当前蛋白身份:Q96ST2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6EMR Solution structure of the LEDGF/p75 IBD - IWS1 (aa 446-548) complex 提交 2017-10-03 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
239–341(103 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)200;压力 arbitrary
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] LEDGF/p75 IBD-IWS1, 50 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 6ZV1 TFIIS N-terminal domain (TND) from human IWS1 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
550–692(143 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)225;压力 1
NMR样品组成
0.6 mM [U-13C; U-15N] IWS1, 25 mM [U-2H] TRIS, 300 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6ZV4 Human TFIIS N-terminal domain in complex with IWS1 提交 2020-07-23 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
122–146(25 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)225;压力 1
NMR样品组成
0.35 mM [U-13C; U-15N] TFIIS-IWS1, 25 mM [U-2H] TRIS, 200 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致 |
链 O
2–819(818 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |
| 9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致 |
链 O
2–819(818 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致 |
链 O
2–819(818 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致 |
链 O
2–819(818 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致 |
链 O
554–685(132 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致 |
链 O
2–819(818 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物一致 |
链 i
1–819(819 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.40 Å |
| 9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致 |
链 a
2–819(818 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.01 Å |