当前蛋白身份：Q5T2W1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2EEI Solution Structure of Second PDZ domain of PDZ Domain Containing Protein 1 提交 2007-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
132–224（93 aa）
片段：pdz domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
3.36mM PDZ domain U-13C,15N; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D20, 90% H2O | 10% D20, 90% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2EEJ Solution Structure of Fourth PDZ domain of PDZ Domain Containing Protein 1 提交 2007-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
376–458（83 aa）
片段：PDZ domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
2.65mM PDZ domain U-13C,15N; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D20, 90% H2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2VSP Crystal structure of the fourth PDZ domain of PDZ domain-containing protein 1 提交 2008-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
375–459（85 aa）
片段：FOURTH PDZ DOMAIN, RESIDUES 375-459
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
50% PEG 300; 0.20M NACL; 0.1M NA/K-PO4 PH 6.2
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分辨率 2.41 Å R-free 0.267 |
| 2VSP Crystal structure of the fourth PDZ domain of PDZ domain-containing protein 1 提交 2008-04-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
375–459（85 aa）
片段：FOURTH PDZ DOMAIN, RESIDUES 375-459
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
50% PEG 300; 0.20M NACL; 0.1M NA/K-PO4 PH 6.2
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.267 |
| 2VSP Crystal structure of the fourth PDZ domain of PDZ domain-containing protein 1 提交 2008-04-28 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
375–459（85 aa）
片段：FOURTH PDZ DOMAIN, RESIDUES 375-459
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
50% PEG 300; 0.20M NACL; 0.1M NA/K-PO4 PH 6.2
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分辨率 2.41 Å R-free 0.267 |
| 2VSP Crystal structure of the fourth PDZ domain of PDZ domain-containing protein 1 提交 2008-04-28 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
375–459（85 aa）
片段：FOURTH PDZ DOMAIN, RESIDUES 375-459
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
50% PEG 300; 0.20M NACL; 0.1M NA/K-PO4 PH 6.2
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分辨率 2.41 Å R-free 0.267 |
| 3TMH Crystal structure of dual-specific A-kinase anchoring protein 2 in complex with cAMP-dependent protein kinase A type II alpha and PDZK1 提交 2011-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
375–459（85 aa）
片段：UNP RESIDUES 375-459
链 E
375–459（85 aa）
片段：UNP RESIDUES 375-459
链 I
375–459（85 aa）
片段：UNP RESIDUES 375-459
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 7；293 K；100 mM HEPES, pH 7, 20% PEG MME, Microbatch, temperature 293K
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分辨率 3.80 Å R-free 0.328 |
| 4Q2P NHERF3 PDZ2 in Complex with a Phage-Derived Peptide 提交 2014-04-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
132–215（84 aa）
片段：unp residues 132-215
链 B
132–215（84 aa）
片段：unp residues 132-215
链 C
132–215（84 aa）
片段：unp residues 132-215
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未记录 | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；292 K；30% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 0.1 M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
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分辨率 2.05 Å R-free 0.252 |
| 6EZI PDZK1 domain 4 in complex with C-terminal peptide of human PepT2. 提交 2017-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
374–460（87 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292.15 K；0.1 M Trisodium citrate pH 6.45
20% PEG 4000
20 %(v/v) isopropanol
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分辨率 1.50 Å R-free 0.214 |
| 9RXN Structure of the PDZ1 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6–106（101 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293 K；50 mM Bicine pH 8.4,
12% PEG 600,
3.5% PEG 2000 MME
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.161 |
| 9RXN Structure of the PDZ1 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
6–106（101 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293 K；50 mM Bicine pH 8.4,
12% PEG 600,
3.5% PEG 2000 MME
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.161 |
| 9RXO Structure of the PDZ2 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
131–215（85 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；26% PEG 1500
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.203 |
| 9RXO Structure of the PDZ2 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
131–215（85 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；26% PEG 1500
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.203 |
| 9RXP Structure of the PDZ4 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
375–458（84 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1% 2-methyl-2,4-pentanediol,
2.5 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.231 |
| 9RXP Structure of the PDZ4 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (KSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
375–458（84 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1% 2-methyl-2,4-pentanediol,
2.5 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.231 |
| 9RXR Structure of the PDZ1 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (VLKSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6–106（101 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM MES, pH 6.5,
700 mM NaCl,
18% PEG 4000
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.210 |
| 9RXS Structure of the PDZ4 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (VLKSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
375–458（84 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5, 100mM NaCl, 18% PEG 10000, 20% Glycerol
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分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 9RXS Structure of the PDZ4 domain from human PDZK1 (NHERF3) with the C-terminal residues (VLKSTQF) of human URAT1 transporter (SLC22A12) 提交 2025-07-11 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
375–458（84 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5, 100mM NaCl, 18% PEG 10000, 20% Glycerol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |