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1qu1

CRYSTAL STRUCTURE OF EHA2 (23-185)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 218.8 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (INFLUENZA RECOMBINANT HA2 CHAIN)

Influenza A virus

UniProt P03437

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 376–530 链 B； UniProt 376–530 链 C； UniProt 376–530 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.4；2% PEG 4000, 30-150 MM NACL, pH 4.40 分辨率 1.90 Å R-free 0.250
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 376–530 链 E； UniProt 376–530 链 F； UniProt 376–530 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.4；2% PEG 4000, 30-150 MM NACL, pH 4.40 分辨率 1.90 Å R-free 0.250

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1QU1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1EO8 INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 2000-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 17–344（328 aa） 片段：BROMELAIN RELEASED FRAGMENT
链 B 346–520（175 aa） 片段：BROMELAIN RELEASED FRAGMENT
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；28%(w:v) PEG 600, 100 mM Sodium Phosphate, 150 mM NaCl, 0.05% NaN3 , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
1FYT CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF A HUMAN ALPHA/BETA-T CELL RECEPTOR, INFLUENZA HA ANTIGEN PEPTIDE, AND MHC CLASS II MOLECULE, HLA-DR1 提交 2000-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 322–334（13 aa） 片段：ANTIGEN PEPTIDE
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；11% PEG 8000, 1 M NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
1HA0 HEMAGGLUTININ PRECURSOR HA0 提交 1998-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–518（494 aa） 片段：HA1, HA2
突变：R329Q NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50
分辨率 2.80 Å R-free 0.302
1HGD BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å
1HGE BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 MNA 2-O-methyl-5-N-acetyl-alpha-D-neuraminic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
1HGF BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1HGG BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1HGH BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 MNA 2-O-methyl-5-N-acetyl-alpha-D-neuraminic acid × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å
1HGI BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 ANA methyl 4-O-acetyl-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å
1HGJ BINDING OF INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ TO ANALOGS OF ITS CELL-SURFACE RECEPTOR, SIALIC ACID: ANALYSIS BY PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 AMN methyl 5-acetamido-9-amino-3,5,9-trideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å
1HTM STRUCTURE OF INFLUENZA HAEMAGGLUTININ AT THE PH OF MEMBRANE FUSION 提交 1994-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–43（27 aa）
链 B 383–520（138 aa）
链 C 17–43（27 aa）
链 D 383–520（138 aa）
链 E 17–43（27 aa）
链 F 383–520（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1J8H Crystal Structure of a Complex of a Human alpha/beta-T cell Receptor, Influenza HA Antigen Peptide, and MHC Class II Molecule, HLA-DR4 提交 2001-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 322–334（13 aa） 片段：Antigen Peptide
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；13% PEG 8000, 1 M NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
1KEN INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH AN ANTIBODY THAT PREVENTS THE HEMAGGLUTININ LOW PH FUSOGENIC TRANSITION 提交 2001-11-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 346–520（175 aa） 片段：FAB fragment of antibody
链 D 346–520（175 aa） 片段：FAB fragment of antibody
链 F 346–520（175 aa） 片段：FAB fragment of antibody
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；peg 20000, calcium chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1QFU INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1999-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 17–344（328 aa） 片段：BROMELAIN DIGESTED
链 B 346–520（175 aa） 片段：BROMELAIN DIGESTED
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.284
2HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
2VIR INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1997-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 44–325（282 aa） 片段：;PROTEOLYTIC FRAGMENT "HA TOP" CONTAINING HA1 RESIDUES 28 - 328 ;
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.25 Å R-free 0.249
2VIS INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ, (ESCAPE) MUTANT WITH THR 131 REPLACED BY ILE, COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1997-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 44–325（282 aa） 片段：;PROTEOLYTIC FRAGMENT "HA TOP" CONTAINING HA1 RESIDUES 28 - 328 ;
突变：T131I ZN ZINC ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.25 Å R-free 0.267
2VIT INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ, MUTANT WITH THR 155 REPLACED BY ILE, COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY 提交 1997-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 44–325（282 aa） 片段：;PROTEOLYTIC FRAGMENT "HA TOP" CONTAINING HA1 RESIDUES 28 - 328 ;
突变：T155I ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.25 Å R-free 0.237
2VIU INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ 提交 1997-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
突变：CHAIN A, T131I 突变：CHAIN A, T131I NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.242
2YPG Haemagglutinin of 1968 Human H3N2 Virus in Complex with Human Receptor Analogue LSTc 提交 2012-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa） 片段：HA2 OF BROMELAIN RELEASED ECTODOMAIN, RESIDUES 346-520
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa） 片段：HA2 OF BROMELAIN RELEASED ECTODOMAIN, RESIDUES 346-520
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa） 片段：HA2 OF BROMELAIN RELEASED ECTODOMAIN, RESIDUES 346-520
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 FLC CITRATE ANION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.7-2 M TRIAMMONIUM CITRATE PH 6.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.190
3EYM Structure of Influenza Haemagglutinin in complex with an inhibitor of membrane fusion 提交 2008-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 25–345（321 aa）
链 B 346–517（172 aa）
链 C 25–345（321 aa）
链 D 346–517（172 aa）
链 E 25–345（321 aa）
链 F 346–517（172 aa）
未记录 EYK 2-tert-butylbenzene-1,4-diol × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Ammonium citratre, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.217
3HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
3VUN Crystal structure of a influenza A virus (A/Aichi/2/1968 H3N2) hemagglutinin in C2 space group. 提交 2012-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–345（329 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–345（329 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–345（329 aa）
链 F 346–520（175 aa）
突变：G144S, I182V 突变：E132D 突变：G144S, I182V 突变：E132D 突变：G144S, I182V 突变：E132D NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；293 K；0.2M imidazole (pH 7.0), 27% Jeffamine ED-2001 (pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.275
3ZTJ Structure of influenza A neutralizing antibody selected from cultures of single human plasma cells in complex with human H3 Influenza haemagglutinin. 提交 2011-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 17–345（329 aa）
链 B 346–520（175 aa） 片段：RESIDUES 346-520
链 C 17–345（329 aa）
链 D 346–520（175 aa） 片段：RESIDUES 346-520
链 E 17–345（329 aa）
链 F 346–520（175 aa） 片段：RESIDUES 346-520
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.41 Å R-free 0.284
4HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
5HMG REFINEMENT OF THE INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ BY SIMULATED ANNEALING 提交 1989-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–344（328 aa）
链 B 346–520（175 aa）
链 C 17–344（328 aa）
链 D 346–520（175 aa）
链 E 17–344（328 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å
5Y2L Crystal structure of a group 2 HA binding antibody AF4H1K1 Fab in complex with the 1968 H3N2 pandemic (H3-AC/68) hemagglutinin 提交 2017-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 17–345（329 aa）
链 B 346–521（176 aa） 片段：UNP residues 346-521
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.19 mM CYMAL7, 0.1M HEPES pH 7.5, 40% ployethylene glycol 400
分辨率 2.90 Å R-free 0.244
6E56 Human antibody H2214 in complex with influenza hemagglutinin A/Aichi/2/1968 (X-31) (H3N2) 提交 2018-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 53–335（283 aa） 片段：head domain (UNP residues 53-335)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291.15 K；100 mM sodium chloride, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, 20% w/v PEG2000 MME
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
6E56 Human antibody H2214 in complex with influenza hemagglutinin A/Aichi/2/1968 (X-31) (H3N2) 提交 2018-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 53–335（283 aa） 片段：head domain (UNP residues 53-335)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291.15 K；100 mM sodium chloride, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, 20% w/v PEG2000 MME
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
6N5D Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 53–334（282 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.244
6N5D Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 53–334（282 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.244
6N5D Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 53–334（282 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.244
6N5E Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 53–334（282 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5, 20% w/v PEG8000
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
6N5E Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 53–334（282 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5, 20% w/v PEG8000
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
6N5E Broadly protective antibodies directed to a subdominant influenza hemagglutinin epitope 提交 2018-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 53–334（282 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5, 20% w/v PEG8000
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
6XPX Human antibody S1V2-51 in complex with the influenza hemagglutinin head domain of A/Aichi/2/1968 (X-31)(H3N2) 提交 2020-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 53–335（283 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 BCN BICINE × 2 GOL GLYCEROL × 7 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291.15 K；0.3 M Magnesium chloride, 25% (w/v) PEG 2000, 15% (w/v) Glycerol, 0.1 M BICINE, pH 9.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.215
6Y5G Ectodomain of X-31 Haemagglutinin at pH 8 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 24–341（318 aa）
链 B 346–517（172 aa）
链 C 24–341（318 aa）
链 D 346–517（172 aa）
链 E 24–341（318 aa）
链 F 346–517（172 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6Y5H Ectodomain of X-31 Haemagglutinin at pH 5 (State I) 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 24–341（318 aa）
链 B 346–517（172 aa）
链 C 24–341（318 aa）
链 D 346–517（172 aa）
链 E 24–341（318 aa）
链 F 346–517（172 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6Y5I Dilated form 1 of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State II) 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 24–341（318 aa）
链 B 346–517（172 aa）
链 C 24–341（318 aa）
链 D 346–517（172 aa）
链 E 24–341（318 aa）
链 F 346–517（172 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6Y5J Dilated form 2 of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State III) 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 24–341（318 aa）
链 B 346–517（172 aa）
链 C 24–341（318 aa）
链 D 346–517（172 aa）
链 E 24–341（318 aa）
链 F 346–517（172 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6Y5K Extended Intermediate form of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State IV) 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 24–341（318 aa）
链 B 346–517（172 aa）
链 C 24–341（318 aa）
链 D 346–517（172 aa）
链 E 24–341（318 aa）
链 F 346–517（172 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6Y5L Signal Subtracted Extended Intermediate form of X-31 Influenza Haemagglutinin at pH 5 (State IV) 提交 2020-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 346–517（172 aa）
链 D 346–517（172 aa）
链 F 346–517（172 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7ZJ6 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 7.5 提交 2022-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 17–520（504 aa）
链 B 17–520（504 aa）
链 C 17–520（504 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4s blot
分辨率 2.60 Å
7ZJ7 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 4.8 提交 2022-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 17–520（504 aa）
链 B 17–520（504 aa）
链 C 17–520（504 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4s blot
分辨率 3.95 Å
7ZJ8 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 7.5 after reneutralization 提交 2022-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 17–520（504 aa）
链 B 17–520（504 aa）
链 C 17–520（504 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4s blot
分辨率 3.10 Å
8G5B Influenza A H3N2 X-31 Hemagglutinin in complex with FL-1061 提交 2023-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 53–335（283 aa） 片段：head fragment
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PK3 CryoEM reconstruction of hemagglutinin HK68 of Influenza A virus bound to an Affimer reagent 提交 2023-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 346–520（175 aa）
链 E 346–520（175 aa）
链 F 346–520（175 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 42 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HEMA_IAAIC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–155； UniProt 376–530 作者链 B； PDB构建体 1–155； UniProt 376–530 作者链 C； PDB构建体 1–155； UniProt 376–530 作者链 D； PDB构建体 1–155； UniProt 376–530 作者链 E； PDB构建体 1–155； UniProt 376–530 作者链 F； PDB构建体 1–155； UniProt 376–530

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1qu1

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1qu1
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1qu1
沉积日期 deposition_date1999-07-05
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF EHA2 (23-185)
关键词 keywordsHEMAGGLUTININ, LOW-PH, VIRUS/VIRAL PROTEIN, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier63.06 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron65.89 Å
零角强度 I(0) i0165779000.00
分子量 molecular_weight101920.0 kDa
排除体积 excluded_volume125630 ų
包络体积 envelope_volume194700 ų
水化壳体积 shell_volume30253 ų
包络直径 envelope_diameter234.4 Å
壳层 Rg shell_rg46.90 Å
包络 Rg envelope_rg66.67 Å
形状 Rg shape_rg65.88 Å
总 Rg total_rg65.34 Å
总原子数 total_atoms7173
残基数 n_residues874
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax218.8 Å
Rg (实空间) rg_real65.08 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.51 Å
I(0) (实空间) i0_real1.6580e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.7370e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal61.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal164700000.0000
解质量估计 total_estimate0.5808
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary26.3 Å
偏度 Skewness skewness0.611
峰度 Kurtosis kurtosis-0.503
角度范围 angular_range— – 0.1250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0002
最高正则化参数 α highest_alpha3447000.0000
实空间数据点数 n_real_points26
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.096; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.080; Smooth: 0.178
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1qu1a_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamilyh.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family familyh.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
结构域编号 domain_idd1qu1b_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamilyh.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family familyh.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
结构域编号 domain_idd1qu1c_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamilyh.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family familyh.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
结构域编号 domain_idd1qu1d_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamilyh.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family familyh.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
结构域编号 domain_idd1qu1e_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamilyh.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family familyh.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
结构域编号 domain_idd1qu1f_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamilyh.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family familyh.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1qu1A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1qu1B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1qu1C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1qu1D00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1qu1E00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1qu1F00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)