当前蛋白身份:Q92785 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3IUF Crystal structure of the C2H2-type zinc finger domain of human ubi-d4 提交 2009-08-31 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 203–249(47 aa) 片段:UNP residues 203-251
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 9.5;291 K;30% PEG 3000, 0.1M CHES, protein concentration 5mg/mL., pH 9.5, vapor diffusion, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
5B79 Crystal structure of DPF2 double PHD finger 提交 2016-06-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 270–391(122 aa) 片段:UNP residues 270-391
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;ammonium citrate tribasic, Bis-Tris propane
分辨率 2.60 Å R-free 0.238
5VDC Crystal structure of the human DPF2 tandem PHD finger domain 提交 2017-04-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 270–391(122 aa) 片段:DPF2 tandem PHD finger domain (UNP residues 270-391)
未记录 ZN ZINC ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;2.2 M Ammonium sulfate, 0.15 M Ammonium citrate
分辨率 1.60 Å R-free 0.191
6LTH Structure of human BAF Base module 提交 2020-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 R 1–391(391 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 R 1–100(100 aa) 片段:UNP residues 1-100, UNP residues 209-391
链 R 209–391(183 aa) 片段:UNP residues 1-100, UNP residues 209-391
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 R 1–391(391 aa)
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 R 1–391(391 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 R 1–391(391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 R 1–391(391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å