2boj

crystal Structure of pseudomonas aeruginosa lectin (PA-IIL) complexed with methyl-B-D-Arabinopyranoside

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PSEUDOMONAS AERUGINOSA LECTIN II

PSEUDOMONAS AERUGINOSA

UniProt Q9HYN5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 methyl beta-D-arabinopyranoside × 4 CALCIUM ION × 8 SULFATE ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9HYN5_PSEAE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–114; UniProt 2–115 作者链 B; PDB构建体 1–114; UniProt 2–115 作者链 C; PDB构建体 1–114; UniProt 2–115 作者链 D; PDB构建体 1–114; UniProt 2–115

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2boj
沉积日期 deposition_date2005-04-12
结构标题 titlecrystal Structure of pseudomonas aeruginosa lectin (PA-IIL) complexed with methyl-B-D-Arabinopyranoside
关键词 keywordsLECTIN, ARABINOSE, CALCIUM, LEWIS A, CYSTIC FIBROSIS; LECTIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2boj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2boj__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2boj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.51 Å
Rg(电子密度)21.00 Å
总 Rg21.93 Å
原子数3365
残基数456
排除体积59121 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2boj__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2boja_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamilyb.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family familyb.115.1.1 — Calcium-mediated lectin
结构域编号 domain_idd2bojb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamilyb.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family familyb.115.1.1 — Calcium-mediated lectin
结构域编号 domain_idd2bojc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamilyb.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family familyb.115.1.1 — Calcium-mediated lectin
结构域编号 domain_idd2bojd_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.115 — Calcium-mediated lectin
超家族 Superfamily superfamilyb.115.1 — Calcium-mediated lectin
家族 Family familyb.115.1.1 — Calcium-mediated lectin

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2bojA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily400 — Calcium-mediated lectin
结构域编号 domain_id2bojB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily400 — Calcium-mediated lectin
结构域编号 domain_id2bojC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily400 — Calcium-mediated lectin
结构域编号 domain_id2bojD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily400 — Calcium-mediated lectin

7. 引用文献 (2)