当前蛋白身份:Q96EE3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5A9Q Human nuclear pore complex 提交 2015-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 304 PDB 声明:304-meric(304) 与蛋白数一致
链 7 1–360(360 aa)
链 G 1–360(360 aa)
链 P 1–360(360 aa)
链 Y 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE;pH 7.5;20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
分辨率 23.00 Å
7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 288 PDB 声明:288-meric(288) 与蛋白数一致
链 AG 1–360(360 aa)
链 BG 1–360(360 aa)
链 CG 1–360(360 aa)
链 DG 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 O0 1–360(360 aa)
链 O1 1–360(360 aa)
链 O2 1–360(360 aa)
链 O3 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 O0 1–360(360 aa)
链 O1 1–360(360 aa)
链 O2 1–360(360 aa)
链 O3 1–360(360 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 E 1–421(421 aa)
链 F 1–421(421 aa)
链 G 1–421(421 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 E 1–421(421 aa)
链 F 1–421(421 aa)
链 G 1–421(421 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 E 1–421(421 aa)
链 F 1–421(421 aa)
链 G 1–421(421 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9LVJ Cryo-EM structure of Sestrin2 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 E 1–421(421 aa)
链 F 1–421(421 aa)
链 G 1–421(421 aa)
链 O 1–421(421 aa)
链 P 1–421(421 aa)
链 Q 1–421(421 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9LVK Cryo-EM structure of CASTOR1 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 E 1–421(421 aa)
链 F 1–421(421 aa)
链 G 1–421(421 aa)
链 O 1–421(421 aa)
链 P 1–421(421 aa)
链 Q 1–421(421 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 31 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9LWF Cryo-EM structure of dual sensor bound GATOR2 complex 提交 2025-02-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 E 1–421(421 aa)
链 F 1–421(421 aa)
链 G 1–421(421 aa)
链 O 1–421(421 aa)
链 P 1–421(421 aa)
链 Q 1–421(421 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 32 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
9OTI GATOR2 complex bound to arginine sensor CASTOR1 提交 2025-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 E 1–360(360 aa)
链 F 1–360(360 aa)
链 G 1–360(360 aa)
链 O 1–360(360 aa)
链 P 1–360(360 aa)
链 Q 1–360(360 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 29 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å