当前蛋白身份：Q16778
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
34–126（93 aa）
片段：UNP residues 34-126, 16-114
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.273 |
| 4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
34–126（93 aa）
片段：UNP residues 34-126, 16-114
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.273 |
| 4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
34–126（93 aa）
片段：UNP residues 34-126, 16-114
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.273 |
| 4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 | Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
34–126（93 aa）
片段：UNP residues 34-126, 16-114
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.273 |
| 6A7U Crystal structure of histone H2A.Bbd-H2B dimer 提交 2018-07-04 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.1M sodium citrate tribasic dihydrate pH5.5
38% PEG 200
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.263 |
| 6KBB Role of the DEF/Y motif of Swc5 in histone H2A.Z deposition 提交 2019-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
27–126（100 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1M sodium acetate tribasic dihydrate, pH 5.3, 19.5% PEG 1000
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.226 |
| 6KBB Role of the DEF/Y motif of Swc5 in histone H2A.Z deposition 提交 2019-06-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
27–126（100 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1M sodium acetate tribasic dihydrate, pH 5.3, 19.5% PEG 1000
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.226 |
| 6M4D Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6M4G Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6M4H Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7BXT The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with CENP-C peptide and CENP-N N-terminal domain 提交 2020-04-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7EA8 Human SETD2 bound to a nucleosome containing oncohistone mutations 提交 2021-03-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–126（125 aa）
链 H
2–126（125 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7U0G structure of LIN28b nucleosome bound 3 OCT4 提交 2022-02-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7U0I Structure of LIN28b nucleosome bound 2 OCT4 提交 2022-02-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7U0J Structure of 162bp LIN28b nucleosome 提交 2022-02-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8DK5 Structure of 187bp LIN28b nucleosome with site 0 mutation 提交 2022-07-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.71 Å |
| 8EVG 162bp CX3CR1 nucleosome (further classified with better nucleosome end) 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 8EVH CX3CR1 nucleosome and wild type PU.1 complex 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |
| 8EVI CX3CR1 nucleosome and PU.1 complex containing disulfide bond mutations 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 8EVJ CX3CR1 nucleosome bound PU.1 and C/EBPa 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8H1T Cryo-EM structure of BAP1-ASXL1 bound to chromatosome 提交 2022-10-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8SPS High resolution structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site a and site b 提交 2023-05-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8SPU Structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site c 提交 2023-05-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8SYP Genomic CX3CR1 nucleosome 提交 2023-05-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126（126 aa）
链 H
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
34–124（91 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 7 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.236 |
| 8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 a
34–124（91 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 14 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.236 |
| 8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
34–124（91 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 17 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.206 |
| 8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 a
34–124（91 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 19 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.206 |
| 8UQA Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 12-residue linker 提交 2023-10-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
34–124（91 aa）
|
突变：C85K in UbcH5c | NA SODIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.0 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 8UQB Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 1) 提交 2023-10-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
34–124（91 aa）
|
突变：C85K in UbcH5c | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 50 mM BIS-TRIS propane, pH 7.0, 1 M NaCl
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.260 |
| 8UQC Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 2) 提交 2023-10-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
34–124（91 aa）
|
突变：C85K in UbcH5c | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.252 |
| 8UQD Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (condition 2. RING not modeled in density) 提交 2023-10-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
34–124（91 aa）
|
突变：C85K in UbcH5c | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350
|
分辨率 3.89 Å R-free 0.322 |
| 8UQE Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 26-residue linker (RING not modeled in density) 提交 2023-10-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
34–124（91 aa）
|
突变：S22R,C85K in UbcH5c | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (10 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.0 M sodium acetate
|
分辨率 3.56 Å R-free 0.268 |
| 8YJF Structure of human SPT16 MD-CTD and MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer and an H2A-H2B dimer 提交 2024-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
1–126（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5, 12% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 4.40 Å R-free 0.312 |
| 9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–126（125 aa）
链 T
2–126（125 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9GE4 CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–126（125 aa）
链 T
2–126（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 9GEL CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 T
2–126（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.86 Å |
| 9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–126（125 aa）
链 T
2–126（125 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9GF6 CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–126（125 aa）
链 T
2–126（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–126（125 aa）
链 T
2–126（125 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.55 Å |
| 9GFM CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 P
31–126（96 aa）
链 T
32–124（93 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric（17） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–126（125 aa）
链 H
2–126（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.50 Å |
| 9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric（17） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–126（125 aa）
链 H
2–126（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.63 Å |
| 9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric（16） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–126（125 aa）
链 H
2–126（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.77 Å |
| 9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–126（125 aa）
链 H
2–126（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.43 Å |
| 9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–126（125 aa）
链 H
2–126（125 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.45 Å |