当前蛋白身份：Q15843
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1NDD STRUCTURE OF NEDD8 提交 1998-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–76（76 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；pH 4.8
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.300 |
| 1NDD STRUCTURE OF NEDD8 提交 1998-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–76（76 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；pH 4.8
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.300 |
| 1NDD STRUCTURE OF NEDD8 提交 1998-08-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–76（76 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；pH 4.8
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.300 |
| 1NDD STRUCTURE OF NEDD8 提交 1998-08-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–76（76 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；pH 4.8
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.300 |
| 1NDD STRUCTURE OF NEDD8 提交 1998-08-21 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–76（76 aa）
链 B
1–76（76 aa）
链 C
1–76（76 aa）
链 D
1–76（76 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.8；pH 4.8
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.300 |
| 1R4M APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex 提交 2003-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG10K, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.280 |
| 1R4M APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex 提交 2003-10-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG10K, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.280 |
| 1R4M APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex 提交 2003-10-07 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG10K, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.280 |
| 1R4M APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex 提交 2003-10-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG10K, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.280 |
| 1R4N APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex with ATP 提交 2003-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–76（76 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；peg10k, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.290 |
| 1R4N APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex with ATP 提交 2003-10-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1–76（76 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；peg10k, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.290 |
| 1R4N APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex with ATP 提交 2003-10-07 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；peg10k, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.290 |
| 1R4N APPBP1-UBA3-NEDD8, an E1-ubiquitin-like protein complex with ATP 提交 2003-10-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–76（76 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；peg10k, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.290 |
| 1XT9 Crystal Structure of Den1 in complex with Nedd8 提交 2004-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；2M ammonium sulfate, 0.1M bicine, 4% tert-butanol, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 2BKR NEDD8 NEDP1 complex 提交 2005-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；CRYSTALS WERE GROWN BY SETTING-DROP METHOD BY MIXING THE NEDP1-NEDD8 COMPLEX (20MG/ML) WITH EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 20%PEG8000, 200MM NACL, 100MM PHOSPHATE CITRATE PH4.5, pH 4.50
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.209 |
| 2KO3 Nedd8 solution structure 提交 2009-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Nedd8-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N7K Unveiling the structural determinants of KIAA0323 binding preference for NEDD8 提交 2015-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–81（81 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成
0.15-1.5 mM [U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2NVU Structure of APPBP1-UBA3~NEDD8-NEDD8-MgATP-Ubc12(C111A), a trapped ubiquitin-like protein activation complex 提交 2006-11-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
1–76（76 aa）
链 J
1–76（76 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；291 K；17% v/v PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M Disodium tartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 7.00
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.274 |
| 3DBH Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.274 |
| 3DBH Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-05-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.274 |
| 3DBH Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-05-31 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.274 |
| 3DBH Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Ala-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-05-31 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.274 |
| 3DBL Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190wt-NEDD8Ala72Gln) 提交 2008-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–76（76 aa）
|
突变：A172Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.274 |
| 3DBL Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190wt-NEDD8Ala72Gln) 提交 2008-06-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1–76（76 aa）
|
突变：A172Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.274 |
| 3DBL Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190wt-NEDD8Ala72Gln) 提交 2008-06-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
突变：A172Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.274 |
| 3DBL Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190wt-NEDD8Ala72Gln) 提交 2008-06-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–76（76 aa）
|
突变：A172Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris, 0.4 M ammonium acetate, 9-10% PEG 10K, 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.274 |
| 3DBR Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Gln-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-06-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris, 0.2 M NaCl, 10% PEG 10K, 8% PEG400, 5 mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.280 |
| 3DBR Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Gln-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-06-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris, 0.2 M NaCl, 10% PEG 10K, 8% PEG400, 5 mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.280 |
| 3DBR Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Gln-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-06-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris, 0.2 M NaCl, 10% PEG 10K, 8% PEG400, 5 mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.280 |
| 3DBR Structural Dissection of a Gating Mechanism Preventing Misactivation of Ubiquitin by NEDD8's E1 (APPBP1-UBA3Arg190Gln-NEDD8Ala72Arg) 提交 2008-06-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–76（76 aa）
|
突变：A172R | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M Tris, 0.2 M NaCl, 10% PEG 10K, 8% PEG400, 5 mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.280 |
| 3DQV Structural Insights into NEDD8 Activation of Cullin-RING Ligases: Conformational Control of Conjugation 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–76（76 aa）
片段：NEDD8 C-terminus covalently linked to Cul5 Lys724
|
突变：L162M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；with ~19% PEG3350, 275mM (NH4)2PO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 3DQV Structural Insights into NEDD8 Activation of Cullin-RING Ligases: Conformational Control of Conjugation 提交 2008-07-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–76（76 aa）
片段：NEDD8 C-terminus covalently linked to Cul5 Lys724
|
突变：L162M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；with ~19% PEG3350, 275mM (NH4)2PO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 3DQV Structural Insights into NEDD8 Activation of Cullin-RING Ligases: Conformational Control of Conjugation 提交 2008-07-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–76（76 aa）
片段：NEDD8 C-terminus covalently linked to Cul5 Lys724
链 B
1–76（76 aa）
片段：NEDD8 C-terminus covalently linked to Cul5 Lys724
|
突变：L162M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L162M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；with ~19% PEG3350, 275mM (NH4)2PO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 3GZN Structure of NEDD8-activating enzyme in complex with NEDD8 and MLN4924 提交 2009-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 B39 [(1S,2S,4R)-4-{4-[(1S)-2,3-dihydro-1H-inden-1-ylamino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl}-2-hydroxycyclopentyl]methyl sulfamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
293 K；1.8 M tri-ammonium citrate pH 7.0, 4% (v/v) 1,3 butanediol, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 3GZN Structure of NEDD8-activating enzyme in complex with NEDD8 and MLN4924 提交 2009-04-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 B39 [(1S,2S,4R)-4-{4-[(1S)-2,3-dihydro-1H-inden-1-ylamino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl}-2-hydroxycyclopentyl]methyl sulfamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
293 K；1.8 M tri-ammonium citrate pH 7.0, 4% (v/v) 1,3 butanediol, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 4F8C Structure of the Cif:Nedd8 complex - Yersinia pseudotuberculosis Cycle Inhibiting Factor in complex with human Nedd8 提交 2012-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–81（81 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2.2M sodium malonate, 44mM bis-tris propane (pH 7.0), 66mM bis-tris propane (pH 8.0), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.235 |
| 4F8C Structure of the Cif:Nedd8 complex - Yersinia pseudotuberculosis Cycle Inhibiting Factor in complex with human Nedd8 提交 2012-05-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–81（81 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；2.2M sodium malonate, 44mM bis-tris propane (pH 7.0), 66mM bis-tris propane (pH 8.0), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.235 |
| 4FBJ Structure of the Cif:Nedd8 complex - Photorhabdus luminescens Cycle Inhibiting Factor in complex with human Nedd8 提交 2012-05-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–81（81 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；289 K；20% PEG 4000, 200mM sodium acetate, 100mM MES pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.236 |
| 4HCP crystal structure of Burkholderia pseudomallei effector protein chbp in complex with nedd8 提交 2012-10-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–76（76 aa）
片段：unp residues 1-76
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.5；293 K；1.5 M ammonium sulfate and 100 mM citrate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.267 |
| 4P5O Structure of an RBX1-UBC12~NEDD8-CUL1-DCN1 complex: a RING-E3-E2~ubiquitin-like protein-substrate intermediate trapped in action 提交 2014-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；11% PEG3350, 0.2M ammonium citrate, 10mM ATP
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.284 |
| 4P5O Structure of an RBX1-UBC12~NEDD8-CUL1-DCN1 complex: a RING-E3-E2~ubiquitin-like protein-substrate intermediate trapped in action 提交 2014-03-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 H
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；11% PEG3350, 0.2M ammonium citrate, 10mM ATP
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.284 |
| 6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5
100 mM NaCL
0.5 mM DTT
1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 6TTU Ubiquitin Ligation to substrate by a cullin-RING E3 ligase at 3.7A resolution: NEDD8-CUL1-RBX1 N98R-SKP1-monomeric b-TRCP1dD-IkBa-UB~UBE2D2 提交 2019-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7B5L Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27-UBE2L3~Ub~ARIH1. Transition State 1 提交 2020-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7B5N Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-UBE2L3~Ub~ARIH1. 提交 2020-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 N
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7ONI Structure of Neddylated CUL5 C-terminal region-RBX2-ARIH2* 提交 2021-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 N
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8B3G C(N)RL4CSA-UVSSA-E2-ubiquitin complex. 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8B3I CRL4CSA-E2-Ub (state 2) 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8CAF N8C_Fab3b in complex with NEDD8-CUL1(WHB) 提交 2023-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
1–76（76 aa）
片段：UNP residues 1-76
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0-2.1M Ammonium Sulfate, 0.1M Citrate pH 6.0, 10mM TCEP
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.263 |
| 8CAF N8C_Fab3b in complex with NEDD8-CUL1(WHB) 提交 2023-01-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
1–76（76 aa）
片段：UNP residues 1-76
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0-2.1M Ammonium Sulfate, 0.1M Citrate pH 6.0, 10mM TCEP
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.263 |
| 8H38 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3~N8-CSN(mutate) complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
|
分辨率 4.25 Å |
| 8Q7H Structure of CUL9-RBX1 ubiquitin E3 ligase complex in unneddylated and neddylated conformation - focused cullin dimer 提交 2023-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 N
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8WQC cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CDK5R1 提交 2023-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 8WQG cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.09 Å |
| 8WZN ParkinK211N in complex with phospho NEDD8 提交 2023-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–76（76 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M, MMT, 7.0, 25% w/v, PEG 1500
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.212 |
| 8WZO Parkin in complex with phospho NEDD8 提交 2023-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–76（76 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；0.02 M Sodium/potassium phosphate, 0.1 M Bis-Tris propane, 7.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.248 |
| 9E77 Cryo-EM structure of CSN-N8 in complex with CSN5i-3 提交 2024-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
1–81（81 aa）
|
未记录 | 6LT 3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9EFM Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-1 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 I
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9EFQ Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-2 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 I
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 9EFV Cryo-EM structure of CSN-N8CUL1 in complex with CSN5i-3 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 I
1–81（81 aa）
|
未记录 | 6LT 3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9EG1 COP9 signalosome deneddylation complex with cullin-5 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 I
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 9EG8 Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-4A 提交 2024-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 I
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9EGL Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-3 提交 2024-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 I
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.93 Å |
| 9QO0 Pre-activated 9-subunit COP9 signalosome and neddylated SCF (Skp1-Skp2-Cks1) complex structure 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric（15） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9QO1 Activated 9-subunit COP9 signalosome and neddylated SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex structure 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–76（76 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9SDX Structure of RBR binding E2 variant crosslinked with NEDD8-CUL5-RBX2 bound ARIH2 and Ub 提交 2025-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 N
1–81（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9T7V Structure of LRRC58-EloB/C-CDO1 in complex with NEDD8-CUL5-RBX2-ARIH2-Ub 提交 2025-11-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9UUM Cryo-EM structure of mezigdomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly 提交 2025-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.41 Å |
| 9V0A Cryo-EM structure of pomalidomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly 提交 2025-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.69 Å |
| 9V0B Cryo-EM structure of avadomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly 提交 2025-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.54 Å |
| 9V0F Cryo-EM structure of cemsidomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly 提交 2025-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 N
1–76（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.71 Å |