当前蛋白身份：Q9HBE5
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 6 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 7 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18 | Assembly 8 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
20–232（213 aa）
片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
20–232（213 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5
Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.275 |
| 4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
20–232（213 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 5 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5
Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.275 |
| 4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
20–232（213 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5
Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.275 |
| 4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
20–232（213 aa）
链 B
20–232（213 aa）
链 C
20–232（213 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 6 NA SODIUM ION × 10 CL CHLORIDE ION × 22 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5
Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.275 |
| 6PLH FAB fragment complexed with C-mannosylated tryptophan peptide 提交 2019-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
202–232（31 aa）
片段：UNP Residues 202-232
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% (w/v) polyethylene glycol 1500, 0.1 M succinate-phosphate-glycine, pH 7.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.221 |
| 7KQ7 Crystal structure of IL21R in complex with an antibody Fab fragment 提交 2020-11-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
20–233（214 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；10% PEG MME 5000 and 0.1M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.240 |
| 8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
20–229（210 aa）
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.300 |
| 8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
20–229（210 aa）
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.300 |
| 8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
20–229（210 aa）
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.300 |
| 8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
20–229（210 aa）
|
突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.300 |
| 9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
20–228（209 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |
| 9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
20–228（209 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |
| 9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
20–228（209 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |
| 9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
20–228（209 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |