1nxd

Crystal structure of MnMn Concanavalin A

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 131.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

concanavalin A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 1； UniProt 164–281 链 1； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 2； UniProt 164–281 链 2； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 3； UniProt 164–281 链 3； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 4； UniProt 164–281 链 4； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
5	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 1； UniProt 164–281 链 1； UniProt 30–148 链 2； UniProt 164–281 链 2； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 8 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 28	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
6	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 3； UniProt 164–281 链 3； UniProt 30–148 链 4； UniProt 164–281 链 4； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 8 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 22	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
7	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 1； UniProt 164–281 链 1； UniProt 30–148 链 2； UniProt 164–281 链 2； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
8	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 3； UniProt 164–281 链 3； UniProt 30–148 链 4； UniProt 164–281 链 4； UniProt 30–148	未记录	AZI AZIDE ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1NXD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1APN THE CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURE OF METAL-FREE CONCANAVALIN A AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1995-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–290（127 aa）链 B 164–290（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.247
1BXH CONCANAVALIN A COMPLEXED TO METHYL ALPHA1-2 MANNOBIOSIDE 提交 1998-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 C 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 C 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 D 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 D 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；13.5% PEG 6K, 1.0M LICL, 0.1M TRIS PH 7.0	分辨率 2.75 Å R-free 0.238
1CES CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A SOAKED WITH ZINC HAVE A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-02-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.	分辨率 2.70 Å R-free 0.249
1CJP CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-METHYLUMBELLIFERYL-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MUG 4-METHYLUMBELLIFERYL-ALPHA-D-GLUCOSE × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.78 Å R-free 0.216
1CN1 CRYSTAL STRUCTURE OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A. THE METAL-BINDING REGION 提交 1981-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
1CON THE REFINED STRUCTURE OF CADMIUM SUBSTITUTED CONCANAVALIN A AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-03-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 8 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1CVN CONCANAVALIN A COMPLEXED TO TRIMANNOSIDE 提交 1995-08-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；pH 9.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.255
1DQ6 Manganese;Manganese concanavalin A at pH 7.0 提交 1999-12-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；2 M ammonium sulphate, 60 mM sodium acetate at pH 7, 3% PEGMe 5000, 1 mM MnCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 1.90 Å
1ENQ CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH ZINC HAVING A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-03-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.	分辨率 2.50 Å R-free 0.284
1ENR CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH ZINC AND CALCIUM HAVING A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE AND A CALCIUM ION BOUND IN THE S2 SITE 提交 1996-03-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.	分辨率 1.83 Å
1ENS CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A SOAKED WITH COBALT HAVING A COBALT ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-03-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.	分辨率 2.80 Å R-free 0.259
1GIC CONCANAVALIN A COMPLEXED WITH METHYL ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-08-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	GYP methyl alpha-D-glucopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 dialysis；pH 6.8；DIALYSIS; 5MM PROTEIN CONCENTRATION WITH, pH 6.8, dialysis	分辨率 2.00 Å
1GKB CONCANAVALIN A, NEW CRYSTAL FORM 提交 2001-08-10	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；HANGING DROP, 30MG/ML, 10+10 UL 1 ML WELL, TRIS/HCL PH 8.0, 25%	分辨率 1.56 Å R-free 0.206
1I3H CONCANAVALIN A-DIMANNOSE STRUCTURE 提交 2001-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：residues 164-281,residues 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：residues 164-281,residues 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；PEG 6000, citirc acid, manganese chloride, calcium chloride, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.20 Å R-free 0.190
1JBC CONCANAVALIN A 提交 1996-08-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 8–148（141 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.15 Å R-free 0.167
1JN2 Crystal Structure of meso-tetrasulphonatophenyl porphyrin complexed with Concanavalin A 提交 2001-07-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 P 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 P 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SFP 5,10,15,20-TETRAKIS(4-SULPFONATOPHENYL)-21H,23H-PORPHINE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.232
1JN2 Crystal Structure of meso-tetrasulphonatophenyl porphyrin complexed with Concanavalin A 提交 2001-07-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 P 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 SFP 5,10,15,20-TETRAKIS(4-SULPFONATOPHENYL)-21H,23H-PORPHINE × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.232
1JW6 Crystal Structure of the Complex of Concanavalin A and Hexapeptide 提交 2001-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 PTD PENTANEDIAL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.45；300 K；Sodium phosphate , pH 5.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300.0K	分辨率 1.93 Å R-free 0.250
1JW6 Crystal Structure of the Complex of Concanavalin A and Hexapeptide 提交 2001-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 PTD PENTANEDIAL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.45；300 K；Sodium phosphate , pH 5.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300.0K	分辨率 1.93 Å R-free 0.250
1NLS CONCANAVALIN A AND ITS BOUND SOLVENT AT 0.94A RESOLUTION 提交 1997-01-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8	分辨率 0.94 Å R-free 0.154
1ONA CO-CRYSTALS OF CONCANAVALIN A WITH METHYL-3,6-DI-O-(ALPHA-D-MANNOPYRANOSYL)-ALPHA-D-MANNOPYRANOSIDE 提交 1996-07-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；13% POLYETHYLENEGLYCOLMETHYLETHER, 40 MM HEPES PH 6.5	分辨率 2.35 Å R-free 0.282
1QNY X-ray refinement of D2O soaked crystal of concanavalin A 提交 1999-10-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 A 164–281（118 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALS SELECTED FOR X-RAY STUDY WERE TRANSFERRED TO A 1ML BUFFER MADE OF 99.9% D2O WITH 0.1M NANO3, 0.05M TRIS-ACETATE, 1MM MNCL2 AND 1MM CACL2 PH 6.5.	分辨率 1.80 Å R-free 0.198
1SCR HIGH-RESOLUTION STRUCTURES OF SINGLE-METAL-SUBSTITUTED CONCANAVALIN A: THE CO,CA-PROTEIN AT 1.6 ANGSTROMS AND THE NI,CA-PROTEIN AT 2.0 ANGSTROMS 提交 1993-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1SCS HIGH-RESOLUTION STRUCTURES OF SINGLE-METAL-SUBSTITUTED CONCANAVALIN A: THE CO,CA-PROTEIN AT 1.6 ANGSTROMS AND THE NI,CA-PROTEIN AT 2.0 ANGSTROMS 提交 1993-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.60 Å
1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 30–148（119 aa）链 F 30–148（119 aa）链 G 30–148（119 aa）链 H 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）链 E 30–148（119 aa）链 F 30–148（119 aa）链 G 30–148（119 aa）链 H 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
1VAL CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-NITROPHENYL-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-01-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	PNG 4-nitrophenyl alpha-D-glucopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
1VAM CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-NITROPHENYL-ALPHA-D-MANNOPYRANOSIDE 提交 1996-01-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	PNA 4-nitrophenyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.260
1XQN The 15k neutron structure of saccharide-free concanavalin A 提交 2004-10-13	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH DIALYSIS；pH 6.5；293 K；0.1M NaNO3, 0.05M Tris-acetate, 1mM MnCl2, 1mM CaCl2 (all in D2O), pH 6.50, BATCH DIALYSIS, temperature 293.0K	分辨率 2.50 Å R-free 0.320
2CNA THE COVALENT AND THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF CONCANAVALIN A, IV.ATOMIC COORDINATES,HYDROGEN BONDING,AND QUATERNARY STRUCTURE 提交 1975-04-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–290（127 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
2CTV HIGH RESOLUTION CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NATIVE CONCANAVALIN A USING RAPID LAUE DATA COLLECTION METHODS AND THE INTRODUCTION OF A MONOCHROMATIC LARGE-ANGLE OSCILLATION TECHNIQUE (LOT) 提交 1993-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.95 Å
2ENR CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH CADMIUM HAVING A CADMIUM ION BOUND IN BOTH THE S1 SITE AND THE S2 SITE 提交 1998-07-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 8–148（141 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 2.35 Å
2UU8 X-ray structure of Ni, Ca concanavalin A at Ultra-high resolution (0. 94A) 提交 2007-03-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 0.94 Å R-free 0.142
2YZ4 The neutron structure of concanavalin A at 2.2 Angstroms 提交 2007-05-02	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH DIALYSIS；pH 6.5；293 K；0.1M NaNO3, 0.05M Tris-acetate, 1mM MnCl2, 1mM CaCl2, pH 6.5, BATCH DIALYSIS, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.312
3CNA STRUCTURE OF CONCANAVALIN A AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1976-09-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
3D4K Concanavalin A Complexed to a Synthetic Analog of the Trimannoside 提交 2008-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；10-16% PEG 6000, 100 mM Sodium cacodylate, 50 mM NaCL, 1 mM MnCL2, 1 mM CaCL2, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3ENR ZINC-CALCIUM CONCANAVALIN A AT PH 6.15 提交 1999-02-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.15；ZNCL2, CACL2, (NH4)2SO4, sodium acetate, pH 6.15, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
4P9W Structure of ConA/Rh3Man 提交 2014-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148	未记录	R3M 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.2；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.	分辨率 2.11 Å R-free 0.202
4P9X Structure of ConA/Rh3Glu complex 提交 2014-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148	未记录	R3G 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-glucopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.2；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.	分辨率 2.06 Å R-free 0.295
4P9Y Structure of ConA/Rh4man 提交 2014-04-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148	未记录	2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.2；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.	分辨率 1.89 Å R-free 0.258
4PF5 Crystal structure of Concanavalin A complexed with a synthetic derivative of high-mannose chain 提交 2014-04-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：Tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：Residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：Residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：Residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：Residues 164-281, 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 M3N 4-(hydroxymethyl)-1-(alpha-D-mannopyranosyl)-1H-1,2,3-triazole × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Acetate, 1,4-dioxane	分辨率 2.04 Å R-free 0.227
5CNA REFINED STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED WITH ALPHA-METHYL-D-MANNOPYRANOSIDE AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION AND COMPARISON WITH THE SACCHARIDE-FREE STRUCTURE 提交 1994-02-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
5O6N High pressure flash cooled concanavalin A 提交 2017-06-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；10 mg/ml Concanavalin A in 0.025 M HEPES pH 7.0 were mixed in a 1:1 ratio with 6 % (w/v) PEG 8000 and 0.1 M Tris pH 8.5.	分辨率 1.35 Å R-free 0.164
5WEY Joint X-ray/neutron structure of Concanavalin A with alpha1-2 D-mannobiose 提交 2017-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 164–281（118 aa）片段：unp residues 164-281; unp residues 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：unp residues 164-281; unp residues 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	实验方法未声明 X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；10% PEG 6K, 0.1 M sodium citrate, pH 5 in H2O	分辨率未提供
5YGM Monomeric structure of concanavalin A at pH 7.5 from Carnivalia ensiformis 提交 2017-09-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEK6K, MPD in HEPES, pH 7.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.196
5Z5L Crystal structure of ConA-R5M 提交 2018-01-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 96O (1-methyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl alpha-D-mannopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
5Z5L Crystal structure of ConA-R5M 提交 2018-01-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
5Z5N Crystal structure of ConA-R1M 提交 2018-01-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 2.04 Å R-free 0.225
5Z5P Crystal structure of ConA-R3M 提交 2018-01-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 R3M 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 1.40 Å R-free 0.241
5Z5Y Crystal structure of ConA-R4M 提交 2018-01-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 1.89 Å R-free 0.244
5Z5Y Crystal structure of ConA-R4M 提交 2018-01-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 1.89 Å R-free 0.244
5ZAC Crystal structure of ConA-R2M 提交 2018-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 TA5 2H-1,2,3-TRIAZOL-4-YLMETHANOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；each 0.2 mM ConA in 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 2.59 Å R-free 0.372
6AHG Trimeric structure of concanavalin A from Canavalia ensiformis 提交 2018-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 CD CADMIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Polyethylene glycol 400, 0.1 M Cadmium chloride hydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6	分辨率 2.83 Å R-free 0.279
6H2M Long wavelength Mesh&Collect native SAD phasing on microcrystals 提交 2018-07-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；drops made from equal amounts of protein solution (1 l, 10 mg/ml in water) and reservoir solution (1l, 34%(v/v) PEG 1500), buffered with 5mM HEPES, pH 6.0	分辨率 1.93 Å R-free 0.177
6XT6 pro-concanavalin A: Precursor of circularly permuted concanavalin A 提交 2020-07-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–290（261 aa）链 B 30–290（261 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Zinc chloride, HEPES, PEG 6000	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
7MG1 Concanavalin A crystallized without DNA glycoconjugate 提交 2021-04-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H3: 0.1 M potassium chloride, 0.005 M barium chloride dihydrate, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 12% w/v PEG 8000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 2.00 Å R-free 0.262
7MG2 Concanavalin A crystallized in the presence of Man-8 提交 2021-04-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and mannose-squaramide (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B6: 0.1 M sodium chloride, 0.005 M strontium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 1.80 Å R-free 0.230
7MG3 Concanavalin A crystallized in the presence of H2N-ATAT 提交 2021-04-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and 5'-ATAT-3' (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D11: 0.2 M lithium chloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 22% w/v PEG 2000 MME). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 1.60 Å R-free 0.213
7MG4 Concanavalin A crystallized in the presence of Gal-ATAT 提交 2021-04-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Gal-ATAT (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H9: 0.1 M potassium chloride, 0.002 M spermine tetrahydrochloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7.5), 7% w/v PEG 8000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
7MG5 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-ATAT 提交 2021-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and Man-ATAT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D9: 0.05 M bis-Tris (pH 7), 2 M ammonium sulfate, 5% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
7MG6 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-AGCT 提交 2021-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and Man-AGCT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D3: 0.2 M lithium sulfate, 0.05 M bis Tris (pH 7), 20% v/v MPD). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 1.70 Å R-free 0.207
7MG7 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-GTAC 提交 2021-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Man-GTAC (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition A4: 0.2 M potassium chloride, 0.005 M hexammine cobalt(III) chloride, 0.05 M MES (pH 6.5), 25% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 1.75 Å R-free 0.215
7MG8 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-CGCG 提交 2021-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (80 uM) and Man-CGCG (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D9: 0.05 M bis-Tris (pH 7), 2 M ammonium sulfate, 5% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 3.00 Å R-free 0.284
7MG9 Concanavalin A bound to DNA glycoconjugates, Man-TTTT and Man-AAAA 提交 2021-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM), Man-TTTT (64 uM), and Man-AAAA (64 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B5: 0.1 M lithium chloride, 0.01 M manganese(II) chloride tetrahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.55 Å R-free 0.314
7MGA Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-AAATTT 提交 2021-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Man-AAATTT (64 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition A3: 0.1 M sodium chloride, 0.05 M lithium chloride, 0.01 M magnesium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 25% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.00 Å R-free 0.229
7MGB Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, A(Man-T)AT 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and A(Man-T)AT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H10: 0.05 M lithium sulfate, 0.03 M magnesium sulfate heptahydrate, 0.05 M bis Tris (pH 8), 15% w/v PEG 3350). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.45 Å R-free 0.262
7MGC Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, G(Man-T)AC 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and G(Man-T)AC (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H6: 0.1 M potassium chloride, 0.002 M spermine tetrahydrochloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 15% w/v PEG 2000 MME). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.92 Å R-free 0.277
7MGD Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, T(Man-T)TT 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and T(Man-T)TT (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B6: 0.1 M sodium chloride, 0.005 M strontium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.05 Å R-free 0.255
8WMG Structure of ConA/Man3 提交 2023-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	WRW 4-[3,5-bis(4-carboxyphenyl)phenyl]benzoic acid × 1 ETA ETHANOLAMINE × 3 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2, pH = 7.5, Precipitant: 200 mM Ammonium phosphate	分辨率 1.97 Å R-free 0.212
8WMK Structure of ConA/Man2 提交 2023-10-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	WU0 4-[3-(4-carboxyphenyl)phenyl]benzoic acid × 2 ETA ETHANOLAMINE × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2; pH = 7.2, precipitant: Ammonium phosphate	分辨率 2.17 Å R-free 0.267
9B34 Structure of concanavalin A (ConA) dimer from the open-state structure of kainate receptor GluK2 in complex with agonist glutamate and positive allosteric modulator BPAM344 bound to two ConA dimers. Type I interface between GluK2 ligand-binding domain and ConA 提交 2024-03-18	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 164–281（118 aa）链 E 30–148（119 aa）链 F 164–281（118 aa）链 F 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
9J1A Structure of ConA without ligand 提交 2024-08-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8M Ammonium Sulfate, 0.1M MES pH 6.5, 0.01M Cobalt Chloride	分辨率 1.48 Å R-free 0.213
9J1B Structure of ConA/IMI-Man 提交 2024-08-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 A1EAT ~{N}-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethyl]-4-[3-[4-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethylcarbamoyl]phenyl]imidazol-3-ium-1-yl]benzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2; pH = 7.2, precipitant: Ammonium phosphate	分辨率 2.48 Å R-free 0.228
9J1C Structure of ConA/NAP-Man 提交 2024-08-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 A1EAU ~{N}2,~{N}6-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]naphthalene-2,6-dicarboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12 % w/v Polyethylene glycol 20,000	分辨率 2.43 Å R-free 0.282
9J1D Structure of ConA/PHE-Man 提交 2024-08-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	A1EAW ~{N}2,~{N}9-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide × 2 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 2.0M Ammonium phosphate monobasic	分辨率 3.49 Å R-free 0.229
9J1F Dimeric Structure of ConA/M2P-Man 提交 2024-08-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2 10% (w/v) PEG 3000	分辨率 2.17 Å R-free 0.257
9J1F Dimeric Structure of ConA/M2P-Man 提交 2024-08-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 A1EAW ~{N}2,~{N}9-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2 10% (w/v) PEG 3000	分辨率 2.17 Å R-free 0.257

共 72 个其他 PDB 条目、82 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CONA_CANEN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–118； UniProt 164–281 作者链 1； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148 作者链 2； PDB构建体 1–118； UniProt 164–281 作者链 2； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148 作者链 3； PDB构建体 1–118； UniProt 164–281 作者链 3； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148 作者链 4； PDB构建体 1–118； UniProt 164–281 作者链 4； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1nxd
沉积日期 deposition_date	2003-02-10
结构标题 title	Crystal structure of MnMn Concanavalin A
关键词 keywords	Lectin, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.25 Å
零角强度 I(0) i0	174064000.00
分子量 molecular_weight	105870.0 kDa
排除体积 excluded_volume	131300 Å³
包络体积 envelope_volume	186070 Å³
水化壳体积 shell_volume	36277 Å³
包络直径 envelope_diameter	135.6 Å
壳层 Rg shell_rg	49.34 Å
包络 Rg envelope_rg	40.04 Å
形状 Rg shape_rg	42.24 Å
总 Rg total_rg	42.62 Å
总原子数 total_atoms	7446
残基数 n_residues	948
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	131.2 Å
Rg (实空间) rg_real	42.67 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.54 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7410e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4560e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.71 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	174100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7916
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	70.9 Å
偏度 Skewness skewness	-0.009
峰度 Kurtosis kurtosis	-1.018
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	12790000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.546; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.855; Smooth: 0.794

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	concanavalin A
分子量 formula_weight	25622.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,2,3,4
原子数 atom_count	8210

ADTIVAVELDTYPNTDIGDPSYPHIGIDIKSVRSKKTAKWNMQNGKVGTAHIIYNSVDKRLSAVVSYPNADSATVSYDVDLDNVLPEWVRVGLSASTGLYKETNTILSWSFTSKLKSNSTHETNALHFMFNQFSKDQKDLILQGDATTGTDGNLELTRVSSNGSPQGSSVGRALFYAPVHIWESSAVVASFEATFTFLIKSPDSHPADGIAFFISNIDSSIPSGSTGRLLGLFPDAN

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	AZIDE ION
分子量 formula_weight	42.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	25

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	764

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1nxd1_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d1nxd2_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d1nxd3_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d1nxd4_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1nxd100
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	1nxd200
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	1nxd300
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	1nxd400
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	101.300 Å
晶胞边长 b length_b	118.000 Å
晶胞边长 c length_c	249.500 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	19.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1840
R_free r_free	0.2010

fit	/app/data/saxs_computation/nx/1nxd/1nxd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/nx/1nxd/1nxd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/nx/1nxd/1nxd.dat