当前蛋白身份:Q92556 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2RQR The solution structure of human DOCK2 SH3 domain - ELMO1 peptide chimera complex 提交 2009-10-21 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 697–722(26 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 ambient
NMR样品组成 1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 20mM [U-2H] TRIS-2, 100mM sodium chloride-3, 0.02% sodium azide-4, 1mM [U-2H] DTT-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2VSZ Crystal Structure of the ELMO1 PH domain 提交 2008-05-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 532–675(144 aa) 片段:PLECKSTRIN HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 532-675
链 B 532–675(144 aa) 片段:PLECKSTRIN HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 532-675
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.75;2.1 M SODIUM MALONATE [PH 6.75]
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
3A98 Crystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1 提交 2009-10-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 532–727(196 aa) 片段:C-terminal domains, PH domain, residues 532-727
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;12% PEG 3350, 0.1M di-ammonium hydrogen citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.268
3A98 Crystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1 提交 2009-10-21 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 532–727(196 aa) 片段:C-terminal domains, PH domain, residues 532-727
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;12% PEG 3350, 0.1M di-ammonium hydrogen citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.268
6JPP Solution structure of ELMO1 RBD 提交 2019-03-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–113(113 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Elmo1 RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6TGB CryoEM structure of the binary DOCK2-ELMO1 complex 提交 2019-11-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6TGC CryoEM structure of the ternary DOCK2-ELMO1-RAC1 complex. 提交 2019-11-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–727(727 aa)
链 E 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7DPA Cryo-EM structure of the human ELMO1-DOCK5-Rac1 complex 提交 2020-12-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–727(727 aa)
链 F 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–82(82 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
分辨率 1.60 Å R-free 0.235
7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–82(82 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
分辨率 1.60 Å R-free 0.235
7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 1–82(82 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
分辨率 1.60 Å R-free 0.235
7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 1–82(82 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
分辨率 1.60 Å R-free 0.235
8JHK Cryo-EM structure of the DOCK5/ELMO1 complex, focused on one protomer 提交 2023-05-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.76 Å
8XM7 Cryo-EM structure of the RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 complex: RhoG/DOCK5/ELMO1 focused map 提交 2023-12-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.91 Å
8ZJ2 Cryo-EM structure of the RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 complex 提交 2024-05-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
链 E 1–727(727 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
8ZJI Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 1) 提交 2024-05-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
链 D 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.23 Å
8ZJJ Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 2) 提交 2024-05-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
链 D 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.23 Å
8ZJK Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 3) 提交 2024-05-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
链 D 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.23 Å
8ZJL Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 4) 提交 2024-05-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
链 D 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.31 Å
8ZJM Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 5) 提交 2024-05-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
链 D 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.52 Å
9LX0 DOCK5/ELMO1 complex with RhoG and Rac1 on lipid membrane 提交 2025-02-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
链 E 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.98 Å
9LXH DOCK5/ELMO1 complex with RhoG and Rac1 on lipid membrane 提交 2025-02-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–727(727 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.52 Å