1shz

Crystal Structure of the p115RhoGEF rgRGS Domain in A Complex with Galpha(13):Galpha(i1) Chimera

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 111.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 21–47 链 A； UniProt 185–210 链 A； UniProt 213–230 链 A； UniProt 240–353	片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	Rho guanine nucleotide exchange factor 1 × 1 （Q92888） MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
2	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 21–47 链 D； UniProt 185–210 链 D； UniProt 213–230 链 D； UniProt 240–353	片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	Rho guanine nucleotide exchange factor 1 × 1 （Q92888） MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
3	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 21–47 链 A； UniProt 185–210 链 A； UniProt 213–230 链 A； UniProt 240–353 链 D； UniProt 21–47 链 D； UniProt 185–210 链 D； UniProt 213–230 链 D； UniProt 240–353	片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	Rho guanine nucleotide exchange factor 1 × 2 （Q92888） MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1SHZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AGR COMPLEX OF ALF4-ACTIVATED GI-ALPHA-1 WITH RGS4 提交 1997-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA-1	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；THE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING PEG 10000 AS THE PRECIPITANT AND SODIUM CITRATE PH 5.3 AS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.80 Å R-free 0.291
1AGR COMPLEX OF ALF4-ACTIVATED GI-ALPHA-1 WITH RGS4 提交 1997-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–353（353 aa）片段：ALPHA-1	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；THE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING PEG 10000 AS THE PRECIPITANT AND SODIUM CITRATE PH 5.3 AS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.80 Å R-free 0.291
1AS0 GTP-GAMMA-S BOUND G42V GIA1 提交 1997-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：G42V	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；THE PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING 4M (NH4)2SO3 AS THE PRECIPITANT. 50 MM HEPES, PH 8.0, 10 MM MGSO4, 10 MM DTT AND 0.2 MM GTP-GAMMA-S WAS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.00 Å R-free 0.259
1AS2 GDP+PI BOUND G42V GIA1 提交 1997-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：G42V	PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；THE PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING 3M (NH4)H2P04 AS THE PRECIPITANT (PH 5.6). 50 MM HEPES, PH 8.0, 10 MM MGSO4, 10 MM DTT AND 5 MM GDP WAS THE BUFFER, vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.80 Å R-free 0.250
1AS3 GDP BOUND G42V GIA1 提交 1997-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：G42V	SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；THE PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING 4M (NH4)2SO3 AS THE PRECIPITANT. 50 MM HEPES, PH 8.0, 10 MM MGSO4, 10 MM DTT AND 5 MM GDP WAS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.40 Å R-free 0.274
1BH2 A326S MUTANT OF AN INHIBITORY ALPHA SUBUNIT 提交 1998-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–345（315 aa）	突变：A326S	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M SODIUM ACETATE, PH 6.0, 2.0-2.1 M AMMONIUM SULFITE	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
1BOF GI-ALPHA-1 BOUND TO GDP AND MAGNESIUM 提交 1998-08-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
1CIP GI-ALPHA-1 SUBUNIT OF GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH A GTP ANALOGUE 提交 1999-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–354（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；PROTEIN BOUND TO GPPNHP WAS CRYSTALLIZED IN 1.8-2.0M (NH4)2SO3, 100MM SODIUM ACETATE, H 6.0, 1MM MGSO4, 1MM GPPNHP, AND 5MM DTT. PRIOR TO DATA COLLECTION CRYSTALS WERE TRANSFERED TO 2.0M LI2SO4, 1MM GPPNHP, 3MM DTT, 1MM MGSO4, 100MM BES, PH 7.0, AND 15% GLYCEROL. CRYSTALS WERE FLASH FROZEN IN LIQUID PROPANE.	分辨率 1.50 Å R-free 0.235
1FQJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTRIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, THE GAMMA SUBUNIT OF PHOSPHODIESTERASE AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(PDEGAMMA)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；15.0% PEG8000, 200mM Tris pH9.0, 0.2% beta-ME, 1mM (NH4)2WS4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.02 Å R-free 0.265
1FQJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTRIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, THE GAMMA SUBUNIT OF PHOSPHODIESTERASE AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(PDEGAMMA)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；15.0% PEG8000, 200mM Tris pH9.0, 0.2% beta-ME, 1mM (NH4)2WS4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.02 Å R-free 0.265
1FQK CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% PEG8000, 110mM magnesium acetate, 50mM Tris pH 8.5, 0.2% beta-ME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.268
1FQK CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% PEG8000, 110mM magnesium acetate, 50mM Tris pH 8.5, 0.2% beta-ME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.268
1GDD TERTIARY AND QUATERNARY STRUCTURAL CHANGES IN GIA1 INDUCED BY GTP HYDROLYSIS 提交 1995-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.291
1GFI STRUCTURES OF ACTIVE CONFORMATIONS OF GI ALPHA 1 AND THE MECHANISM OF GTP HYDROLYSIS 提交 1994-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.284
1GG2 G PROTEIN HETEROTRIMER MUTANT GI_ALPHA_1(G203A) BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA 1	突变：CHAIN A, G203A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.40 Å R-free 0.289
1GIA STRUCTURE OF ACTIVE CONFORMATIONS OF GIA1 AND THE MECHANISM OF GTP HYDROLYSIS 提交 1994-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
1GIL STRUCTURE OF ACTIVE CONFORMATIONS OF GIA1 AND THE MECHANISM OF GTP HYDROLYSIS 提交 1995-01-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.302
1GIT STRUCTURE OF GTP-BINDING PROTEIN 提交 1996-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA 1	突变：G203A	PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.279
1GP2 G PROTEIN HETEROTRIMER GI_ALPHA_1 BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA 1	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
1SVK Structure of the K180P mutant of Gi alpha subunit bound to AlF4 and GDP 提交 2004-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：K180P	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；293.16 K；Ammonium Sulphite, Sodium Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.16K, pH 6.50	分辨率 2.00 Å R-free 0.239
1SVS Structure of the K180P mutant of Gi alpha subunit bound to GppNHp. 提交 2004-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：K180P	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.16 K；Ammonium Sulphite, Sodium Acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.16K	分辨率 1.50 Å R-free 0.209
2BCJ Crystal Structure of G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Galpha-q and Gbetagamma Subunits 提交 2005-10-19	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 1–28（28 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG8000, 1M NaCl, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.06 Å R-free 0.292
2RGN Crystal Structure of p63RhoGEF complex with Galpha-q and RhoA 提交 2007-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–28（28 aa）片段：;Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353,Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353 ;	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM HEPES pH 6.5, 14.5% PEG 3350, 400 mM KCl. Drops were microseeded to obtain large crystals, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.299
2RGN Crystal Structure of p63RhoGEF complex with Galpha-q and RhoA 提交 2007-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–28（28 aa）片段：;Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353,Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353 ;	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM HEPES pH 6.5, 14.5% PEG 3350, 400 mM KCl. Drops were microseeded to obtain large crystals, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.299
2ZJY Structure of the K349P mutant of Gi alpha 1 subunit bound to ALF4 and GDP 提交 2008-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：K349P	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
2ZJZ Structure of the K349P mutant of Gi alpha 1 subunit bound to GDP 提交 2008-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–354（354 aa）链 B 1–354（354 aa）	突变：K349P 突变：K349P	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.282
3AH8 Structure of heterotrimeric G protein Galpha-q beta gamma in complex with an inhibitor YM-254890 提交 2010-04-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–28（27 aa）片段：UNP entry P10824 residues 2-28, UNP entry P21279 residues 37-359	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.1；293 K；7% PEG 4000, 30% (v/v) glycerol, 70 mM acetate-NaOH, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.315
3D7M Crystal Structure of the G Protein Fast-Exchange Double Mutant I56C/Q333C 提交 2008-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：I56C, Q333C	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；16% PEG 3350, 0.24 M Li(CH3COO), 0.1 M Bis-Tris, 0.01 M SrCl2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.294
3FFA Crystal Structure of a fast activating G protein mutant 提交 2008-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–348（316 aa）	突变：T329A	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；100 mM Sodium Acetate pH 5.9-6.3, 1.8-2.1 M Ammonium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K, pH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.252
3FFB Gi-alpha-1 mutant in GDP bound form 提交 2008-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 6–354（349 aa）	突变：T329A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；100 mM Sodium Acetate pH 5.9-6.3, 1.8-2.1 M Ammonium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K, pH 6.0	分辨率 2.57 Å R-free 0.226
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
4N0D Crystal structure of the K345L variant of the Gi alpha1 subunit bound to GTPgammaS 提交 2013-10-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：K345L	SO3 SULFITE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；2.2 M ammonium sulfite, pH 8.0, 20 mM magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.55 Å R-free 0.187
4N0E Crystal structure of the K345L variant of the Gi alpha1 subunit bound to GDP 提交 2013-10-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：K345L	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；2.0 ammonium sulfite, pH 8.0, 5 mM MgSO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
4PAM A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336C	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO3 SULFITE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.10 Å R-free 0.218
4PAN A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336Y	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO3 SULFITE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.40 Å R-free 0.232
4PAO A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336C	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4PAQ A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336Y	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.207
5KDL Crystal structure of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit bound to GTPgammaS 提交 2016-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；12-16 % polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether, 18% 2-propanol and 100 mM MES (pH 6.0)	分辨率 2.67 Å R-free 0.265
5KDL Crystal structure of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit bound to GTPgammaS 提交 2016-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–354（354 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；12-16 % polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether, 18% 2-propanol and 100 mM MES (pH 6.0)	分辨率 2.67 Å R-free 0.265
5KDO Heterotrimeric complex of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit and the Gbeta1-Ggamma1 提交 2016-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；19-24 % PEG 8000, 1-5% 2-propanolol, 1% OG, 100 mM HEPES (pH 7.0) and 100 mM NaOAc (pH 6.4)	分辨率 1.90 Å R-free 0.208
6M8H Crystal Structure of the R208Q mutant of G(i) subunit alpha-1 提交 2018-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：R208Q	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；297 K；2.0 M (NH4)2SO3 pH 8.0	分辨率 2.07 Å R-free 0.197
6TYL Crystal structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–354（354 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate	分辨率 3.30 Å R-free 0.287
6TYL Crystal structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–354（354 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate	分辨率 3.30 Å R-free 0.287
6UKT Cryo-EM structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 32–354（323 aa）片段：UNP residues 32-354	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.87 Å
6VMS Structure of a D2 dopamine receptor-G-protein complex in a lipid membrane 提交 2020-01-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	08Y bromoergocryptine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7S0F Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi protein 提交 2021-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：G203A	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.96 Å
7S0G Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi/s chimera protein 提交 2021-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–343（343 aa）	突变：G203A	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
9CBL Cryo-EM structure of epinephrine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：G203A	ALE L-EPINEPHRINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9CBM Cryo-EM structure of dexmedetomidine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：G203A	CZX 4-[(1~{S})-1-(2,3-dimethylphenyl)ethyl]-1~{H}-imidazole × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 43 个其他 PDB 条目、55 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBI1_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–27； UniProt 21–47 作者链 A； PDB构建体 172–197； UniProt 185–210 作者链 A； PDB构建体 200–217； UniProt 213–230 作者链 A； PDB构建体 227–340； UniProt 240–353 作者链 D； PDB构建体 1–27； UniProt 21–47 作者链 D； PDB构建体 172–197； UniProt 185–210 作者链 D； PDB构建体 200–217； UniProt 213–230 作者链 D； PDB构建体 227–340； UniProt 240–353

Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera

Mus musculus

UniProt P27601

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 64–207 链 A； UniProt 234–235 链 A； UniProt 254–262	片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	Rho guanine nucleotide exchange factor 1 × 1 （Q92888） MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
2	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 64–207 链 D； UniProt 234–235 链 D； UniProt 254–262	片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	Rho guanine nucleotide exchange factor 1 × 1 （Q92888） MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
3	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 64–207 链 A； UniProt 234–235 链 A； UniProt 254–262 链 D； UniProt 64–207 链 D； UniProt 234–235 链 D； UniProt 254–262	片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	Rho guanine nucleotide exchange factor 1 × 2 （Q92888） MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1SHZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ZCB Crystal structure of G alpha 13 in complex with GDP 提交 2005-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–28（28 aa）片段：N-terminal residues 1-28 of G alpha i followed by residues 47-377 of G alpha 13 链 A 47–377（331 aa）片段：N-terminal residues 1-28 of G alpha i followed by residues 47-377 of G alpha 13	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；297 K；PEG 2000 (10%), Sodium Citrate pH 4.8 (100mM), NaCl (50 mM), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
3AB3 Crystal structure of p115RhoGEF RGS domain in complex with G alpha 13 提交 2009-11-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 47–377（331 aa）片段：UNP RESIDUES 1-28 (G ALPHA I), UNP RESIDUES 47-377 (G ALPHA 13)	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 4000, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.280
3AB3 Crystal structure of p115RhoGEF RGS domain in complex with G alpha 13 提交 2009-11-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 47–377（331 aa）片段：UNP RESIDUES 1-28 (G ALPHA I), UNP RESIDUES 47-377 (G ALPHA 13)	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 4000, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.280
3CX6 Crystal Structure of PDZRhoGEF rgRGS Domain in a Complex with Galpha-13 Bound to GDP 提交 2008-04-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 41–377（337 aa）片段：N-terminally truncated	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；22-27 % polyethylene glycol 4000 and 100 mM Na+ HEPES, pH 7.2-8.1, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.285
3CX7 Crystal Structure of PDZRhoGEF rgRGS Domain in a Complex with Galpha-13 Bound to GDP-AlF4 提交 2008-04-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 41–377（337 aa）片段：N-terminally truncated	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；293 K；18-23 % polyethylene glycol monomethyl ether 2000 and 100 mM Tris, pH 6.9-7.3, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.269
3CX8 Crystal Structure of PDZRhoGEF rgRGS Domain in a Complex with Galpha-13 Bound to GTP-gamma-S 提交 2008-04-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 41–377（337 aa）片段：N-terminally truncated	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17-24 % polyethylene glycol 8000 and 100 mM Na+ HEPES, pH 7.3-7.8, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.253

共 5 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GB13_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 28–171； UniProt 64–207 作者链 A； PDB构建体 198–199； UniProt 234–235 作者链 A； PDB构建体 218–226； UniProt 254–262 作者链 D； PDB构建体 28–171； UniProt 64–207 作者链 D； PDB构建体 198–199； UniProt 234–235 作者链 D； PDB构建体 218–226； UniProt 254–262

Rho guanine nucleotide exchange factor 1

Homo sapiens

UniProt Q92888

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 7–239	片段：N-terminal RhoGEF RGS (rgRGS) domain of p115RhoGEF (residues 7-239)	Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera × 1 （P10824,P27601） MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
2	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 7–239	片段：N-terminal RhoGEF RGS (rgRGS) domain of p115RhoGEF (residues 7-239)	Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera × 1 （P10824,P27601） MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
3	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 7–239 链 F； UniProt 7–239	片段：N-terminal RhoGEF RGS (rgRGS) domain of p115RhoGEF (residues 7-239)	Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera × 2 （P10824,P27601） MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1SHZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1IAP CRYSTAL STRUCTURE OF P115RHOGEF RGRGS DOMAIN 提交 2001-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 42–252（211 aa）片段：N-TERMINAL RGS DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；PEG 3350, ammonium formate, CHES, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.275
3AB3 Crystal structure of p115RhoGEF RGS domain in complex with G alpha 13 提交 2009-11-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–233（233 aa）片段：N-TERMINAL RGS HOMOLOGY DOMAIN	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 4000, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.280
3AB3 Crystal structure of p115RhoGEF RGS domain in complex with G alpha 13 提交 2009-11-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–233（233 aa）片段：N-TERMINAL RGS HOMOLOGY DOMAIN	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 4000, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.280
3ODO Crystal Structure of the DH/PH Domains of p115-RhoGEF 提交 2010-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 395–766（372 aa）片段：DH-PH domain RESIDUES 395-766	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.6-2.8M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3ODO Crystal Structure of the DH/PH Domains of p115-RhoGEF 提交 2010-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 395–766（372 aa）片段：DH-PH domain RESIDUES 395-766	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.6-2.8M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3ODW Crystal Structure of the Linker-DH/PH domains of p115-RhoGEF 提交 2010-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 240–766（527 aa）片段：UNP residues 240-766	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-26% PEG 3350, 0.2M ammonium sulfate, and 0.1M NaHEPES, pH 7.2-7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.289
3ODW Crystal Structure of the Linker-DH/PH domains of p115-RhoGEF 提交 2010-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 240–766（527 aa）片段：UNP residues 240-766	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-26% PEG 3350, 0.2M ammonium sulfate, and 0.1M NaHEPES, pH 7.2-7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.289
3ODX Crystal Structure of an N-terminally Truncated Linker-DH/PH Domains of p115-RhoGEF 提交 2010-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 353–766（414 aa）片段：UNP residues 353-766	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-18% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, and 0.1M NaHEPES, pH 6.2-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.274
3ODX Crystal Structure of an N-terminally Truncated Linker-DH/PH Domains of p115-RhoGEF 提交 2010-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 353–766（414 aa）片段：UNP residues 353-766	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-18% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, and 0.1M NaHEPES, pH 6.2-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.274
3P6A Crystal Structure of the DH/PH domains of p115-RhoGEF (R399E mutant) 提交 2010-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 395–766（372 aa）片段：UNP residues 377-748	突变：R399E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 293 K；2.7-3.0M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266
3P6A Crystal Structure of the DH/PH domains of p115-RhoGEF (R399E mutant) 提交 2010-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 395–766（372 aa）片段：UNP residues 377-748	突变：R399E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 293 K；2.7-3.0M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266

共 6 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARHG1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–233； UniProt 7–239 作者链 F； PDB构建体 1–233； UniProt 7–239

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1shz
沉积日期 deposition_date	2004-02-26
结构标题 title	Crystal Structure of the p115RhoGEF rgRGS Domain in A Complex with Galpha(13):Galpha(i1) Chimera
关键词 keywords	SIGNAL TRANSDUCTION, PROTEIN COMPLEX, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.88 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	33.59 Å
零角强度 I(0) i0	230686000.00
分子量 molecular_weight	121190.0 kDa
排除体积 excluded_volume	151320 Å³
包络体积 envelope_volume	197800 Å³
水化壳体积 shell_volume	48590 Å³
包络直径 envelope_diameter	121.6 Å
壳层 Rg shell_rg	40.68 Å
包络 Rg envelope_rg	33.74 Å
形状 Rg shape_rg	33.61 Å
总 Rg total_rg	34.05 Å
总原子数 total_atoms	8518
残基数 n_residues	1037
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	111.9 Å
Rg (实空间) rg_real	33.83 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.75 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3070e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.7530e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	230700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8915
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	40.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.301
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.354
角度范围 angular_range	— – 0.2350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	97920000.0000
实空间数据点数 n_real_points	48
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.961

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera
分子量 formula_weight	39640.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	8602

NLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTFLKQMRIIHGQDFDQRAREEFRPTIYSNVIKGMRVLVDAREKLHIPWGDNKNQLHGDKLMAFDTRAPMAAQGMVETRVFLQYLPAIRALWEDSGIQNAYDRRREFQLGESVKYFLDNLDKLGVPDYIPSQQDILLARRPTKGIHETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWFECFEGVTAIIFCVALSDYDQVLMEDRQTNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse, Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Rho guanine nucleotide exchange factor 1
分子量 formula_weight	26346.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

GAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSGDKK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	TETRAFLUOROALUMINATE ION
分子量 formula_weight	103.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	84

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1shza1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.66 — Transducin (alpha subunit), insertion domain
超家族 Superfamily superfamily	a.66.1 — Transducin (alpha subunit), insertion domain
家族 Family family	a.66.1.1 — Transducin (alpha subunit), insertion domain

结构域编号 domain_id	d1shza2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1shzc_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.91 — Regulator of G-protein signaling, RGS
超家族 Superfamily superfamily	a.91.1 — Regulator of G-protein signaling, RGS
家族 Family family	a.91.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d1shzd1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.66 — Transducin (alpha subunit), insertion domain
超家族 Superfamily superfamily	a.66.1 — Transducin (alpha subunit), insertion domain
家族 Family family	a.66.1.1 — Transducin (alpha subunit), insertion domain

结构域编号 domain_id	d1shzd2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1shzf_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.91 — Regulator of G-protein signaling, RGS
超家族 Superfamily superfamily	a.91.1 — Regulator of G-protein signaling, RGS
家族 Family family	a.91.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1shzA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1shzA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	1shzC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	167 — Regulator of G-protein Signalling 4; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Regulator of G-protein Signalling 4, domain 2

结构域编号 domain_id	1shzD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1shzD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	1shzF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	167 — Regulator of G-protein Signalling 4; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Regulator of G-protein Signalling 4, domain 2

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	199.747 Å
晶胞边长 b length_b	105.274 Å
晶胞边长 c length_c	71.748 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	96.91 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.850 Å
最低分辨率 resolution_low	46.490 Å
R 因子 r_factor	0.2290
R_work r_work	0.2290
R_free r_free	0.2970

fit	/app/data/saxs_computation/sh/1shz/1shz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/sh/1shz/1shz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/sh/1shz/1shz.dat

Crystal Structure of the p115RhoGEF rgRGS Domain in A Complex with Galpha(13):Galpha(i1) Chimera

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Guanine Nucleotide-Binding Protein Galpha(13):Galpha(i1) Chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Rho guanine nucleotide exchange factor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)