Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | SULFATE ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | SULFATE ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | POL_HV1N5 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1, 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–133； UniProt 1–131 作者链 B； PDB构建体 1–146； UniProt 132–277 作者链 D； PDB构建体 1–146； UniProt 132–277 |
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| 条目编号 entry_id | 2gol |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-04-13 |
| 结构标题 title | Xray Structure of Gag278 |
| 关键词 keywords | Viral Maturation, Immature, Gag, HIV-1, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.73 Å |
| Rg（电子密度） | 15.68 Å |
| 总 Rg | 16.71 Å |
| 原子数 | 1056 |
| 残基数 | 135 |
| 排除体积 | 18755 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2gola_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.61 — Retroviral matrix proteins |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.61.1 — Retroviral matrix proteins |
| 家族 Family family | a.61.1.1 — Immunodeficiency virus matrix proteins |
| 结构域编号 domain_id | d2golb_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.73 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.73.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 家族 Family family | a.73.1.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 结构域编号 domain_id | d2gold_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.73 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.73.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 家族 Family family | a.73.1.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain |
| 结构域编号 domain_id | 2golA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA polymerase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Immunodeficiency lentiviruses, gag gene matrix protein p17 |
| 结构域编号 domain_id | 2golB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 375 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |
| 结构域编号 domain_id | 2golD00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 375 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein |