-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
22–130(109 aa)
片段:IRF domain, residues 8-115
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;293 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成
1.23mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl;
1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6TD4 IRF4 DNA-binding domain surface entropy mutant apo structure 提交 2019-11-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
20–132(113 aa)
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突变:E45A E46A K47A C99A | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;25 % PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.5
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分辨率 1.71 Å R-free 0.245 |
| 7JM4 IRF Transcription Factor 提交 2020-07-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
21–129(109 aa)
链 B
21–129(109 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;10 % PEG 4000, 0.1 M Na acetate pH 4.6
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.205 |
| 7JM4 IRF Transcription Factor 提交 2020-07-31 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 G
21–129(109 aa)
链 H
21–129(109 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;10 % PEG 4000, 0.1 M Na acetate pH 4.6
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.205 |
| 7O56 X-ray Structure of Interferon Regulatory Factor 4 DNA binding domain bound to an interferon-stimulated response element solved by Phosphorus and Sulphur SAD methods 提交 2021-04-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
20–139(120 aa)
链 B
20–139(120 aa)
链 C
20–139(120 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.2;293 K;0.1M sodium acetate, 5% PEG 4000, 10mM EDTA
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分辨率 2.60 Å R-free 0.241 |
| 7OGS X-ray Structure of Interferon Regulatory Factor 4 DNA binding domain bound to an interferon-stimulated response element 提交 2021-05-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
20–139(120 aa)
链 B
20–139(120 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M Bis Tris pH 5.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.249 |
| 7OGS X-ray Structure of Interferon Regulatory Factor 4 DNA binding domain bound to an interferon-stimulated response element 提交 2021-05-07 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 E
20–139(120 aa)
链 F
20–139(120 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M Bis Tris pH 5.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.249 |
| 7OOT X-ray Structure of Interferon Regulatory Factor 4 DNA binding domain bound to an interferon-stimulated response element 提交 2021-05-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
20–139(120 aa)
链 B
20–139(120 aa)
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;0.1M Tris HCl pH 8.5, 30% PEG 4000, 0.2M lithium sulfate
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.238 |
| 9TOY Investigating the binding mechanism of Interferon Regulatory Factor 4 to DNA in the context of Multiple Myeloma 提交 2025-12-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
20–139(120 aa)
链 B
20–139(120 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;0.2M Calcium Acetate, 0.1M MES pH 6, 20% PEG 8000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 9TOY Investigating the binding mechanism of Interferon Regulatory Factor 4 to DNA in the context of Multiple Myeloma 提交 2025-12-17 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 D
20–139(120 aa)
链 F
20–139(120 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;0.2M Calcium Acetate, 0.1M MES pH 6, 20% PEG 8000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 9VE3 The MIDN Catch-IRF4 (V2L) fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
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突变:V216L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;2% (v/v) tacsimate (pH 5.0), 0.1 M sodium citrate, and 16% (w/v) PEG 3,350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.263 |
| 9VE4 The MIDN Catch-IRF4 fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;6% (v/v) tacsimate (pH 4.0) and 12% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3,350
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.281 |
| 9VE5 The MIDN Catch-IRF4 (V2Y) fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
突变:V216Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.15 M cesium chloride and 15% (w/v) PEG 3,350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.276 |
| 9VE6 The MIDN Catch-IRF4 (F6Y) fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
突变:F220Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;6% (v/v) tacsimate (pH 4.0) and 12% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3,350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 9VE7 The MIDN Catch-IRF4 (A8V) fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
突变:A222V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M sodium malonate (pH 4.0) and 12% (w/v) PEG 3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.254 |
| 9VE8 The MIDN Catch-IRF4 (A8L) fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
突变:A222L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;4% (v/v) tacsimate (pH 4.0) and 12% (w/v) PEG 3,350
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.274 |
| 9VEA The MIDN Catch-IRF4 (A8I) fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
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突变:A222I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M ammonium tartrate (pH 7.0) and 12% (w/v) PEG 3,350
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分辨率 3.60 Å R-free 0.272 |
| 9VEH The MIDN Catch-IRF4 (A8M) fusion protein 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
205–227(23 aa)
|
突变:A222M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M ammonium tartrate (pH 7.0) and 12% (w/v) PEG 3,350
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分辨率 2.00 Å R-free 0.287 |