1qgk

STRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 92.4 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (IMPORTIN BETA SUBUNIT)

Homo sapiens

UniProt Q14974

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–876 未记录 PROTEIN (IMPORTIN ALPHA-2 SUBUNIT) × 1 (P52292) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.5;pH 6.5 分辨率 2.50 Å R-free 0.273

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 22 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IMB1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–876; UniProt 1–876

PROTEIN (IMPORTIN ALPHA-2 SUBUNIT)

物种未注明

UniProt P52292

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 11–54 片段:IBB DOMAIN PROTEIN (IMPORTIN BETA SUBUNIT) × 1 (Q14974) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.5;pH 6.5 分辨率 2.50 Å R-free 0.273

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IMA2_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–44; UniProt 11–54

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1qgk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1qgk
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1qgk
沉积日期 deposition_date1999-04-29
结构标题 titleSTRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA
关键词 keywordsTRANSPORT RECEPTOR, NUCLEAR IMPORT, HEAT MOTIF, NLS-BINDING; TRANSPORT RECEPTOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier32.42
回转半径 Rg (电子) rg_electron31.59
零角强度 I(0) i0170138000.00
分子量 molecular_weight102560.0 kDa
排除体积 excluded_volume128190 ų
包络体积 envelope_volume172820 ų
水化壳体积 shell_volume44903 ų
包络直径 envelope_diameter96.2
壳层 Rg shell_rg39.54
包络 Rg envelope_rg30.49
形状 Rg shape_rg31.60
总 Rg total_rg32.28
总原子数 total_atoms7185
残基数 n_residues920
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax92.4
Rg (实空间) rg_real32.15
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.42
I(0) (实空间) i0_real1.7010e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.4570e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal32.27
I(0) (倒空间) i0_reciprocal170200000.0000
解质量估计 total_estimate0.9037
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary45.3
偏度 Skewness skewness-0.016
峰度 Kurtosis kurtosis-0.651
角度范围 angular_range— – 0.2450 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha74130000.0000
实空间数据点数 n_real_points50
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.979; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.817

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1qgka_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.1 — ARM repeat
家族 Family familya.118.1.1 — Armadillo repeat

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1qgkA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Leucine-rich Repeat Variant
结构域编号 domain_id1qgkB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily690 — Importin-alpha, importin-beta-binding domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)