SAXSdb — 1dfk

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MYOSIN HEAD

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MYOSIN HEAD × 1 （P13543） MYOSIN HEAD × 1 （P07291） CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYS_AEQIR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–830； UniProt 6–835

MYOSIN HEAD

物种未注明

UniProt P13543

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MYOSIN HEAD × 1 （P24733） MYOSIN HEAD × 1 （P07291） CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MLR_AEQIR
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–139； UniProt 13–151

MYOSIN HEAD

物种未注明

UniProt P07291

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MYOSIN HEAD × 1 （P24733） MYOSIN HEAD × 1 （P13543） CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MLE_AEQIR
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–152； UniProt 4–155

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1dfk
沉积日期 deposition_date	1999-11-19
结构标题 title	NUCLEOTIDE-FREE SCALLOP MYOSIN S1-NEAR RIGOR STATE
关键词 keywords	MYOSIN MOTOR, CONFORMATIONAL CHANGES, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1dfk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1dfk__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1dfk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	47.66 Å
Rg（电子密度）	49.59 Å
总 Rg	49.24 Å
原子数	5032
残基数	1019
排除体积	81116 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1dfk__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MYOSIN HEAD
分子量 formula_weight	94696.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5032

SDPDFQYLAVDRKKLMKEQTAAFDGKKNCWVPDEKEGFASAEIQSSKGDEITVKIVADSSTRTVKKDDIQSMNPPKFEKLEDMANMTYLNEASVLYNLRSRYTSGLIYTYSGLFCIAVNPYRRLPIYTDSVIAKYRGKRKTEIPPHLFSVADNAYQNMVTDRENQSCLITGESGAGKTENTKKVIMYLAKVACAVKKKDEEASDKKEGSLEDQIIQANPVLEAYGNAKTTRNNNSSRFGKFIRIHFGPTGKIAGADIETYLLEKSRVTYQQSAERNYHIFYQICSNAIPELNDVMLVTPDSGLYSFINQGCLTVDNIDDVEEFKLCDEAFDILGFTKEEKQSMFKCTASILHMGEMKFKQRPREEQAESDGTAEAEKVAFLCGINAGDLLKALLKPKVKVGTEMVTKGQNMNQVVNSVGALAKSLYDRMFNWLVRRVNKTLDTKAKRNYYIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINYTNERLQQFFNHHMFILEQEEYKKEGIAWEFIDFGMDLQMCIDLIEKPMGILSILEEECMFPKADDKSFQDKLYQNHMGKNRMFTKPGKPTRPNQGPAHFELHHYAGNVPYSITGWLEKNKDPINENVVALLGASKEPLVAELFKAPEEPAGGGKKKKGKSSAFQTISAVHRESLNKLMKNLYSTHPHFVRCIIPNELKQPGLVDAELVLHQLQCNGVLEGIRICRKGFPSRLIYSEFKQRYSILAPNAIPQGFVDGKTVSEKILAGLQMDPAEYRLGTTKVFFKAGVLGNLEEMRDERLSKIISMFQAHIRGYLIRKAYKKLQDQRIGLSVIQRNIRKWLVLRNWQWWKLYSKVKP

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MYOSIN HEAD
分子量 formula_weight	15914.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

LPQKQIQEMKEAFSMIDVDRDGFVSKEDIKAISEQLGRAPDDKELTAMLKEAPGPLNFTMFLSIFSDKLSGTDSEETIRNAFAMFDEQETKKLNIEYIKDLLENMGDNFNKDEMRMTFKEAPVEGGKFDYVKFTAMIKG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	MYOSIN HEAD
分子量 formula_weight	17165.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

LSQDEIDDLKDVFELFDFWDGRDGAVDAFKLGDVCRCLGINPRNEDVFAVGGTHKMGEKSLPFEEFLPAYEGLMDCEQGTFADYMEAFKTFDREGQGFISGAELRHVLTALGERLSDEDVDEIIKLTDLQEDLEGNVKYEDFVKKVMAGPYP

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1dfka1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.3 — Myosin S1 fragment, N-terminal domain
家族 Family family	b.34.3.1 — Myosin S1 fragment, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1dfka2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.9 — Motor proteins

结构域编号 domain_id	d1dfky_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

结构域编号 domain_id	d1dfkz_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

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晶胞边长 a length_a	86.500 Å
晶胞边长 b length_b	52.100 Å
晶胞边长 c length_c	164.600 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	100.30 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.200 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.4150
R_work r_work	0.4150
R_free r_free	0.4100

NUCLEOTIDE-FREE SCALLOP MYOSIN S1-NEAR RIGOR STATE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MYOSIN HEAD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MYOSIN HEAD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MYOSIN HEAD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1dfk__assembly_1__model_1

1dfk__assembly_1__model_1 | I(q)

1dfk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

7. 引用文献 (3)

NUCLEOTIDE-FREE SCALLOP MYOSIN S1-NEAR RIGOR STATE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MYOSIN HEAD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MYOSIN HEAD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MYOSIN HEAD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1dfk__assembly_1__model_1

1dfk__assembly_1__model_1 | I(q)

1dfk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

7. 引用文献 (3)