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1rg6

Solution structure of the C-terminal domain of p63

Method: SOLUTION NMR Dmax: 44.9 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

second splice variant p63

Homo sapiens

UniProt Q9H3D4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 501–575 片段：C-terminal domain (residues 501-575) 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl；压力 ambient NMR测量条件：pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl；压力 ambient NMR测量条件：pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl；压力 ambient NMR测量条件：pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成：0.75mM p63 U-15N, 25mM sodium posphate, 150mM sodium chloride, 1mM AEBSF, 3mM DTT, 95% H20, 5%D2O | 95% H20, 5%D2O NMR样品组成：0.25mM p63 U-15N U-13C, 25mM sodium posphate, 150mM sodium chloride, 1mM AEBSF, 3mM DTT, 95% H20, 5%D2O | 95% H20, 5%D2O NMR样品组成：0.25mM p63 U-15N U-13C, 25mM sodium posphate, 150mM sodium chloride, 1mM AEBSF, 3mM DTT, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成：0.75mM p63 U-15N, 25mM sodium posphate, 150mM sodium chloride, 1mM AEBSF, 3mM DTT, phage | phage 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1RG6 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2NB1 P63/p73 hetero-tetramerisation domain 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 397–455（59 aa） 片段：Tetramerization domain of 63, UNP residues 397-455
链 C 397–455（59 aa） 片段：Tetramerization domain of 63, UNP residues 397-455
突变：K21E 突变：K21E 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）75；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）5；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p63 tetramerization domain, 0.5 mM p73 tetramerization domain, 25 mM HEPES, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5 mM p63 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p73 tetramerization domain, 25 mM HEPES, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] p63 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 13C] p63 tetramerization domain, 1 mM p73 tetramerization domain, 25 mM HEPES, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1 mM p63 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 15N] p73 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 13C] p73 tetramerization domain, 25 mM HEPES, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] p63 tetramerization domain, 0.5 mM p73 tetramerization domain, 25 mM HEPES, 50 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.5 mM p63 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 15N] p73 tetramerization domain, 25 mM HEPES, 50 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] p63 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 13C] p63 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 15N] p73 tetramerization domain, 0.5 mM [U-100% 13C] p73 tetramerization domain, 25 mM HEPES, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2RMN The solution structure of the p63 DNA-binding domain 提交 2007-11-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 153–384（232 aa） 片段：DNA binding domain, UNP residues 153-384
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient
NMR样品组成 0.7mM [U-15N] p63BDB; 50mM potassium chloride; 50mM potassium phosphate; 5mM DTT; 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.7mM [U-13C; U-15N] p63BDB; 50mM potassium chloride; 50mM potassium phosphate; 5mM DTT; 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2Y9T Structural basis of p63a SAM domain mutants involved in AEC syndrome 提交 2011-02-16 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 543–622（80 aa） 片段：SAM DOMAIN, RESIDUES 543-622
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150
NMR样品组成 90% WATER/10% D2O
分辨率未提供
2Y9U Structural basis of p63a SAM domain mutants involved in AEC syndrome 提交 2011-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 545–611（67 aa） 片段：SAM DOMAIN, RESIDUES 545-611
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；100 MM SODIUM CITRATE, PH 6.4, 500MM LITHIUM SULPHATE, 500MM AMMONIUM SULPHATE, 5MM DTT
分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3QYM Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 10 Base Pair A/T Rich Response Element Half Site 提交 2011-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 A 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 B 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 C 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 D 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；10% PEG3350, 0.2 M ammonium formate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3QYM Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 10 Base Pair A/T Rich Response Element Half Site 提交 2011-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 E 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 F 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 G 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 H 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；10% PEG3350, 0.2 M ammonium formate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3QYM Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 10 Base Pair A/T Rich Response Element Half Site 提交 2011-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 C 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 D 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 E 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 F 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；10% PEG3350, 0.2 M ammonium formate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3QYN Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 22 Base Pair A/T Rich Response Element Containing 2 Base Pair Spacer Between Half Sites 提交 2011-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 B 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 C 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 D 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
3US0 Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 22 Base Pair A/T Rich Response Element Containing a Two Base Pair "AT" Spacer Between Half Sites 提交 2011-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 B 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 C 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 D 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；14% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.239
3US1 Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 22 Base Pair Response Element Containing a Two Base Pair "GC" Spacer Between Half Sites 提交 2011-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 D 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2 M ammonium phosphate monobasic, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, 14% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.234
3US2 Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 19 Base Pair A/T Rich Response Element Containing Two Half Sites with a Single Base Pair Overlap 提交 2011-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 B 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 C 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 D 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2 M ammonium formate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.334
3US2 Structure of p63 DNA Binding Domain in Complex with a 19 Base Pair A/T Rich Response Element Containing Two Half Sites with a Single Base Pair Overlap 提交 2011-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 G 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 H 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 I 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
链 J 166–362（197 aa） 片段：DNA binding domain (UNP residues 166-362)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；0.2 M ammonium formate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.334
3ZY0 Crystal structure of a truncated variant of the human p63 tetramerization domain lacking the C-terminal helix 提交 2011-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 304–333（30 aa） 片段：TRUNCATED TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 304-333
链 B 304–333（30 aa） 片段：TRUNCATED TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 304-333
链 C 304–333（30 aa） 片段：TRUNCATED TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 304-333
链 D 304–333（30 aa） 片段：TRUNCATED TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 304-333
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 17 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 12-15 MG/ML IN 20 MM TRIS PH 8.5, 50 MM NACL CRYSTALLIZATION BUFFER: 30% PEG 400, 0.1 M HEPES PH 7.5, 0.2 M MG CHLORIDE.
分辨率 1.90 Å R-free 0.252
3ZY1 Crystal structure of the human p63 tetramerization domain 提交 2011-08-16 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 398–441（44 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 398-441
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 17 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 12-15 MG/ML IN 20 MM TRIS PH 8.5, 50 MM NACL CRYSTALLIZATION BUFFER: 10% PEG 8000, 0.1 M HEPES PH 7.5, AND 0.2 M CA ACETATE
分辨率 2.15 Å R-free 0.285
4A9Z CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN P63 TETRAMERIZATION DOMAIN 提交 2011-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 397–455（59 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 397-455
链 B 397–455（59 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 397-455
链 C 397–455（59 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 397-455
链 D 397–455（59 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 397-455
未记录 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.29 Å R-free 0.246
6FGN Solution Structure of p300Taz2-p63TA 提交 2018-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 47–73（27 aa） 片段：Taz2,transactivation domain
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1200 mM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain of p63, 25 mM MES, 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6RU6 Crystal structure of Casein Kinase I delta (CK1d) in complex with monophosphorylated p63 PAD1P peptide 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 618–630（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；10-20% PEG 3350, 0.1-0.2 M sodium sulfate and 0.1 M citrate, pH 4.6-5.9
分辨率 2.05 Å R-free 0.257
6RU7 Crystal structure of Casein Kinase I delta (CK1d) in complex with double phosphorylated p63 PAD2P peptide 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 618–633（16 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；10-20% PEG 3350, 0.1-0.2 M sodium sulfate and 0.1 M citrate, pH 4.6-5.9
分辨率 2.08 Å R-free 0.218
6RU7 Crystal structure of Casein Kinase I delta (CK1d) in complex with double phosphorylated p63 PAD2P peptide 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 618–633（16 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；10-20% PEG 3350, 0.1-0.2 M sodium sulfate and 0.1 M citrate, pH 4.6-5.9
分辨率 2.08 Å R-free 0.218
6RU8 Crystal structure of Casein Kinase I delta (CK1d) in complex with triple phosphorylated p63 PAD3P peptide 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 621–632（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；10-20% PEG 3350, 0.1-0.2 M sodium sulfate and 0.1 M citrate, pH 4.6-5.9
分辨率 1.92 Å R-free 0.211
6RU8 Crystal structure of Casein Kinase I delta (CK1d) in complex with triple phosphorylated p63 PAD3P peptide 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 621–632（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；10-20% PEG 3350, 0.1-0.2 M sodium sulfate and 0.1 M citrate, pH 4.6-5.9
分辨率 1.92 Å R-free 0.211
6RU8 Crystal structure of Casein Kinase I delta (CK1d) in complex with triple phosphorylated p63 PAD3P peptide 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 621–632（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；10-20% PEG 3350, 0.1-0.2 M sodium sulfate and 0.1 M citrate, pH 4.6-5.9
分辨率 1.92 Å R-free 0.211
6RU8 Crystal structure of Casein Kinase I delta (CK1d) in complex with triple phosphorylated p63 PAD3P peptide 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 621–632（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；10-20% PEG 3350, 0.1-0.2 M sodium sulfate and 0.1 M citrate, pH 4.6-5.9
分辨率 1.92 Å R-free 0.211
7Z71 Crystal structure of p63 DBD in complex with darpin C14 提交 2022-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 68–269（202 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.181
7Z71 Crystal structure of p63 DBD in complex with darpin C14 提交 2022-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 68–269（202 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25% PEG 3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.181
7Z72 Crystal structure of p63 SAM in complex with darpin A5 提交 2022-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 460–526（67 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；293.15 K；25% PEG3350, 0.1 M citrate pH 3.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.188
7Z73 Crystal structure of p63 tetramerization domain in complex with darpin 8F1 提交 2022-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 303–361（59 aa）
链 B 303–361（59 aa）
链 C 303–361（59 aa）
链 D 303–361（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；25% PEG3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M bis-tris pH 5.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.235
7Z7E Crystal structure of p63 DNA binding domain in complex with inhibitory DARPin G4 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 68–269（202 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；25% PEG 3350 0.2M Li2SO4 0.1M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.249
8P9C Crystal structure of p63-p73 heterotetramer (tetramerisation domain) in complex with darpin 1810 F11 提交 2023-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 397–455（59 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.2M ammonium acetate, 25% PEG3350, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.76 Å R-free 0.210
8P9D Crystal structure of p63-p73 heterotetramer (tetramerisation domain) in complex with darpin 1810 A2 提交 2023-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 397–455（59 aa）
链 C 397–455（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；20% PEG3350, 0.1M bis-tris propane pH 7.0, 0.2M salicylic, sodium salt
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
8P9E Crystal structure of wild type p63-p73 heterotetramer (tetramerisation domain) in complex with darpin 1810 F11 提交 2023-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：trimeric
链 A 303–361（59 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.2M sodium chloride, 25% PEG3350, 0.1M bis-tris pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.250
9GFO iASPP-CTD fusion to p63 peptide 提交 2024-08-12 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 373–381（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2 M sodium formate and 0.1 M TRIS pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.280
9GFO iASPP-CTD fusion to p63 peptide 提交 2024-08-12 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 BBB 373–381（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2 M sodium formate and 0.1 M TRIS pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.280
9GFO iASPP-CTD fusion to p63 peptide 提交 2024-08-12 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 CCC 373–381（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2 M sodium formate and 0.1 M TRIS pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.280
9GFO iASPP-CTD fusion to p63 peptide 提交 2024-08-12 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 DDD 373–381（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2 M sodium formate and 0.1 M TRIS pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.280
9N54 Bipartite p63 NLS in complex with Importin Alpha 2 提交 2025-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 278–302（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；296 K；0.65 M sodium citrate, 0.1 M HEPES and 10 mM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.206

共 25 个其他 PDB 条目、36 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 P73L_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–75； UniProt 501–575

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1rg6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1rg6
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1rg6
沉积日期 deposition_date2003-11-11
结构标题 titleSolution structure of the C-terminal domain of p63
关键词 keywordsP73 SAM-LIKE DOMAIN, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier11.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron11.62 Å
零角强度 I(0) i0330702000.00
分子量 molecular_weight154840.0 kDa
排除体积 excluded_volume193780 ų
包络体积 envelope_volume17571 ų
水化壳体积 shell_volume11248 ų
包络直径 envelope_diameter45.6 Å
壳层 Rg shell_rg19.12 Å
包络 Rg envelope_rg14.03 Å
形状 Rg shape_rg11.62 Å
总 Rg total_rg11.79 Å
总原子数 total_atoms21420
残基数 n_residues1340
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax44.9 Å
Rg (实空间) rg_real11.91 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.36 Å
I(0) (实空间) i0_real3.3070e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.5960e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal11.91 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal330700000.0000
解质量估计 total_estimate0.7548
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary37.5 Å
偏度 Skewness skewness0.069
峰度 Kurtosis kurtosis-0.095
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha125800.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.274; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.991
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1rg6a_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.60 — SAM domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.60.1 — SAM/Pointed domain
家族 Family familya.60.1.2 — SAM (sterile alpha motif) domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1rg6A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — Transcription Factor, Ets-1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)