SAXSdb — 1gzt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FUCOSE-SPECIFIC LECTIN

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	alpha-L-fucopyranose × 4 CALCIUM ION × 8 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9HYN5
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115 作者链 B； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115 作者链 C； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115 作者链 D； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1gzt
沉积日期 deposition_date	2002-06-06
结构标题 title	Pseudomonas aeruginosa lectin II (PA-IIL) together with fucose
关键词 keywords	LECTIN, SUGAR-BINDING PROTEIN, FUCOSE; LECTIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1gzt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1gzt__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1gzt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.51 Å
Rg（电子密度）	21.02 Å
总 Rg	21.94 Å
原子数	3360
残基数	456
排除体积	59065 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1gzt__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FUCOSE-SPECIFIC LECTIN
分子量 formula_weight	11865.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	4287

MATQGVFTLPANTRFGVTAFANSSGTQTVNVLVNNETAATFSGQSTNNAVIGTQVLNSGSSGKVQVQVSVNGRPSDLVSAQVILTNELNFALVGSEDGTDNDYNDAVVVINWPLG

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	alpha-L-fucopyranose
分子量 formula_weight	164.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	704

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1gzta_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamily	b.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family family	b.115.1.1 — Calcium-mediated lectin

结构域编号 domain_id	d1gztb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamily	b.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family family	b.115.1.1 — Calcium-mediated lectin

结构域编号 domain_id	d1gztc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamily	b.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family family	b.115.1.1 — Calcium-mediated lectin

结构域编号 domain_id	d1gztd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamily	b.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family family	b.115.1.1 — Calcium-mediated lectin

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1gztA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	400 — Calcium-mediated lectin

结构域编号 domain_id	1gztB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	400 — Calcium-mediated lectin

结构域编号 domain_id	1gztC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	400 — Calcium-mediated lectin

结构域编号 domain_id	1gztD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	400 — Calcium-mediated lectin

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晶胞边长 a length_a	52.660 Å
晶胞边长 b length_b	72.920 Å
晶胞边长 c length_c	54.560 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.23 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.300 Å
最低分辨率 resolution_low	30.020 Å
R 因子 r_factor	0.1370
R_work r_work	0.1360
R_free r_free	0.1580

Pseudomonas aeruginosa lectin II (PA-IIL) together with fucose

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FUCOSE-SPECIFIC LECTIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1gzt__assembly_1__model_1

1gzt__assembly_1__model_1 | I(q)

1gzt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Pseudomonas aeruginosa lectin II (PA-IIL) together with fucose

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FUCOSE-SPECIFIC LECTIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1gzt__assembly_1__model_1

1gzt__assembly_1__model_1 | I(q)

1gzt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)