SAXSdb — 2col

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bifunctional hemolysin-adenylate cyclase

Bordetella pertussis

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 7–362	未记录	Calmodulin × 1 （P62155） MG MAGNESIUM ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；278 K；PEG4000, Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.20 Å R-free 0.293

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2COL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1YRT Crystal Structure analysis of the adenylyl cyclaes catalytic domain of adenylyl cyclase toxin of Bordetella pertussis in presence of c-terminal calmodulin 提交 2005-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–364（364 aa）片段：Calmodulin-sensitive adenylate cyclase	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；PEG4000, Isopropanol, Sodium Citrate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.270
1YRU Crystal Structure analysis of the adenylyl cyclaes catalytic domain of adenylyl cyclase toxin of Bordetella pertussis in presence of c-terminal calmodulin and 1mM calcium chloride 提交 2005-02-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–364（364 aa）片段：Calmodulin-sensitive adenylate cyclase	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；298 K；PEG2000, Tris, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.308
1ZOT crystal structure analysis of the CyaA/C-Cam with PMEAPP 提交 2005-05-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 7–364（358 aa）片段：adenylyl cyclase toxin of Bordetella pertussis	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 EMA (ADENIN-9-YL-ETHOXYMETHYL)-HYDROXYPHOSPHINYL-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG4000, Na Citrate, Propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277KK	分辨率 2.20 Å R-free 0.291

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYAA_BORPE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–356； UniProt 7–362

Calmodulin

Xenopus laevis

UniProt P62155

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 79–145	未记录	Bifunctional hemolysin-adenylate cyclase × 1 （P15318） MG MAGNESIUM ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；278 K；PEG4000, Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.20 Å R-free 0.293

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2COL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CFC CALCIUM-FREE CALMODULIN 提交 1995-08-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1CFD CALCIUM-FREE CALMODULIN 提交 1995-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1CFF NMR SOLUTION STRUCTURE OF A COMPLEX OF CALMODULIN WITH A BINDING PEPTIDE OF THE CA2+-PUMP 提交 1999-03-18	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.115；压力 1 NMR样品组成 90% H2O/10% D2O, 100% D2O	分辨率未提供
1DMO CALMODULIN, NMR, 30 STRUCTURES 提交 1996-04-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1F70 REFINED SOLUTION STRUCTURE OF CALMODULIN N-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–76（75 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM KCL；压力 ambient NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepe buffer, 100 mM KCL \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepe buffer, 100 mM KCL; 21 mg/ml filamentous phage Pf1 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1F71 REFINED SOLUTION STRUCTURE OF CALMODULIN C-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 83–149（67 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM KCl；压力 ambient NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepes buffer, 100 mM KCl \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepes buffer, 100 mM KCl; 21 mg/ml filamentous phage pf1 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1IQ5 Calmodulin/nematode CA2+/Calmodulin dependent kinase kinase fragment 提交 2001-06-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；ammonium sulfate, citratet, sodium tartrae, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.248
1MUX SOLUTION NMR STRUCTURE OF CALMODULIN/W-7 COMPLEX: THE BASIS OF DIVERSITY IN MOLECULAR RECOGNITION, 30 STRUCTURES 提交 1997-09-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 WW7 N-(6-AMINOHEXYL)-5-CHLORO-1-NAPHTHALENESULFONAMIDE × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）KCL, 100mM；压力 1	分辨率未提供
1NWD Solution Structure of Ca2+/Calmodulin bound to the C-terminal Domain of Petunia Glutamate Decarboxylase 提交 2003-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM KCl, 10 mM CaCl2 NMR样品组成 1 mM Calmodulin; 2.2 mM GAD \| 91% H2O, 9% D2O	分辨率未提供
1SY9 Structure of calmodulin complexed with a fragment of the olfactory CNG channel 提交 2004-04-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；308 K NMR测量条件 pH 6.7；308 K NMR样品组成 1.2 mM complex U-15N,13C, 6 mM CaCl2, 140 mM KCl, D2O \| D2O NMR样品组成 1.2 mM complex U-15N,13C, 6 mM CaCl2, 140 mM KCl, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1X02 Solution structure of stereo array isotope labeled (SAIL) calmodulin 提交 2005-03-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；310 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.7mM SAIL calmodulin, 5mM MES-d13, 10mM bis-Tris-d19, 5mM CaCl2, 0.1mM NaN3 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
2I08 Solvation effect in conformational changes of EF-hand proteins: X-ray structure of Ca2+-saturated double mutant Q41L-K75I of N-domain of calmodulin 提交 2006-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–78（78 aa）片段：N-DOMAIN OF CALMODULIN	突变：F19Y, Q41L, K75I, A1M, D78Y	CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；36% (v/v) PEG 400, 100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
2K3S HADDOCK-derived structure of the CH-domain of the smoothelin-like 1 complexed with the C-domain of apocalmodulin 提交 2008-05-15	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 83–149（67 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] entity_1, 0.6 mM calmodulin (full length), 20 mM Bis-Tris, 0.5 mM DSS, 10 mM [U-2H] DTT, 0.03 % sodium azide, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM entity_1, 0.5 mM [U-100% 15N] calmodulin (full length), 20 mM Bis-Tris, 0.5 mM DSS, 10 mM [U-2H] DTT, 0.03 % sodium azide, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KDU Structural basis of the Munc13-1/Ca2+-Calmodulin interaction: A novel 1-26 calmodulin binding motif with a bipartite binding mode 提交 2009-01-19	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K NMR样品组成 10 mM calcium, 1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 1.8 mM Munc13-1, 150 mM potassium chloride, 20 mM BIS-TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 10 mM calcium, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Munc13-1, 0.6 mM calmodulin, 150 mM potassium chloride, 20 mM BIS-TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 10 mM calcium, 1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 1.8 mM Munc13, 150 mM potassium chloride, 20 mM BIS-TRIS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LLO Solution NMR-derived structure of calmodulin N-lobe bound with ER alpha peptide 提交 2011-11-15	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–81（80 aa）片段：EF-hand domains 1 and 2, residues 2-81	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LLQ Solution nmr-derived structure of calmodulin c-lobe bound with er alpha peptide 提交 2011-11-15	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 83–149（67 aa）片段：EF-hand domains 3 and 4, residues 83-149	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2MES Backbone 1H, 13C, 15N resonance assignments of calcium-bound calmodulin in complex with PSD95 N-terminal peptide 提交 2013-09-26	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin, PSD95NT, DTT, Tris, CaCl2, 600 uM PSD95_N-terminal_peptide, 20 mM Tris-d11, 50 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM DTT-d, 93 % H2O, 7 % D2O, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2RRT Solution structure of Magnesium-bound form of calmodulin C-domain E104D/E140D mutant 提交 2011-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 79–149（71 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 79-149	突变：E28D, E64D	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；323 K；离子强度（mmCIF原始值）0.5；压力 ambient NMR样品组成 10 mM [U-2H] MES-1, 100 mM potassium chloride-2, 100 mM magnesium chloride-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4R8G Crystal Structure of Myosin-1c tail in complex with Calmodulin 提交 2014-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–149（148 aa）链 B 2–149（148 aa）链 H 2–149（148 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289.3 K；2.0M ammonium sulfate, 5% 1,4-dioxane, MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.3K	分辨率 3.50 Å R-free 0.304
5J7J NMR Derived Structure of Ca2+ Calmodulin bound to Phosphorylated PSD-95 提交 2016-04-06	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 500 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Calmodulin, 750 uM PSD-95 phosphorylated, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5T0X Solution NMR-derived structure of calmodulin bound with ER alpha peptides 提交 2016-08-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1 mM [U-99% 15N] 15N-labeled CaM/ERalpha \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 13C/15N-CaM/ERalpha \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 13C/15N-CaM/ERalpha \| 100% D2O	分辨率未提供

共 22 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALM_XENLA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–67； UniProt 79–145

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2col
沉积日期 deposition_date	2005-05-18
结构标题 title	Crystal structure analysis of CyaA/C-Cam with Pyrophosphate
关键词 keywords	LYASE, Calcium binding, LYASE-METAL BINDING PROTEIN COMPLEX; LYASE/METAL BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.42 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	26.01 Å
零角强度 I(0) i0	39198900.00
分子量 molecular_weight	45943.0 kDa
排除体积 excluded_volume	56433 Å³
包络体积 envelope_volume	70120 Å³
水化壳体积 shell_volume	24418 Å³
包络直径 envelope_diameter	96.8 Å
壳层 Rg shell_rg	31.08 Å
包络 Rg envelope_rg	26.30 Å
形状 Rg shape_rg	26.02 Å
总 Rg total_rg	26.55 Å
总原子数 total_atoms	3227
残基数 n_residues	416
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	93.9 Å
Rg (实空间) rg_real	26.70 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.88 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.9200e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.5180e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.61 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	39200000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8095
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	25.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.640
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.039
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	11150000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.628; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.683; Smooth: 0.952

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Bifunctional hemolysin-adenylate cyclase
分子量 formula_weight	38562.9 kDa
EC 编号 ec_number	4.6.1.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3345

AGYANAADRESGIPAAVLDGIKAVAKEKNATLMFRLVNPHSTSLIAEGVATKGLGVHAKSSDWGLQAGYIPVNPNLSKLFGRAPEVIARADNDVNSSLAHGHTAVDLTLSKERLDYLRQAGLVTGMADGVVASNHAGYEQFEFRVKETSDGRYAVQYRRKGGDDFEAVKVIGNAAGIPLTADIDMFAIMPHLSNFRDSARSSVTSGDSVTDYLARTRRAASEATGGLDRERIDLLWKIARAGARSAVGTEARRQFRYDGDMNIGVITDFELEVRNALNRRAHAVGAQDVVQHGTEQNNPFPEADEKIFVVSATGESQMLTRGQLKEYIGQQRGEGYVFYENRAYGVAGKSLFDDGL

来源 Source

来源生物 organism	Bordetella pertussis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	520
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Calmodulin
分子量 formula_weight	7739.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

TDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMM

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PYROPHOSPHATE 2-
分子量 formula_weight	176.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	118

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2colb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2colA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1720 —

结构域编号 domain_id	2colA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1760 — Adenylylcyclase toxin fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Anthrax toxin, edema factor, central domain

结构域编号 domain_id	2colA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	920 —

结构域编号 domain_id	2colB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	79.613 Å
晶胞边长 b length_b	79.613 Å
晶胞边长 c length_c	139.465 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2470
R_work r_work	0.2400
R_free r_free	0.2930

fit	/app/data/saxs_computation/co/2col/2col.fit
pddf	/app/data/pr_computation/co/2col/2col.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/co/2col/2col.dat

Crystal structure analysis of CyaA/C-Cam with Pyrophosphate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bifunctional hemolysin-adenylate cyclase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Calmodulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)