SAXSdb — 2bcw

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L11

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 7–71	片段：N-terminal domain	50S ribosomal protein L7/L12 × 1 （P0A7K2） Elongation factor G × 1 （P13551）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine；pH 7.5；20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine cryo-EM玻璃化条件：RAPID-FREEZING IN LIQUID ETHANE	分辨率 11.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2BCW	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EG0 FITTING OF COMPONENTS WITH KNOWN STRUCTURE INTO AN 11.5 A CRYO-EM MAP OF THE E.COLI 70S RIBOSOME 提交 2000-02-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：pentadecameric	链 K 1–140（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM Hepes, 6 mM Mg(CH3COO)2 150 mM NH4Cl, 4 mM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.50 Å
1JQM Fitting of L11 protein and elongation factor G (EF-G) in the cryo-em map of e. coli 70S ribosome bound with EF-G, GDP and fusidic acid 提交 2001-08-07	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6	分辨率 18.00 Å
1JQS Fitting of L11 protein and elongation factor G (domain G' and V) in the cryo-em map of E. coli 70S ribosome bound with EF-G and GMPPCP, a nonhydrolysable GTP analog 提交 2001-08-07	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 18.00 Å
1JQT Fitting of L11 protein in the low resolution cryo-EM map of E.coli 70S ribosome 提交 2001-08-07	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–139（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 18.00 Å
1MMS Crystal structure of the ribosomal PROTEIN L11-RNA complex 提交 1999-04-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–140（140 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 10 MMC METHYL MERCURY ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；25% GLYCEROL, 15% PEG 4000, 50 MM TRIS PH 7.5, 50 MM MGCL2, 20 MM CDCL2, 0.2 M KCL, 1 MM DITHIOTHREITOL, 4 DEGREES C, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.57 Å R-free 0.254
1MMS Crystal structure of the ribosomal PROTEIN L11-RNA complex 提交 1999-04-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–140（140 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 9 MMC METHYL MERCURY ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；25% GLYCEROL, 15% PEG 4000, 50 MM TRIS PH 7.5, 50 MM MGCL2, 20 MM CDCL2, 0.2 M KCL, 1 MM DITHIOTHREITOL, 4 DEGREES C, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.57 Å R-free 0.254
1MVR Decoding Center & Peptidyl transferase center from the X-ray structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome, aligned to the low resolution Cryo-EM map of E.coli 70S Ribosome 提交 2002-09-26	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：octameric	链 L 1–140（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 polymix buffer；pH 7.5；polymix buffer cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane	分辨率 12.80 Å
1OLN Model for thiostrepton antibiotic binding to L11 substrate from 50S ribosomal RNA 提交 2003-08-08	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 A 2–141（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	实验方法未声明 NMR测量条件 pH 6.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）100 MM NACL, 5 MM MGCL2；压力 1	分辨率未提供
1PN7 Coordinates of S12, L11 proteins and P-tRNA, from the 70S X-ray structure aligned to the 70S Cryo-EM map of E.coli ribosome 提交 2003-06-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 L 7–139（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane	分辨率 10.80 Å
1PN8 Coordinates of S12, L11 proteins and E-site tRNA from 70S crystal structure separately fitted into the Cryo-EM map of E.coli 70S.EF-G.GDPNP complex. The atomic coordinates originally from the E-site tRNA were fitted in the position of the hybrid P/E-site tRNA. 提交 2003-06-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 L 7–139（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane	分辨率 10.80 Å
1R2W Coordinates of L11 with 58nts of 23S rRNA fitted into the cryo-EM map of the 70S ribosome 提交 2003-09-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–140（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 Polymix buffer；pH 7.5；Polymix buffer cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Rapid freezing in liquid ethane	分辨率 9.00 Å
1R2X Coordinates of L11 with 58nts of 23S rRNA fitted into the cryo-EM map of EF-Tu ternary complex (GDP.Kirromycin) bound 70S ribosome 提交 2003-09-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–140（140 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 Polymix buffer；pH 7.5；Polymix buffer cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Rapid freezing in liquid ethane	分辨率 9.00 Å
2JQ7 Model for thiostrepton binding to the ribosomal L11-RNA 提交 2007-05-30	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 A 1–141（141 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）220；压力 1 NMR样品组成 0.3 MM [U-13C, U-15N U-2H] RIBOSOMAL PROTEIN L11, 0.3 MM RIBOSOMAL RNA, 0.3 MM THIOSTREPTON ANTIBIOTIC, 20 MM POTASSIUM PHOSPHATE, 200 MM POTASSIUM CHLORIDE, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2K3F Ribosomal protein L11 from Thermotoga maritima 提交 2008-05-06	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–141（141 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 ambient NMR样品组成 1.2 mM [U-100% 15N] L11, 20 mM potassium phosphate, 50 mM potassium chloride, 10 % [U-100% 2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
487D SEVEN RIBOSOMAL PROTEINS FITTED TO A CRYO-ELECTRON MICROSCOPIC MAP OF THE LARGE 50S SUBUNIT AT 7.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2000-02-23	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 L 8–140（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 7.50 Å
4V42 Crystal structure of the ribosome at 5.5 A resolution. 提交 2001-03-30	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：49-meric	链 BL 1–141（141 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 5.50 Å

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UniProt名称	RL11_THEMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–65； UniProt 7–71

50S ribosomal protein L7/L12

物种未注明

UniProt P0A7K2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 53–120	片段：C-terminal domain	50S ribosomal protein L11 × 1 （P29395） Elongation factor G × 1 （P13551）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine；pH 7.5；20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine cryo-EM玻璃化条件：RAPID-FREEZING IN LIQUID ETHANE	分辨率 11.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2BCW	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CTF STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF THE RIBOSOMAL PROTEIN L7/L12 FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.7 ANGSTROMS 提交 1986-09-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 47–120（74 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å
1RQS NMR structure of C-terminal domain of ribosomal protein L7 from E.coli 提交 2003-12-07	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–120（74 aa）片段：C-Terminal Domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; 30 C \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 99.9% D2O; 30 C \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; 30 C; Tobacco virus alignment medium \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1RQT NMR structure of dimeric N-terminal domain of ribosomal protein L7 from E.coli 提交 2003-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–37（37 aa）片段：N-Terminal Domain 链 B 1–37（37 aa）片段：N-Terminal Domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; 30 C \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 99.9% D2O; 30 C \| 99.9% D2O	分辨率未提供
1RQU NMR structure of L7 dimer from E.coli 提交 2003-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）片段：L7 dimer 链 B 1–120（120 aa）片段：L7 dimer	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; 30 C \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 99.9% D2O; 30 C \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; 30 C; Tobacco virus alignment medium \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1RQV Spatial model of L7 dimer from E.coli with one hinge region in helical state 提交 2003-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）片段：L7 dimer 链 B 1–120（120 aa）片段：L7 dimer	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; 30 C \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 99.9% D2O; 30 C \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM L7 dimer U-15N; 50mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; 30 C; Tobacco virus alignment medium \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3J7Z Structure of the E. coli 50S subunit with ErmCL nascent chain 提交 2014-08-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 6 1–121（121 aa）	未记录	ERY ERYTHROMYCIN A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
4V4V Structure of a pre-translocational E. coli ribosome obtained by fitting atomic models for RNA and protein components into cryo-EM map EMD-1056 提交 2006-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：52-meric	链 B3 2–120（119 aa）链 B5 2–120（119 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；rapid-freezing in liquid ethane	分辨率 15.00 Å
4V4W Structure of a SecM-stalled E. coli ribosome complex obtained by fitting atomic models for RNA and protein components into cryo-EM map EMD-1143 提交 2006-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：52-meric	链 B3 3–121（119 aa）链 B5 3–121（119 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；rapid-freezing in liquid ethane	分辨率 15.00 Å
4V5M tRNA tranlocation on the 70S ribosome: the pre-translocational translocation intermediate TI(PRE) 提交 2010-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 BL 1–121（121 aa）	未记录	FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- VITROBOT (FEI)	分辨率 7.80 Å
4V5N tRNA translocation on the 70S ribosome: the post- translocational translocation intermediate TI(POST) 提交 2010-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 BL 1–121（121 aa）	未记录	FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- VITROBOT (FEI)	分辨率 7.60 Å
4V7B Visualization of two tRNAs trapped in transit during EF-G-mediated translocation 提交 2013-10-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：58-meric	链 B6 1–121（121 aa）	未记录	FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 80 mM HEPES potassium, 75 mM NH4Cl, 10 mM MgCl2, 6 mM BME；pH 7.6；80 mM HEPES potassium, 75 mM NH4Cl, 10 mM MgCl2, 6 mM BME cryo-EM玻璃化条件 blot for 5-10 seconds before plunging；96 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 5-10 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)	分辨率 6.80 Å
4V7D Structure of the Ribosome with Elongation Factor G Trapped in the Pre-Translocation State (pre-translocation 70StRNAEF-G structure) 提交 2013-11-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 AL 2–121（120 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 Polymix buffer；pH 7.6；10 mM HEPES-KOH, 5 mM MgCl2, 90 mM NH4Cl, 2 mM spermidine, 0.1 mM spermine, 6 mM BME, 0.5 mM viomycin, 0.5 mM GTP, 0.5 mM fusidic acid cryo-EM玻璃化条件 Freshly glow-disharged grids were loaded into an FEI Mark II Vitrobot and equilibrated to 95% relative humidity at 22 degrees Celsius. 2 microliters of sample was applied through the side port, blotted for 7 seconds with a positional offset of 2, and plunged into liquid ethane.；冷冻剂 ETHANE；Freshly glow-disharged grids were loaded into an FEI Mark II Vitrobot and equilibrated to 95% relative humidity at 22 degrees Celsius. 2 microliters of sample was applied through the side port, blotted for 7 seconds with a positional offset of 2, and plunged into liquid ethane.	分辨率 7.60 Å
4V89 Crystal Structure of Release Factor RF3 Trapped in the GTP State on a Rotated Conformation of the Ribosome (without viomycin) 提交 2011-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric	链 BJ 1–121（121 aa）链 BK 1–121（121 aa）链 BL 1–121（121 aa）链 BM 1–121（121 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Tris Ac PH.7.0 25-35 mM KCL 6.1% PEG 20000 %1 glycerol 50mM sucrose , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 3.70 Å R-free 0.290
4V9O Control of ribosomal subunit rotation by elongation factor G 提交 2013-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric	链 A6 1–121（121 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 187 ZN ZINC ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；291 K；PEG8k, MPD, KSCN, pH 6.5, microbatch, temperature 291K X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；291 K；PEG8k, MPD, KSCN, pH 6.5, microbatch, temperature 291K X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；291 K；PEG8k, MPD, KSCN, pH 6.5, microbatch, temperature 291K X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；291 K；PEG8k, KSCN, pH 6.5, microbatch, temperature 291K X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；291 K；PEG8k, KSCN, pH 6.5, microbatch, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
5KCS Cryo-EM structure of the Escherichia coli 70S ribosome in complex with antibiotic Evernimycin, mRNA, TetM and P-site tRNA at 3.9A resolution 提交 2016-06-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric	链 1L 1–121（121 aa）	未记录	EVN (2R,3R,4R,6S)-6-{[(2R,3aR,4R,4'R,5'S,6S,6'R,7S,7aR)-6-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-2-{[(2R,3S,4S,5S,6S)-6-({(2R,3aS,3a'R,6S,7R,7' R,7aS,7a'S)-7'-[(2,4-dihydroxy-6-methylbenzoyl)oxy]-7-hydroxyoctahydro-4H-2,4'-spirobi[[1,3]dioxolo[4,5-c]pyran]-6-yl}ox y)-4-hydroxy-5-methoxy-2-(methoxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]oxy}-3-hydroxy-5-methoxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-4- yl]oxy}-4',7-dihydroxy-4,6',7a-trimethyloctahydro-4H-spiro[1,3-dioxolo[4,5-c]pyran-2,2'-pyran]-5'-yl]oxy}-4-{[(2R,4S,5R, 6S)-5-methoxy-4,6-dimethyl-4-nitrotetrahydro-2H-pyran-2-yl]oxy}-2-methyltetrahydro-2H-pyran-3-yl 3,5-dichloro-4-hydroxy-2-methoxy-6-methylbenzoate (non-preferred name) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6I0Y TnaC-stalled ribosome complex with the titin I27 domain folding close to the ribosomal exit tunnel 提交 2018-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 6 1–121（121 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 143 ZN ZINC ION × 1 TRP TRYPTOPHAN × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7N2C Elongating 70S ribosome complex in a fusidic acid-stalled intermediate state of translocation bound to EF-G(GDP) (INT2) 提交 2021-05-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：61-meric	链 LG 1–121（121 aa）	未记录	PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 21 MG MAGNESIUM ION × 197 ZN ZINC ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SPD SPERMIDINE × 3 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8PHJ cA4-bound Cami1 in complex with 70S ribosome 提交 2023-06-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：61-meric	链 W 2–121（120 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 241	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL7_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–68； UniProt 53–120

Elongation factor G

物种未注明

UniProt P13551

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 200–257	片段：;A portion of G' domain' ;	50S ribosomal protein L11 × 1 （P29395） 50S ribosomal protein L7/L12 × 1 （P0A7K2）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine；pH 7.5；20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine cryo-EM玻璃化条件：RAPID-FREEZING IN LIQUID ETHANE	分辨率 11.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2BCW	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EFG THE CRYSTAL STRUCTURE OF ELONGATION FACTOR G COMPLEXED WITH GDP, AT 2.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1994-10-17	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–691（691 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；277 K；pH 7.8, temperature 277K	分辨率 2.70 Å R-free 0.396
1FNM STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS EF-G H573A 提交 2000-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：H573A	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；PEG 8000 (Fluka), guanosine 5'-diphophate, magnesium chloride , pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.80 Å R-free 0.295
1JQM Fitting of L11 protein and elongation factor G (EF-G) in the cryo-em map of e. coli 70S ribosome bound with EF-G, GDP and fusidic acid 提交 2001-08-07	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–691（691 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6	分辨率 18.00 Å
1JQS Fitting of L11 protein and elongation factor G (domain G' and V) in the cryo-em map of E. coli 70S ribosome bound with EF-G and GMPPCP, a nonhydrolysable GTP analog 提交 2001-08-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 220–251（32 aa）片段：;part of domain G' ; 链 C 606–673（68 aa）片段：domain V	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 18.00 Å
1KTV Crystal Structure of Elongation Factor G Dimer Without Nucleotide 提交 2002-01-17	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；PEG 8000, HEPES, Tris, Dithiothreitol, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.80 Å R-free 0.374
1KTV Crystal Structure of Elongation Factor G Dimer Without Nucleotide 提交 2002-01-17	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–691（691 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；PEG 8000, HEPES, Tris, Dithiothreitol, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.80 Å R-free 0.374
1PN6 Domain-wise fitting of the crystal structure of T.thermophilus EF-G into the low resolution map of the release complex.Puromycin.EFG.GDPNP of E.coli 70S ribosome. 提交 2003-06-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane	分辨率 10.80 Å
2BM0 Ribosomal elongation factor G (EF-G) Fusidic acid resistant mutant T84A 提交 2005-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：YES	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.3；17% PEG 8000 100 MM HEPES 46 MM TRIS-HCL PH 7.3	分辨率 2.40 Å R-free 0.274
2BM1 Ribosomal elongation factor G (EF-G) Fusidic acid resistant mutant G16V 提交 2005-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：YES	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.3；17 % PEG8000 100 MM HEPES 46 MM TRIS-HCL PH 7.3 10 MM MAGNESIUM CHLORIDE	分辨率 2.60 Å R-free 0.297
2BV3 Crystal structure of a mutant elongation factor G trapped with a GTP analogue 提交 2005-06-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.3；17 % PEG8000, 10 MM MGCL2, 100 MM GDPNP, 46 MM TRIS, 100 MM HEPES, pH 7.30	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
2EFG TRANSLATIONAL ELONGATION FACTOR G COMPLEXED WITH GDP 提交 1998-09-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–691（691 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；18% W/V PEG8000, 20MM TRIS-HCL, 20MM AMMONIUM ACETATE, 2MM DTT, 1MM SODIUM AZIDE, 1MM GDP, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.279
2J7K Crystal structure of the T84A mutant EF-G:GDPCP complex 提交 2006-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：YES	GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.3；17 % PEG8000 100 MM HEPES 46 MM TRIS 10 MM MGCL2 10 MM GDPCP, pH 7.3	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
2OM7 Structural Basis for Interaction of the Ribosome with the Switch Regions of GTP-bound Elongation Factors 提交 2007-01-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetradecameric	链 L 1–691（691 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 0.3 mM GMPPNP, 10 mM Hepes-KOH (pH 7.8), 10 mM Mg acetate, 60 mM NH4Cl, and 6 mM B-mercaptoethanol；pH 7.8；0.3 mM GMPPNP, 10 mM Hepes-KOH (pH 7.8), 10 mM Mg acetate, 60 mM NH4Cl, and 6 mM B-mercaptoethanol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
3IZP Conformation of EF-G during translocation 提交 2010-11-15	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–688（688 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；5 mM potassium phosphate, 5 mM magnesium acetate, 5 mM ammonium chloride, 95 mM potassium chloride, 0.5 mM calcium chloride, 8 mM putrescine, 1 mM spermidine, and 1 mM dithioerythritol cryo-EM玻璃化条件 two-face blotting for 1 second；90 K；冷冻剂 ETHANE	分辨率未提供
4M1K Crystal structure of elongation factor G (EFG) 提交 2013-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：Q500L	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；5mM Tris-HCl (pH 7.6), 10mM MgCl2, 5mM GDP, 20-23% PEG8000, 0.1M Tris-Cl PH7.5-7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.95 Å R-free 0.292
4MYT Crystal structure of elongation factor G (EFG) 提交 2013-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：E579A	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；5 mM Tris-HCl (pH 7.6), 10mM MgCl2, 5mM GDP, 20-23% PEG 8000, 0.1M Tris-Cl (PH 7.5-7.6), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.50 Å R-free 0.308
4MYU Crystal structure of elongation factor G mutant(EFG) 提交 2013-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–691（691 aa）	突变：H573K	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；5mM Tris-HCl (pH 7.6), 10mM MgCl2, 5mM GDP, 20-23% PEG 8000, 0.1M Tris-Cl (PH 7.5-7.6), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271

共 16 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EFG_THETH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–58； UniProt 200–257

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2bcw
沉积日期 deposition_date	2005-10-19
结构标题 title	Coordinates of the N-terminal domain of ribosomal protein L11,C-terminal domain of ribosomal protein L7/L12 and a portion of the G' domain of elongation factor G, as fitted into cryo-em map of an Escherichia coli 70SEF-GGDP*fusidic acid complex
关键词 keywords	Components involved in interaction between EF-G AND L7/L12 stalk base of the ribosome, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.10 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.97 Å
零角强度 I(0) i0	6651600.00
分子量 molecular_weight	20649.0 kDa
排除体积 excluded_volume	25497 Å³
包络体积 envelope_volume	18035 Å³
水化壳体积 shell_volume	9356 Å³
包络直径 envelope_diameter	75.8 Å
壳层 Rg shell_rg	22.03 Å
包络 Rg envelope_rg	19.30 Å
形状 Rg shape_rg	19.83 Å
总 Rg total_rg	20.22 Å
总原子数 total_atoms	—
残基数 n_residues	—
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	74.0 Å
Rg (实空间) rg_real	20.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.59 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.6510e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.7520e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.24 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6651000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8297
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.563
峰度 Kurtosis kurtosis	0.059
角度范围 angular_range	— – 0.3950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	980700.0000
实空间数据点数 n_real_points	71
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.699; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.694; Smooth: 0.992

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L11
分子量 formula_weight	7021.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	191

QIKLQLPAGKATPAPPVGPALGQHGVNIMEFCKRFNAETADKAGMILPVVITVYEDKSFTFIIKT

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L7/L12
分子量 formula_weight	6943.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

EFDVILKAAGANKVAVIKAVRGATGLGLKEAKDLVESAPAALKEGVSKDDAEALKKALEEAGAEVEVK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Elongation factor G
分子量 formula_weight	6710.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

PIPEEYLDQAREYHEKLVEVAADFDENIMLKYLEGEEPTEEELVAAIRKGTIDLKITP

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2bcwa1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.47 — Ribosomal L11/L12e N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	d.47.1 — Ribosomal L11/L12e N-terminal domain
家族 Family family	d.47.1.1 — Ribosomal L11/L12e N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d2bcwb1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.45 — ClpS-like
超家族 Superfamily superfamily	d.45.1 — ClpS-like
家族 Family family	d.45.1.1 — Ribosomal protein L7/12, C-terminal domain

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8. 引用文献 (4)

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分辨率 resolution	11.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	REFERENCE BASED ALIGNMENT
颗粒数 num_particles	—

fit	/app/data/saxs_computation/bc/2bcw/2bcw.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bc/2bcw/2bcw.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bc/2bcw/2bcw.dat

Coordinates of the N-terminal domain of ribosomal protein L11,C-terminal domain of ribosomal protein L7/L12 and a portion of the G' domain of elongation factor G, as fitted into cryo-em map of an Escherichia coli 70SEF-GGDP*fusidic acid complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

50S ribosomal protein L7/L12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Elongation factor G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

8. 引用文献 (4)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

Coordinates of the N-terminal domain of ribosomal protein L11,C-terminal domain of ribosomal protein L7/L12 and a portion of the G' domain of elongation factor G, as fitted into cryo-em map of an Escherichia coli 70S*EF-G*GDP*fusidic acid complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

50S ribosomal protein L7/L12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Elongation factor G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

8. 引用文献 (4)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

Coordinates of the N-terminal domain of ribosomal protein L11,C-terminal domain of ribosomal protein L7/L12 and a portion of the G' domain of elongation factor G, as fitted into cryo-em map of an Escherichia coli 70SEF-GGDP*fusidic acid complex