;Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1,Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1,Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1 ;
Bos taurus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 26–215 链 A; UniProt 295–350 | 片段:UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298 | Regulator of G-protein signaling 9 × 1 (O46469) MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;10.5% PEG8000, 110mM magnesium acetate, 50mM Tris pH 8.5, 0.2% beta-ME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K | 分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 2 | 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 C; UniProt 26–215 链 C; UniProt 295–350 | 片段:UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298 | Regulator of G-protein signaling 9 × 1 (O46469) MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;10.5% PEG8000, 110mM magnesium acetate, 50mM Tris pH 8.5, 0.2% beta-ME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K | 分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1FQK | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AQG NMR STRUCTURE OF THE RHODOPSIN-BOUND C-TERMINAL PEPTIDE OF THE TRANSDUCIN ALPHA-SUBUNIT, 20 STRUCTURES 提交 1997-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
339–349(11 aa)
片段:RHODOPSIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 340-350
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5;274 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 AMBIENT
NMR样品组成
20 mM sodium phosphate, 100 mM KCl, 0.1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1FQJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTRIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, THE GAMMA SUBUNIT OF PHOSPHODIESTERASE AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(PDEGAMMA)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
26–215(190 aa)
片段:UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298
链 A
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;15.0% PEG8000, 200mM Tris pH9.0, 0.2% beta-ME, 1mM (NH4)2WS4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.265 |
| 1FQJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTRIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, THE GAMMA SUBUNIT OF PHOSPHODIESTERASE AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(PDEGAMMA)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
26–215(190 aa)
片段:UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298
链 D
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;15.0% PEG8000, 200mM Tris pH9.0, 0.2% beta-ME, 1mM (NH4)2WS4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.265 |
| 1GOT HETEROTRIMERIC COMPLEX OF A GT-ALPHA/GI-ALPHA CHIMERA AND THE GT-BETA-GAMMA SUBUNITS 提交 1996-08-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–349(349 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;10 MG/ML OF HETEROTRIMERIC COMPLEX WERE MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION CONTAINING 10% PEG-8000, 50 MM TRIS, PH 8.0, 10% GLYCEROL, 50 MM NACL, .1 MM MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.295 |
| 1LVZ METARHODOPSIN II BOUND STRUCTURE OF C-TERMINAL PEPTIDE OF ALPHA-SUBUNIT OF TRANSDUCIN 提交 2002-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
339–349(11 aa)
片段:S2 Peptide, Residues 339-349
|
突变:K340R, C346S | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.6;283 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM HEPES, 20 mM KCl;压力 ambient
NMR样品组成
2.6mM S2 peptide U-15N, 0.063mM rhodopsin as part of intact disk membranes from bovine retina; buffer: 10 mM HEPES, 20mM KCl, 0.05mM DTPA | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2.6mM S2 peptide U-15N, 13C, 0.063mM rhodopsin as part of intact disk membranes from bovine retina; buffer: 10 mM HEPES, 20mM KCl, 0.05mM DTPA | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1TAD GTPASE MECHANISM OF GPROTEINS FROM THE 1.7-ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSDUCIN ALPHA-GDP-ALF4- 提交 1995-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
26–349(324 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.266 |
| 1TAD GTPASE MECHANISM OF GPROTEINS FROM THE 1.7-ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSDUCIN ALPHA-GDP-ALF4- 提交 1995-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
26–349(324 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.266 |
| 1TAD GTPASE MECHANISM OF GPROTEINS FROM THE 1.7-ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSDUCIN ALPHA-GDP-ALF4- 提交 1995-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
26–349(324 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.266 |
| 1TAG STRUCTURAL DETERMINANTS FOR ACTIVATION OF THE ALPHA-SUBUNIT OF A HETEROTRIMERIC G PROTEIN 提交 1994-11-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
26–349(324 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.211 |
| 1TND THE 2.2 ANGSTROMS CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSDUCIN-ALPHA COMPLEXED WITH GTP GAMMA S 提交 1994-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
26–349(324 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1TND THE 2.2 ANGSTROMS CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSDUCIN-ALPHA COMPLEXED WITH GTP GAMMA S 提交 1994-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
26–349(324 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1TND THE 2.2 ANGSTROMS CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSDUCIN-ALPHA COMPLEXED WITH GTP GAMMA S 提交 1994-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
26–349(324 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 2X72 CRYSTAL STRUCTURE OF THE CONSTITUTIVELY ACTIVE E113Q,D2C,D282C RHODOPSIN MUTANT WITH BOUND GALPHACT PEPTIDE. 提交 2010-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
340–350(11 aa)
片段:RESIDUES 340-350
|
突变:YES | PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2 PLM PALMITIC ACID × 4 RET RETINAL × 2 LPP 2-(HEXADECANOYLOXY)-1-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]ETHYL HEXADECANOATE × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5;3.0-3.4 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.244 |
| 3DQB Crystal structure of the active G-protein-coupled receptor opsin in complex with a C-terminal peptide derived from the Galpha subunit of transducin 提交 2008-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
340–350(11 aa)
片段:C-terminal domain, UNP residues 340-350
|
突变:K341L | BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3 PLM PALMITIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;AMMONIUM SULFATE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.248 |
| 3PQR Crystal structure of Metarhodopsin II in complex with a C-terminal peptide derived from the Galpha subunit of transducin 提交 2010-11-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
340–350(11 aa)
片段:C-terminal peptide (UNP residues 340-350)
|
突变:K341L,C347V | RET RETINAL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2 PLM PALMITIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.250 |
| 3PQR Crystal structure of Metarhodopsin II in complex with a C-terminal peptide derived from the Galpha subunit of transducin 提交 2010-11-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
340–350(11 aa)
片段:C-terminal peptide (UNP residues 340-350)
|
突变:K341L,C347V | RET RETINAL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 4 PLM PALMITIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.250 |
| 3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 C
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
|
突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;295 K;1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 B
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
|
突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;295 K;1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 A
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
|
突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;295 K;1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 A
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 B
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 B
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 C
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 C
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
|
突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;295 K;1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 A
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 B
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 B
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 C
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 C
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
|
突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;295 K;1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 A
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 C
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 C
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
|
突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;295 K;1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
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分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–215(215 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
链 B
295–350(56 aa)
片段:UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298
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突变:G56P, K244H and D247N 突变:G56P, K244H and D247N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;295 K;1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
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分辨率 2.90 Å R-free 0.272 |
| 4BEY Night blindness causing G90D rhodopsin in complex with GaCT2 peptide 提交 2013-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
340–350(11 aa)
片段:RESIDUES 340-350
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突变:YES | SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å R-free 0.259 |
| 4J4Q Crystal structure of active conformation of GPCR opsin stabilized by octylglucoside 提交 2013-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
340–350(11 aa)
片段:C-terminal derived peptide, UNP RESIDUES 340-350
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突变:K341L, C347V | BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 4 PLM PALMITIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;AMMONIUM SULFATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.65 Å R-free 0.230 |
| 6OY9 Structure of the Rhodopsin-Transducin Complex 提交 2019-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–201(201 aa)
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未记录 | RET RETINAL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.90 Å |
| 6OYA Structure of the Rhodopsin-Transducin-Nanobody Complex 提交 2019-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–201(201 aa)
|
未记录 | RET RETINAL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 1 second before plunging; avoid light as much as possible.
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分辨率 3.30 Å |
| 7JSN Structure of the Visual Signaling Complex between Transducin and Phosphodiesterase 6 提交 2020-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 E
1–215(215 aa)
链 E
295–350(56 aa)
链 F
1–215(215 aa)
链 F
295–350(56 aa)
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突变:R174C,Q200L 突变:R174C,Q200L 突变:R174C,Q200L 突变:R174C,Q200L | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 VDN 2-{2-ETHOXY-5-[(4-ETHYLPIPERAZIN-1-YL)SULFONYL]PHENYL}-5-METHYL-7-PROPYLIMIDAZO[5,1-F][1,2,4]TRIAZIN-4(1H)-ONE × 2 35G GUANOSINE-3',5'-MONOPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris pH 8.0, 5 mM MgCl2 and 1 uM vardenafil
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
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| UniProt名称 | GNAT1_BOVIN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–190; UniProt 26–215 作者链 A; PDB构建体 270–325; UniProt 295–350 作者链 C; PDB构建体 1–190; UniProt 26–215 作者链 C; PDB构建体 270–325; UniProt 295–350 |