当前蛋白身份:Q99638 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3A1J Crystal structure of the human Rad9-Hus1-Rad1 complex 提交 2009-04-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–266(266 aa) 片段:N-terminal domain, residues 1-266
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;296 K;15% PEG 3350, 0.18M KCl, 0.16M guanidine hydrochloride, 0.33M ZWITTERGENT 3-08, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.50 Å R-free 0.282
3G65 Crystal Structure of the Human Rad9-Rad1-Hus1 DNA Damage Checkpoint Complex 提交 2009-02-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–270(270 aa) 片段:UNP residues 1-270
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M Tris-HCl, 17% PEG 2000-Mme, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3GGR Crystal Structure of the Human Rad9-Hus1-Rad1 complex 提交 2009-03-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–270(270 aa) 片段:truncated hRad9 (residues 1-270)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;289 K;8% PEG 2000 MME, 100mM Tris-HCl,200mM Trimethylamine N-oxide dihydrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.20 Å R-free 0.306
6HM5 Crystal structure of TOPBP1 BRCT0,1,2 in complex with a RAD9 phosphopeptide 提交 2018-09-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 380–390(11 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287.15 K;100 mM bicine/Trizma base pH 8.5, 300 mM diethyleneglycol, 300 mM triethyleneglycol, 300 mM tetraethyleneglycol, 300 mM pentaethyleneglycol, 10% w/v PEG 20000 and 20% v/v PEG MME 550
分辨率 2.33 Å R-free 0.241
6J8Y Crystal structure of the human RAD9-HUS1-RAD1-RHINO complex 提交 2019-01-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–270(270 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG 3350, Sodium citrate, Bis-tris propane pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.258
7Z6H Structure of DNA-bound human RAD17-RFC clamp loader and 9-1-1 checkpoint clamp 提交 2022-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 A 1–391(391 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.59 Å
8GNN Crystal structure of the human RAD9-RAD1-HUS1-RAD17 complex 提交 2022-08-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–270(270 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;Bis-Tris propane pH 7.5, sodium citrate, PEG 3350
分辨率 2.12 Å R-free 0.263
8JZY RPA70N-RAD9 fusion 提交 2023-07-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 296–314(19 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;PEG 3350, sodium phosphate
分辨率 1.50 Å R-free 0.200
8WU8 Crystal structure of the human RAD9-RAD1(F64A/M256A/F266A)-HUS1-RHINO(88-99) complex 提交 2023-10-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–270(270 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG 3350, Potassium iodine
分辨率 2.81 Å R-free 0.267