当前蛋白身份：Q53G59
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2VPJ Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 提交 2008-02-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
268–567（300 aa）
片段：KELCH DOMAIN, RESIDUES 268-567
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE PH4.6, 30% PEG4K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.222 |
| 6TTK Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with DVL1 peptide 提交 2019-12-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
268–567（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；30% PEG4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M acetate pH 4.6
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.251 |
| 6TTK Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with DVL1 peptide 提交 2019-12-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
268–567（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；30% PEG4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M acetate pH 4.6
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.251 |
| 6TTK Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with DVL1 peptide 提交 2019-12-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
268–567（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；30% PEG4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M acetate pH 4.6
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.251 |
| 6TTK Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with DVL1 peptide 提交 2019-12-27 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
268–567（300 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；30% PEG4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M acetate pH 4.6
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.251 |
| 6V7O Structural Elucidation of Peptide Binding to KLHL-12, a Substrate Specific Adapter Protein in a Cul3-Ring E3 Ligase Complex 提交 2019-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
268–567（300 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；Sodium cacodylate, Sodium citrate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 6V7O Structural Elucidation of Peptide Binding to KLHL-12, a Substrate Specific Adapter Protein in a Cul3-Ring E3 Ligase Complex 提交 2019-12-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
268–567（300 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；Sodium cacodylate, Sodium citrate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 8OIO Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with PLEKHA4 peptide 提交 2023-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
268–567（300 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；0.1 M citrate pH 5.5, 0.4 M NaCl,
27,1% PEG8K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 8OIO Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with PLEKHA4 peptide 提交 2023-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
268–567（300 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；0.1 M citrate pH 5.5, 0.4 M NaCl,
27,1% PEG8K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 8OIO Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with PLEKHA4 peptide 提交 2023-03-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
268–567（300 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；0.1 M citrate pH 5.5, 0.4 M NaCl,
27,1% PEG8K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 8OIO Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with PLEKHA4 peptide 提交 2023-03-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
268–567（300 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；0.1 M citrate pH 5.5, 0.4 M NaCl,
27,1% PEG8K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 8RBH Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with PEF1 peptide 提交 2023-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
268–567（300 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 200 mM NaCl, and 30% PEG4K. (1:1)
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.258 |
| 8RBH Crystal structure of the kelch domain of human KLHL12 in complex with PEF1 peptide 提交 2023-12-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
268–567（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 200 mM NaCl, and 30% PEG4K. (1:1)
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.258 |
| 9Y8J Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 1 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTS 2-(1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-(2-fluorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.329 |
| 9Y8K Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 7k 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTR 2-(2-amino-4-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-(2,4,6-trichlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.191 |
| 9Y8L Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 8e 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTQ 2-(2-amino-5,6-dimethyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-(2,4,6-trichlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.193 |
| 9Y8M Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 8i 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTE 2-(2-amino-5-fluoro-4-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-(2,4,6-trichlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.178 |
| 9Y8N Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 8m 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTL 2-(4-methyl-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-1-yl)-N-(2,4,6-trichlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.204 |
| 9Y8O Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 9c 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTM 2-(2-amino-4-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-[2,6-dichloro-4-(phenoxyacetyl)phenyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.177 |
| 9Y8Q Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 9e 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
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未记录 | A1CTO 2-(2-amino-4-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-(2,6-dichloro-4-{[(propan-2-yl)oxy]methyl}phenyl)acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.152 |
| 9Y8R Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 9h 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTP 2-(2-amino-4-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-[2-chloro-4-(hydroxymethyl)-3-methylphenyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.173 |
| 9Y8S Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 9k 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTN 4-[2-(2-amino-4-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)acetamido]-N-benzyl-3-chloro-2-methylbenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.170 |
| 9Y8T Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 10b 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTJ 2-{2-amino-4-[(morpholin-4-yl)methyl]-1H-1,3-benzimidazol-1-yl}-N-(2,4,6-trichlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.208 |
| 9Y8U Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 10j 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTK 2-(4-{[(3S)-3-(4-cyanopiperidin-1-yl)pyrrolidin-1-yl]methyl}-2-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)-N-(2,4,6-trichlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.141 |
| 9Y8V Crystal structure of the Kelch domain of human KLHL12 with compound 10q 提交 2025-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
279–567（289 aa）
|
未记录 | A1CTF 2-{4-[(1R,2S)-2-{[(3S)-3-(1,1-dioxo-1lambda~6~-thiomorpholin-4-yl)pyrrolidin-1-yl]methyl}cyclopropyl]-2-methyl-1H-1,3-benzimidazol-1-yl}-N-(2,4,6-trichlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 5.5, 0.2M MgCl2 and 25% PEG3350
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.199 |