当前蛋白身份:Q7Z3B4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4JNU Crystal structure of the human Nup57CCS3* coiled-coil segment, space group P21 提交 2013-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 B
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 C
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 D
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;294 K;0.1 M sodium acetate, pH 5.3, 1.9 M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.218 |
| 4JNV Crystal structure of the human Nup57CCS3* coiled-coil segment, space group C2 提交 2013-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 B
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 C
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 D
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;294 K;0.1 M sodium acetate, pH 5.3, 1.9 M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.277 |
| 4JO7 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* Nup57CCS3* complex with 2:2 stoichiometry 提交 2013-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 D
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1 M MES, pH 6.5, 6.7% PEG20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.214 |
| 4JO7 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* Nup57CCS3* complex with 2:2 stoichiometry 提交 2013-03-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 F
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 H
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1 M MES, pH 6.5, 6.7% PEG20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.214 |
| 4JO9 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* Nup57CCS3* complex 1:2 stoichiometry 提交 2013-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
链 C
453–491(39 aa)
片段:UNP residues 453-491
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 3.8;294 K;0.1 M sodium citrate, pH 3.8, 0.07 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, temperature 294.0K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.294 |
| 5IJN Composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (32 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 208 PDB 声明:208-meric(208) 与蛋白数一致 |
链 F
1–507(507 aa)
链 L
1–507(507 aa)
链 R
1–507(507 aa)
链 X
1–507(507 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 21.40 Å |
| 5IJO Alternative composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (16 copies of Nup188, 16 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 208 PDB 声明:208-meric(208) 与蛋白数一致 |
链 F
1–507(507 aa)
链 L
1–507(507 aa)
链 R
1–507(507 aa)
链 X
1–507(507 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 21.40 Å |
| 7PER Model of the inner ring of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 192 PDB 声明:192-meric(192) 与蛋白数一致 |
链 F
1–507(507 aa)
链 L
1–507(507 aa)
链 R
1–507(507 aa)
链 X
1–507(507 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
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分辨率 35.00 Å |
| 7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致 |
链 H0
1–507(507 aa)
链 H1
1–507(507 aa)
链 H2
1–507(507 aa)
链 H3
1–507(507 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 50.00 Å |
| 7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致 |
链 H0
1–507(507 aa)
链 H1
1–507(507 aa)
链 H2
1–507(507 aa)
链 H3
1–507(507 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 12.00 Å |