当前蛋白身份:Q9BVL2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4JO7 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* Nup57CCS3* complex with 2:2 stoichiometry 提交 2013-03-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 341–428(88 aa) 片段:UNP residues 341-428
链 C 341–428(88 aa) 片段:UNP residues 341-428
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1 M MES, pH 6.5, 6.7% PEG20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K
分辨率 1.75 Å R-free 0.214
4JO7 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* Nup57CCS3* complex with 2:2 stoichiometry 提交 2013-03-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 341–428(88 aa) 片段:UNP residues 341-428
链 G 341–428(88 aa) 片段:UNP residues 341-428
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1 M MES, pH 6.5, 6.7% PEG20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K
分辨率 1.75 Å R-free 0.214
4JO9 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* Nup57CCS3* complex 1:2 stoichiometry 提交 2013-03-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 341–426(86 aa) 片段:UNP residues 341-426
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 3.8;294 K;0.1 M sodium citrate, pH 3.8, 0.07 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, temperature 294.0K
分辨率 2.50 Å R-free 0.294
4JQ5 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* coiled-coil segment 提交 2013-03-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 B 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 C 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 D 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;294 K;10% glycerol, 28% dioxane, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K
分辨率 2.19 Å R-free 0.293
4JQ5 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* coiled-coil segment 提交 2013-03-20 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 F 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 G 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 H 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;294 K;10% glycerol, 28% dioxane, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K
分辨率 2.19 Å R-free 0.293
4JQ5 Crystal structure of the human Nup49CCS2+3* coiled-coil segment 提交 2013-03-20 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 I 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 J 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 K 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
链 L 341–425(85 aa) 片段:UNP residues 341-425
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;294 K;10% glycerol, 28% dioxane, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K
分辨率 2.19 Å R-free 0.293
5IJN Composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (32 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 208 PDB 声明:208-meric(208) 与蛋白数一致
链 G 1–599(599 aa)
链 M 1–599(599 aa)
链 S 1–599(599 aa)
链 Y 1–599(599 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 21.40 Å
5IJO Alternative composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (16 copies of Nup188, 16 copies of Nup205) 提交 2016-03-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 208 PDB 声明:208-meric(208) 与蛋白数一致
链 G 1–599(599 aa)
链 M 1–599(599 aa)
链 S 1–599(599 aa)
链 Y 1–599(599 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 21.40 Å
7PER Model of the inner ring of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 192 PDB 声明:192-meric(192) 与蛋白数一致
链 G 1–599(599 aa)
链 M 1–599(599 aa)
链 S 1–599(599 aa)
链 Y 1–599(599 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
分辨率 35.00 Å
7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 I0 1–599(599 aa)
链 I1 1–599(599 aa)
链 I2 1–599(599 aa)
链 I3 1–599(599 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 50.00 Å
7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 808 PDB 声明:808-meric(808) 与蛋白数一致
链 I0 1–599(599 aa)
链 I1 1–599(599 aa)
链 I2 1–599(599 aa)
链 I3 1–599(599 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å