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1GK8
Rubisco from Chlamydomonas reinhardtii
提交 2001-08-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 I
46–185(140 aa)
链 K
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 O
46–185(140 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 66
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;291 K;50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4000, 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG/ML PROTEIN
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.162
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1UW9
L290F-A222T chlamydomonas Rubisco mutant
提交 2004-02-03
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 C
46–185(140 aa)
链 F
46–185(140 aa)
链 I
46–185(140 aa)
链 J
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 P
46–185(140 aa)
链 T
46–185(140 aa)
链 W
46–185(140 aa)
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 55
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;291 K;0 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
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分辨率 2.05 Å
R-free 0.194
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1UWA
L290F mutant rubisco from chlamydomonas
提交 2004-02-03
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 C
46–185(140 aa)
链 F
46–185(140 aa)
链 I
46–185(140 aa)
链 J
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 P
46–185(140 aa)
链 T
46–185(140 aa)
链 W
46–185(140 aa)
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 59
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;291 K;HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.205
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1UZH
A CHIMERIC CHLAMYDOMONAS, SYNECHOCOCCUS RUBISCO ENZYME
提交 2004-03-12
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构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 C
46–91(46 aa)
链 C
117–185(69 aa)
链 F
46–91(46 aa)
链 F
117–185(69 aa)
链 I
46–91(46 aa)
链 I
117–185(69 aa)
链 J
46–91(46 aa)
链 J
117–185(69 aa)
链 M
46–91(46 aa)
链 M
117–185(69 aa)
链 P
46–91(46 aa)
链 P
117–185(69 aa)
链 T
46–91(46 aa)
链 T
117–185(69 aa)
链 W
46–91(46 aa)
链 W
117–185(69 aa)
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 50
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;291 K;50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
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分辨率 2.20 Å
R-free 0.193
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2V63
Crystal structure of Rubisco from Chlamydomonas reinhardtii with a large-subunit V331A mutation
提交 2007-07-13
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 I
46–185(140 aa)
链 J
46–185(140 aa)
链 K
46–185(140 aa)
链 L
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 N
46–185(140 aa)
链 O
46–185(140 aa)
链 P
46–185(140 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
MG MAGNESIUM ION × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 46
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.214
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2V67
Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit supressor mutation T342I
提交 2007-07-13
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 I
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 J
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 K
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 L
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 M
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 N
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 O
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 P
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 58
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.208
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2V68
Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with large- subunit mutations V331A, T342I
提交 2007-07-13
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 I
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 J
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 K
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 L
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 M
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 N
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 O
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
链 P
46–185(140 aa)
片段:RESIDUES 46-185
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 49
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.203
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2V69
Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit mutation D473E
提交 2007-07-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
|
链 I
46–185(140 aa)
链 J
46–185(140 aa)
链 K
46–185(140 aa)
链 L
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 N
46–185(140 aa)
链 O
46–185(140 aa)
链 P
46–185(140 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
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分辨率 2.80 Å
R-free 0.228
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2V6A
Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with large- subunit mutations V331A, G344S
提交 2007-07-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 I
46–185(140 aa)
链 J
46–185(140 aa)
链 K
46–185(140 aa)
链 L
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 N
46–185(140 aa)
链 O
46–185(140 aa)
链 P
46–185(140 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 59
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
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分辨率 1.50 Å
R-free 0.192
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2VDH
Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit C172S mutation
提交 2007-10-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
|
链 I
46–185(140 aa)
链 J
46–185(140 aa)
链 K
46–185(140 aa)
链 L
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 N
46–185(140 aa)
链 O
46–185(140 aa)
链 P
46–185(140 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 57
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.203
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2VDI
Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit C192S mutation
提交 2007-10-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
|
链 I
46–185(140 aa)
链 J
46–185(140 aa)
链 K
46–185(140 aa)
链 L
46–185(140 aa)
链 M
46–185(140 aa)
链 N
46–185(140 aa)
链 O
46–185(140 aa)
链 P
46–185(140 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 8
CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 43
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
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分辨率 2.65 Å
R-free 0.234
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9HVM
In-cell Structure of Pyrenoid Rubisco
提交 2024-12-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:16-meric
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链 B
46–177(132 aa)
链 D
46–177(132 aa)
链 F
46–177(132 aa)
链 H
46–177(132 aa)
链 J
46–177(132 aa)
链 L
46–177(132 aa)
链 N
46–177(132 aa)
链 P
46–177(132 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 8.10 Å
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