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1h8a

CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX3

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA

HOMO SAPIENS

UniProt P17676

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 MYB TRANSFORMING PROTEIN × 1 （P01104） ;DNA(5'-(*GP*AP*TP*GP*TP*GP*GP*CP*GP*CP*AP* AP*TP*CP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*G)-3') ; × 1 ;DNA(5'-(*CP*CP*AP*GP*TP*CP*CP*GP*TP*TP*AP* AP*GP*GP*AP*TP*TP*GP*CP*GP*CP*CP*AP*CP*AP*T)-3') ; × 1 water × 5 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1gtw 1gtw 1gu4 1gu5 1h88 1h89 1h8a 1hjb 1hjb 1io4 2e42 2e43

共 18 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CEBB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–78； UniProt 259–336 作者链 B； PDB构建体 1–78； UniProt 259–336

MYB TRANSFORMING PROTEIN

AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS

UniProt P01104

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA × 2 （P17676） ;DNA(5'-(*GP*AP*TP*GP*TP*GP*GP*CP*GP*CP*AP* AP*TP*CP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*GP*AP*CP*TP*G)-3') ; × 1 ;DNA(5'-(*CP*CP*AP*GP*TP*CP*CP*GP*TP*TP*AP* AP*GP*GP*AP*TP*TP*GP*CP*GP*CP*CP*AP*CP*AP*T)-3') ; × 1 water × 5 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1h8a

共 1 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MYB_AVIMB
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 7–128； UniProt 1–122

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1h8a
沉积日期 deposition_date2001-01-31
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX3
关键词 keywords;TRANSCRIPTION/DNA, PROTEIN-DNA COMPLEX, TRANSCRIPTION REGULATION, BZIP, V-MYB, C-MYB, AMV, C/EBP, AVIAN MYELOBLASTOSIS VIRUS, TRANSFORMING PROTEIN, TRANSCRIPTION-DNA complex ;; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1h8a__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1h8a__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1h8a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）29.75 Å
Rg（电子密度）30.67 Å
总 Rg30.94 Å
原子数3105
残基数292
排除体积51442 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1h8a__assembly_1__model_1 pentameric （5） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1h8aa_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family familyh.1.3.1 — Leucine zipper domain
结构域编号 domain_idd1h8ab_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.3 — Leucine zipper domain
家族 Family familyh.1.3.1 — Leucine zipper domain
结构域编号 domain_idd1h8ac1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.3 — Myb/SANT domain
结构域编号 domain_idd1h8ac2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.3 — Myb/SANT domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1h8aA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id1h8aB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id1h8aC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id1h8aC02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
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7. 引用文献 (4)