当前蛋白身份:Q9NV88
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
582–658(77 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 582-658)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
582–658(77 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 582-658)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
582–658(77 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 582-658)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
582–658(77 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 582-658)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 7BFP Structure of the Integrator cleavage module with INTS4/9/11 提交 2021-01-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–658(658 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8;150 mM KCl, 20 mM HEPES-KOH pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 7BFQ Structure of the Integrator cleavage module with extended INTS4 and rigid body docked INTS9/11 CTD 提交 2021-01-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–658(658 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.15 Å |
| 7CUN The structure of human Integrator-PP2A complex 提交 2020-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 I
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7PKS Structural basis of Integrator-mediated transcription regulation 提交 2021-08-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:31-meric(31) 待复核 |
链 i
1–658(658 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致 |
链 I
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.18 Å |
| 8R22 INTS9-INTS11-BRAT1-WDR73 complex 提交 2023-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8R23 INTS9-INTS11-BRAT1 complex 提交 2023-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8R2D Integrator cleavage module assembly intermediate 提交 2023-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物一致 |
链 i
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8RBZ Structure of Integrator-PP2A-SOSS-CTD post-termination complex 提交 2023-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric(21) 与蛋白数一致 |
链 i
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8RC4 Structure of Integrator-PP2A complex 提交 2023-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:16-meric(16) 与蛋白数一致 |
链 i
1–658(658 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8UIB Structure of the human INTS9-INTS11-BRAT1 complex 提交 2023-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 I
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 8YJB Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC complex 提交 2024-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 I
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:38-meric(38) 与全部聚合物一致 |
链 I
1–658(658 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |