SAXSdb — 1vrc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PTS system, mannose-specific IIAB component

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–132 链 B； UniProt 1–132	片段：EIIA DOMAIN	Phosphocarrier protein HPr × 2 （P0AA04） PO3 PHOSPHITE ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）40 mM SODIUM PHOSPHATE	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1VRC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1PDO PHOSPHOENOLPYRUVATE-DEPENDENT PHOSPHOTRANSFERASE SYSTEM 提交 1996-03-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–132（132 aa）片段：IIA ==MAN== DOMAIN, RESIDUES 2 - 133, OF THE IIAB ==MAN== SUBUNIT PLUS PHE-ALA-GLY AT THE CARBOXY TERMINUS	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8	分辨率 1.70 Å R-free 0.244
1VSQ Solution NMR structure of the productive complex between IIAMannose and IIBMannose of the mannose transporter of the E. coli phosphotransferase system 提交 2008-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–134（133 aa）链 B 2–134（133 aa）链 C 159–323（165 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM phosphate；压力 ambient NMR样品组成 0.5-1 mM IIAMan(H10E)+IIBMan, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5-1 mM IIAMan(H10E)+IIBMan, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2JZH structure of IIB domain of the mannose transporter of E. coli 提交 2008-01-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 154–323（170 aa）片段：PTS EIIB type-4 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient NMR样品组成 0.5-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, sodium phosphate, sodium azide, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.5-1 mM [U-100% 15N] protein, sodium phosphate, sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2JZN Solution NMR structure of the productive complex between IIAMannose and IIBMannose of the mannose transporter of the E. coli phosphotransferase system 提交 2008-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–134（133 aa）链 B 2–134（133 aa）链 C 159–323（165 aa）	突变：H10E 突变：H10E	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM phosphate；压力 ambient NMR样品组成 0.5-1 mM see details IIAMan(H10E)+IIBMan, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.5-1 mM see details IIAMan(H10E)+IIBMan, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2JZO Solution NMR structure of the non-productive complex between IIAMannose and IIBMannose of the mannose transporter of the E. coli phosphotransferase system 提交 2008-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–134（133 aa）片段：PTS EIIB type-4 domain 链 B 2–134（133 aa）片段：PTS EIIB type-4 domain 链 D 159–323（165 aa）片段：PTS EIIA type-4 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM phosphate；压力 ambient NMR样品组成 0.5-1 mM IIAMan+IIBMan, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5-1 mM IIAMan+IIBMan, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PTNAB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–133； UniProt 1–132 作者链 B； PDB构建体 2–133； UniProt 1–132

Phosphocarrier protein HPr

Escherichia coli

UniProt P0AA04

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–85 链 D； UniProt 1–85	未记录	PTS system, mannose-specific IIAB component × 2 （P69797） PO3 PHOSPHITE ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）40 mM SODIUM PHOSPHATE	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1VRC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CM2 STRUCTURE OF HIS15ASP HPR AFTER HYDROLYSIS OF RINGED SPECIES. 提交 1999-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	突变：HIS15ASP	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.80 Å
1CM3 HIS15ASP HPR FROM E. COLI 提交 1999-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	突变：HIS15ASP	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.60 Å
1GGR COMPLEX OF ENZYME IIAGLC AND THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI NMR, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 2000-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–85（85 aa）	未记录	PO3 PHOSPHITE ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；308 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM SODIUM PHOSPHATE	分辨率未提供
1HDN THE HIGH-RESOLUTION STRUCTURE OF THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI DETERMINED BY RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS FROM NMR NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT DATA 提交 1994-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1J6T COMPLEX OF ENZYME IIAMTL AND THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI NMR, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–85（85 aa）	未记录	PO3 PHOSPHITE ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM SODIUM PHOSPHATE	分辨率未提供
1OPD HISTIDINE-CONTAINING PROTEIN (HPR), MUTANT WITH SER 46 REPLACED BY ASP (S46D) 提交 1996-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	突变：S46D	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.50 Å R-free 0.234
1PFH THE PHOSPHORYLATED FORM OF THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR 提交 1995-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1POH THE 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR: A REDETERMINATION 提交 1993-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
2JEL JEL42 FAB/HPR COMPLEX 提交 1998-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 1–85（85 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；pH 5.8	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2LRK Solution Structures of the IIA(Chitobiose)-HPr complex of the N,N'-Diacetylchitobiose 提交 2012-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] HPr/IIAChb complex, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HPR/IIAChb complex, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HPR/IIAChb complex, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] HPr/IIAChb complex, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HPR/IIAChb complex, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HPR/IIAChb complex, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LRL Solution Structures of the IIA(Chitobiose)-HPr complex of the N,N'-Diacetylchitobiose Branch of the Escherichia coli Phosphotransferase System 提交 2012-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–85（85 aa）	未记录	PO3 PHOSPHITE ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 1.0 mM D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
3CCD 1.0 A Structure of Post-Succinimide His15Asp HPr 提交 2008-02-25	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–85（85 aa）链 B 1–85（85 aa）	突变：His15Asp 突变：His15Asp	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；287 K；0.1M citrate phosphate buffer, 25% saturated ammonium sulphate, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K	分辨率 1.00 Å R-free 0.205
3CCD 1.0 A Structure of Post-Succinimide His15Asp HPr 提交 2008-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	突变：His15Asp	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；287 K；0.1M citrate phosphate buffer, 25% saturated ammonium sulphate, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K	分辨率 1.00 Å R-free 0.205
3CCD 1.0 A Structure of Post-Succinimide His15Asp HPr 提交 2008-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–85（85 aa）	突变：His15Asp	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；287 K；0.1M citrate phosphate buffer, 25% saturated ammonium sulphate, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K	分辨率 1.00 Å R-free 0.205
3EZA COMPLEX OF THE AMINO TERMINAL DOMAIN OF ENZYME I AND THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI NMR, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 1998-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；313 K	分辨率未提供
3EZB COMPLEX OF THE AMINO TERMINAL DOMAIN OF ENZYME I AND THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1998-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；313 K	分辨率未提供
3EZE COMPLEX OF THE AMINO TERMINAL DOMAIN OF ENZYME I AND THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI NMR, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 1998-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–85（85 aa）	未记录	PO3 PHOSPHITE ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；313 K	分辨率未提供
4XWJ Histidine-containing phosphocarrier protein (HPr) and antisigma factor Rsd complex 提交 2015-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–85（85 aa）	突变：F2S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287.15 K；0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES (pH 7.5), 1.6 M ammonium sulfate	分辨率 2.10 Å R-free 0.299
5YA0 Crystal structure of LsrK and HPr complex 提交 2017-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–85（85 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；5~20% (v/v) PEG-400, 0.1 M sodium phosphate-citrate (pH 4.2), and 0.2 M lithium sulfate	分辨率 3.00 Å R-free 0.239
5YA0 Crystal structure of LsrK and HPr complex 提交 2017-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–85（85 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；293 K；5~20% (v/v) PEG-400, 0.1 M sodium phosphate-citrate (pH 4.2), and 0.2 M lithium sulfate	分辨率 3.00 Å R-free 0.239
5YA1 crystal structure of LsrK-HPr complex with ATP 提交 2017-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–85（85 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5~20% (v/v) PEG-400, 0.1M sodium phosphate-citrate (pH 4.2), 0.2M lithium sulfate	分辨率 2.70 Å R-free 0.254
5YA1 crystal structure of LsrK-HPr complex with ATP 提交 2017-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–85（85 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5~20% (v/v) PEG-400, 0.1M sodium phosphate-citrate (pH 4.2), 0.2M lithium sulfate	分辨率 2.70 Å R-free 0.254
5YA2 Crystal structure of LsrK-HPr complex with ADP 提交 2017-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–85（85 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5~20%(v/v) PEG-400, 0.1M sodium phosphate-citrate (pH 4.2), 0.2M lithium sulfate	分辨率 2.70 Å R-free 0.255
5YA2 Crystal structure of LsrK-HPr complex with ADP 提交 2017-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–85（85 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5~20%(v/v) PEG-400, 0.1M sodium phosphate-citrate (pH 4.2), 0.2M lithium sulfate	分辨率 2.70 Å R-free 0.255
6KCR X-ray structure of the MtlR-HPr complex from Escherichia coli 提交 2019-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 200 mM Mg-acetate, 15% polyethylene glycol (PEG) 8000	分辨率 3.50 Å R-free 0.260
6KCR X-ray structure of the MtlR-HPr complex from Escherichia coli 提交 2019-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 200 mM Mg-acetate, 15% polyethylene glycol (PEG) 8000	分辨率 3.50 Å R-free 0.260
9S8B Structure of glycogen phosphorylase - dimeric form - in complex with HPr from Escherichia coli 提交 2025-08-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–85（85 aa）链 D 1–85（85 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.79 Å
9S8K Structure of glycogen phosphorylase - tetrameric form - in complex with HPr from Escherichia coli 提交 2025-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–85（85 aa）链 F 1–85（85 aa）链 G 1–85（85 aa）链 H 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.06 Å

共 22 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PTHP_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–85； UniProt 1–85 作者链 D； PDB构建体 1–85； UniProt 1–85

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1vrc
沉积日期 deposition_date	2005-02-21
结构标题 title	Complex of enzyme IIAmannose and the histidine-containing phosphocarrier protein HPr from escherichia coli nmr, restrained regularized mean structure
关键词 keywords	PHOSPHOTRANSFERASE, TRANSFERASE, KINASE, SUGAR TRANSPORT, COMPLEX (TRANSFERASE-PHOSPHOCARRIER); TRANSFERASE
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	23.76 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	22.97 Å
零角强度 I(0) i0	124023000.00
分子量 molecular_weight	92479.0 kDa
排除体积 excluded_volume	116650 Å³
包络体积 envelope_volume	68290 Å³
水化壳体积 shell_volume	25271 Å³
包络直径 envelope_diameter	83.6 Å
壳层 Rg shell_rg	29.77 Å
包络 Rg envelope_rg	23.16 Å
形状 Rg shape_rg	22.97 Å
总 Rg total_rg	23.43 Å
总原子数 total_atoms	13076
残基数 n_residues	856
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	78.5 Å
Rg (实空间) rg_real	23.76 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.60 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.2400e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5700e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	23.76 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	124000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8114
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.372
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.258
角度范围 angular_range	— – 0.3350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7011000.0000
实空间数据点数 n_real_points	65
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.855; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PTS system, mannose-specific IIAB component
分子量 formula_weight	14755.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.1.69
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	13076

MTIAIVIGTHGWAAEQLLKTAEMLLGEQENVGWIDFVPGENAETLIEKYNAQLAKLDTTKGVLFLVDTWGGSPFNAASRIVVDKEHYEVIAGVNIPMLVETLMARDDDPSFDELVALAVETGREGVKALKAKPFAG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Phosphocarrier protein HPr
分子量 formula_weight	9129.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MFQQEVTITAPNGLHTRPAAQFVKEAKGFTSEITVTSNGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVVTISAEGEDEQKAVEHLVKLMAELE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	PHOSPHITE ION
分子量 formula_weight	79.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1vrca_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.54 — PTS system fructose IIA component-like
超家族 Superfamily superfamily	c.54.1 — PTS system fructose IIA component-like
家族 Family family	c.54.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d1vrcb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.54 — PTS system fructose IIA component-like
超家族 Superfamily superfamily	c.54.1 — PTS system fructose IIA component-like
家族 Family family	c.54.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d1vrcc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.94 — HPr-like
超家族 Superfamily superfamily	d.94.1 — HPr-like
家族 Family family	d.94.1.1 — HPr-like

结构域编号 domain_id	d1vrcd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.94 — HPr-like
超家族 Superfamily superfamily	d.94.1 — HPr-like
家族 Family family	d.94.1.1 — HPr-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1vrcA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	510 — Phosphotransferase system, mannose-type IIA component

结构域编号 domain_id	1vrcB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	510 — Phosphotransferase system, mannose-type IIA component

结构域编号 domain_id	1vrcC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1340 — Histidine-containing Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HPr-like

结构域编号 domain_id	1vrcD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1340 — Histidine-containing Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HPr-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

fit	/app/data/saxs_computation/vr/1vrc/1vrc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/vr/1vrc/1vrc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/vr/1vrc/1vrc.dat

Complex of enzyme IIAmannose and the histidine-containing phosphocarrier protein HPr from escherichia coli nmr, restrained regularized mean structure

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PTS system, mannose-specific IIAB component

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phosphocarrier protein HPr

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)