当前蛋白身份：Q9C000
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1PN5 NMR structure of the NALP1 Pyrin domain (PYD) 提交 2003-06-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–93（93 aa）
片段：Pyrin domain (PYD)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；压力 1
NMR样品组成
1mM NALP1 PYD U-15N,13C; 50mM Na / PO4 - Buffer; 50mM NaCl; 1mM CHAPS; 20mM DTT (D10); 0.02% NaN3; 0.1mM EDTA; protease inhibitor cocktail (Complete, Roche); 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3KAT Crystal Structure of the CARD domain of the human NLRP1 protein, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR3486E 提交 2009-10-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1371–1467（97 aa）
片段：CARD domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5) . Reservoir solution: 18% PEG3350 and 150 mM sodium formate., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.260 |
| 3KAT Crystal Structure of the CARD domain of the human NLRP1 protein, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR3486E 提交 2009-10-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1371–1467（97 aa）
片段：CARD domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5) . Reservoir solution: 18% PEG3350 and 150 mM sodium formate., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.260 |
| 4IFP X-ray Crystal Structure of Human NLRP1 CARD Domain 提交 2012-12-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1335–1418（84 aa）
片段：NLRP1-CARD
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；1.4 M Malonate, 100 mM HEPES 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.208 |
| 4IFP X-ray Crystal Structure of Human NLRP1 CARD Domain 提交 2012-12-14 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1335–1418（84 aa）
片段：NLRP1-CARD
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；1.4 M Malonate, 100 mM HEPES 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.208 |
| 4IFP X-ray Crystal Structure of Human NLRP1 CARD Domain 提交 2012-12-14 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1335–1418（84 aa）
片段：NLRP1-CARD
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；1.4 M Malonate, 100 mM HEPES 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.208 |
| 4IM6 LRR domain from human NLRP1 提交 2013-01-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
791–990（200 aa）
片段：LRR domain (UNP Residues 791-990)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris pH 8.0, 0.02 M MgCl2, 25 % (w/v) PAA 5100, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.183 |
| 4IM6 LRR domain from human NLRP1 提交 2013-01-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
791–990（200 aa）
片段：LRR domain (UNP Residues 791-990)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris pH 8.0, 0.02 M MgCl2, 25 % (w/v) PAA 5100, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.183 |
| 5Y3S Crystal structure of human NLRP1 leucine rich repeat domain 提交 2017-07-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
790–990（201 aa）
片段：UNP residues 790-990
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.6M Sodium Potassium Phosphate, 100mM HEPES, pH 6.4
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.259 |
| 5Y3S Crystal structure of human NLRP1 leucine rich repeat domain 提交 2017-07-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
790–990（201 aa）
片段：UNP residues 790-990
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.6M Sodium Potassium Phosphate, 100mM HEPES, pH 6.4
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.259 |
| 5Y3S Crystal structure of human NLRP1 leucine rich repeat domain 提交 2017-07-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
790–990（201 aa）
片段：UNP residues 790-990
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.6M Sodium Potassium Phosphate, 100mM HEPES, pH 6.4
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.259 |
| 5Y3S Crystal structure of human NLRP1 leucine rich repeat domain 提交 2017-07-30 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
790–990（201 aa）
片段：UNP residues 790-990
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.6M Sodium Potassium Phosphate, 100mM HEPES, pH 6.4
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.259 |
| 6K7V Structure of NLRP1 CARD filament 提交 2019-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1379–1466（88 aa）
链 B
1379–1466（88 aa）
链 C
1379–1466（88 aa）
链 D
1379–1466（88 aa）
链 E
1379–1466（88 aa）
链 F
1379–1466（88 aa）
链 G
1379–1466（88 aa）
链 H
1379–1466（88 aa）
链 I
1379–1466（88 aa）
链 J
1379–1466（88 aa）
链 K
1379–1466（88 aa）
链 L
1379–1466（88 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.285 |
| 6X6A Cryo-EM structure of NLRP1-DPP9 complex 提交 2020-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–1212（1212 aa）
链 C
1213–1473（261 aa）
链 E
1–1212（1212 aa）
链 F
1213–1473（261 aa）
链 G
1213–1473（261 aa）
链 I
1213–1473（261 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6X6C Cryo-EM structure of NLRP1-DPP9-VbP complex 提交 2020-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–1473（1473 aa）
链 F
1–1473（1473 aa）
|
未记录 | GK2 [(2~{R})-1-[(2~{R})-2-azanyl-3-methyl-butanoyl]pyrrolidin-2-yl]boronic acid × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6XKK Cryo-EM structure of the NLRP1-CARD filament 提交 2020-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric（44） 与蛋白数一致 |
链 A
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 B
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 C
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 D
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 E
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 F
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 G
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 H
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 I
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 J
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 K
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 L
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 M
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 N
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 O
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 P
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 Q
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 R
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 S
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 T
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 U
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 V
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 a
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 b
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 c
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 d
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 e
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 f
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 g
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 h
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 i
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 j
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 k
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 l
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 m
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 n
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 o
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 p
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 q
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 r
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 s
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 t
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 u
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
链 v
1305–1399（95 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 1305-1399)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 7WGE Human NLRP1 complexed with thioredoxin 提交 2021-12-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
95–994（900 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8ZGD The Crystal Structure of the NLRP1_LRR domain from Biortus. 提交 2024-05-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
791–990（200 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20mM MgCl2, 0.1M Tris pH 8.0, 19% polyacrylic acid 5100
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.221 |
| 9BJ9 Human CRL-2 ZYG11B binding to human NLRP1 Gly/N degron 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
131–139（9 aa）
片段：residues 131-139 (Uniprot numbering)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |