2hl3

Crystal structure of the A49M mutant CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) in complex with human EB1 C-terminal hexapeptide

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 65.3 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dynactin-1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 15–111 链 B； UniProt 15–111	片段：CAP-Gly domain 突变：A49M	Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 × 1 （Q15691）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；25% PEG 3350, 0.05M Sodium Citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.03 Å R-free 0.223

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2HL3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1TXQ Crystal structure of the EB1 C-terminal domain complexed with the CAP-Gly domain of p150Glued 提交 2004-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 15–107（93 aa）片段：p150Glued CAP-Gly domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；ammonium sulphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.243
2COY Solution structure of the CAP-Gly domain in human Dynactin 1 提交 2005-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–99（99 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient NMR样品组成 1mM protein, 20mM d-Tris-HCl, pH7.0, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2HKN Crystal structure of the CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) 提交 2006-07-05	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 15–111（97 aa）片段：CAP-Gly domain 链 B 15–111（97 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；25% PEG 3350, 0.05M sodium citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.87 Å R-free 0.251
2HKQ Crystal structure of the C-terminal domain of human EB1 in complex with the CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) 提交 2006-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 15–111（97 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.3 M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES Buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.86 Å R-free 0.217
2HL5 Crystal structure of the C-terminal domain of human EB1 in complex with the A49M mutant CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) 提交 2006-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain 链 D 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain	突变：A49M 突变：A49M	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG 3350, 0.1M HEPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.93 Å R-free 0.242
2HQH Crystal structure of p150Glued and CLIP-170 提交 2006-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
2HQH Crystal structure of p150Glued and CLIP-170 提交 2006-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
2HQH Crystal structure of p150Glued and CLIP-170 提交 2006-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
2HQH Crystal structure of p150Glued and CLIP-170 提交 2006-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
2HQH Crystal structure of p150Glued and CLIP-170 提交 2006-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107 链 B 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107 链 C 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107 链 D 15–107（93 aa）片段：CAP-Gly domain, residues 15-107	未记录	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
3E2U Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED) 提交 2008-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.238
3E2U Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED) 提交 2008-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.238
3E2U Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED) 提交 2008-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.238
3E2U Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED) 提交 2008-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.238
3E2U Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED) 提交 2008-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain 链 B 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain 链 C 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain 链 D 18–111（94 aa）片段：CAP-Gly domain	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.238
3TQ7 EB1c/EB3c heterodimer in complex with the CAP-Gly domain of P150glued 提交 2011-09-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 27–97（71 aa）片段：CAP-Gly domain of P150glued 链 Q 27–97（71 aa）片段：CAP-Gly domain of P150glued	突变：A49M 突变：A49M	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Magnesium chloride hexahydrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.281
9B7J Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 S 1–1278（1278 aa）链 s 1–1278（1278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
9YND Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 1–1278（1278 aa）链 I 1–1278（1278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.26 Å
9YNE Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B-ICD and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–1278（1278 aa）链 G 1–1278（1278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.46 Å
9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 W 1–1278（1278 aa）链 X 1–1278（1278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å

共 12 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DYNA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–97； UniProt 15–111 作者链 B； PDB构建体 4–97； UniProt 15–111

Microtubule-associated protein RP/EB family member 1

物种未注明

UniProt Q15691

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 262–267	片段：C-terminal hexapeptide	Dynactin-1 × 2 （Q14203）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；25% PEG 3350, 0.05M Sodium Citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.03 Å R-free 0.223

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2HL3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1PA7 Crystal structure of amino-terminal microtubule binding domain of EB1 提交 2003-05-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–130（130 aa）片段：N-terminal domain, EB1 microtubule-binding domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；PEG4K, ammonium sulfate, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.45 Å R-free 0.189
1TXQ Crystal structure of the EB1 C-terminal domain complexed with the CAP-Gly domain of p150Glued 提交 2004-07-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 183–268（86 aa）片段：EB1 C-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；ammonium sulphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.243
1UEG Crystal structure of amino-terminal microtubule binding domain of EB1 提交 2003-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–130（130 aa）片段：N-terminal domain, EB1 microtubule-binding domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；ammonium sulfate, sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.279
1VKA Southeast Collaboratory for Structural Genomics: Hypothetical Human Protein Q15691 N-Terminal Fragment 提交 2004-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–140（139 aa）片段：N-terminal domain 链 B 2–140（139 aa）片段：N-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro-batch under oil；pH 6.2；291 K；pH 6.2, Micro-batch under oil, temperature 291K	分辨率 1.60 Å R-free 0.214
1WU9 Crystal structure of the C-terminal domain of the end-binding protein 1 (EB1) 提交 2004-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 190–267（78 aa）片段：C-terminal domain 链 B 190–267（78 aa）片段：C-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；sodium citrate, PEG 3350, gamma-butyrolactone, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.54 Å R-free 0.220
1YIB Crystal Structure of the Human EB1 C-terminal Dimerization Domain 提交 2005-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 184–254（71 aa）片段：EB1 C-terminal Domain	突变：N-terminal cloning artifact GPLGS	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；protein stock = EB1 C-terminal domain @ 15 mg/ml, MACF2 (1595-1637) peptide @ 8 mg/ml, well = 22% PEG 200 (v/v), 100 mM ammonium acetate pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.259
1YIG Crystal Structure of the Human EB1 C-terminal Dimerization Domain 提交 2005-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 184–254（71 aa）片段：EB1 C-terminal Domain 链 B 184–254（71 aa）片段：EB1 C-terminal Domain	突变：N-terminal cloning artifact GPLGS, V243M mutant, methionines at positions 197 and 243 are seleno-methionines 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：N-terminal cloning artifact GPLGS, V243M mutant, methionines at positions 197 and 243 are seleno-methionines 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；protein stock = EB1 C-terminal domain @15 mg/ml, well = 22%, PEG 200 (v/v), 100 mM ammonium acetate pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2HKQ Crystal structure of the C-terminal domain of human EB1 in complex with the CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) 提交 2006-07-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 188–267（80 aa）片段：C-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.3 M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES Buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.86 Å R-free 0.217
2HL5 Crystal structure of the C-terminal domain of human EB1 in complex with the A49M mutant CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) 提交 2006-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 190–267（78 aa）片段：C-terminal domain 链 B 190–267（78 aa）片段：C-terminal domain	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG 3350, 0.1M HEPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.93 Å R-free 0.242
2QJZ Structural Basis of Microtubule Plus End Tracking by XMAP215, CLIP-170 and EB1 提交 2007-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 12–133（122 aa）片段：Calponin Homology Domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；11.5% 2-propanol, 190 mM Sodium citrate, 100 mM Hepes, Protein concentration 20 mg/ml, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.25 Å R-free 0.198
2QJZ Structural Basis of Microtubule Plus End Tracking by XMAP215, CLIP-170 and EB1 提交 2007-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 12–133（122 aa）片段：Calponin Homology Domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；11.5% 2-propanol, 190 mM Sodium citrate, 100 mM Hepes, Protein concentration 20 mg/ml, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.25 Å R-free 0.198
2R8U Structure of fragment of human end-binding protein 1 (EB1) containing the N-terminal domain at 1.35 A resolution 提交 2007-09-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–268（268 aa）片段：N-terminal domain	未记录	MOO MOLYBDATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M Tris, 0.1M Na2MoO4, 35% PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.35 Å R-free 0.227
2R8U Structure of fragment of human end-binding protein 1 (EB1) containing the N-terminal domain at 1.35 A resolution 提交 2007-09-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–268（268 aa）片段：N-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M Tris, 0.1M Na2MoO4, 35% PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.35 Å R-free 0.227
3GJO Crystal structure of human EB1 in complex with microtubule Tip localization signal peptide of MACF 提交 2009-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 191–260（70 aa）片段：EB1 C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 191-260 链 B 191–260（70 aa）片段：EB1 C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 191-260	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；0.2M MAGNESIUM ACETATE, 20% PEG 3350, pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.50 Å R-free 0.255
3GJO Crystal structure of human EB1 in complex with microtubule Tip localization signal peptide of MACF 提交 2009-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 191–260（70 aa）片段：EB1 C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 191-260 链 D 191–260（70 aa）片段：EB1 C-TERMINAL DOMAIN, UNP RESIDUES 191-260	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；0.2M MAGNESIUM ACETATE, 20% PEG 3350, pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.50 Å R-free 0.255
3MTU Structure of the Tropomyosin Overlap Complex from Chicken Smooth Muscle 提交 2010-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ; 链 B 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ; 链 C 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ; 链 D 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ;	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 EOH ETHANOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；16% MePEG 5000, 100 mM MES, pH 6.0, 140 mM CaCl2, 2% methanol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3MTU Structure of the Tropomyosin Overlap Complex from Chicken Smooth Muscle 提交 2010-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ; 链 B 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ; 链 C 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ; 链 D 216–257（42 aa）片段：;Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein,Fusion protein of residues 1-29 of chicken smooth muscle tropomyosin and residues 215-257 of human EB1 protein ;	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 EOH ETHANOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；16% MePEG 5000, 100 mM MES, pH 6.0, 140 mM CaCl2, 2% methanol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3MUD Structure of the Tropomyosin Overlap Complex from Chicken Smooth Muscle 提交 2010-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 215–257（43 aa）链 D 215–257（43 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；18% MePEG 2000, 100 mM Bis-Tris, 120 mM MgSO4 , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
3TQ7 EB1c/EB3c heterodimer in complex with the CAP-Gly domain of P150glued 提交 2011-09-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 191–268（78 aa）片段：EB1 c-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Magnesium chloride hexahydrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.281
4XA1 Crystal Structure of the coiled-coil surrounding Skip 1 of MYH7 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 211–251（41 aa）片段：UNP P13848 residues 1-49,UNP Q12883 residues 1173-1238,UNP Q15691 residues 211-251 链 B 211–251（41 aa）片段：UNP P13848 residues 1-49,UNP Q12883 residues 1173-1238,UNP Q15691 residues 211-251	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；20% (w/v) polyethylene glycol methyl ether 2000, 20 mM SrCl2, 100 mM HEPES pH 7.6, 5% pentaerythritol ethoxylate (17/8 PO/OH) 797, 0.5% 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfonate (CHAPS)	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
4XA1 Crystal Structure of the coiled-coil surrounding Skip 1 of MYH7 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 211–251（41 aa）片段：UNP P13848 residues 1-49,UNP Q12883 residues 1173-1238,UNP Q15691 residues 211-251 链 D 211–251（41 aa）片段：UNP P13848 residues 1-49,UNP Q12883 residues 1173-1238,UNP Q15691 residues 211-251	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；20% (w/v) polyethylene glycol methyl ether 2000, 20 mM SrCl2, 100 mM HEPES pH 7.6, 5% pentaerythritol ethoxylate (17/8 PO/OH) 797, 0.5% 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfonate (CHAPS)	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
4XA3 Crystal structure of the coiled-coil surrounding Skip 2 of MYH7 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 215–251（37 aa）片段：UNP P13848 residues 1-49,UNP P12883 residues 1361-1425,UNP Q15691 residues 215-251 链 B 215–251（37 aa）片段：UNP P13848 residues 1-49,UNP P12883 residues 1361-1425,UNP Q15691 residues 215-251	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；4.5% (w/v) polyethylene glycol 8000, 100 mM sodium acetate pH 5.0, 50 mM CaCl2, 2.5% (w/v) 3-methoxy-3-methyl-1-butanol	分辨率 2.55 Å R-free 0.311
4XA6 Crystal Structure of the coiled-coil surrounding Skip 4 of MYH7 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 209–251（43 aa）片段：UNP P13848 residues 2-50,UNP P02564 residues 1777-1855,UNP Q15691 residues 209-251 链 B 209–251（43 aa）片段：UNP P13848 residues 2-50,UNP P02564 residues 1777-1855,UNP Q15691 residues 209-251	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；18% (w/v) polyethylene glycol 2000 methyl ether, 100 mM piperazine-N,N-bis(2-ethanesulfonic acid) (PIPES)	分辨率 3.42 Å R-free 0.297
4XA6 Crystal Structure of the coiled-coil surrounding Skip 4 of MYH7 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 209–251（43 aa）片段：UNP P13848 residues 2-50,UNP P02564 residues 1777-1855,UNP Q15691 residues 209-251 链 D 209–251（43 aa）片段：UNP P13848 residues 2-50,UNP P02564 residues 1777-1855,UNP Q15691 residues 209-251	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；18% (w/v) polyethylene glycol 2000 methyl ether, 100 mM piperazine-N,N-bis(2-ethanesulfonic acid) (PIPES)	分辨率 3.42 Å R-free 0.297
5JV3 The neck-linker and alpha 7 helix of Homo sapiens Eg5 fused to EB1 提交 2016-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 210–257（48 aa）片段：UNP P52732 residues 366-391,UNP Q15691 residues 210-257 链 B 210–257（48 aa）片段：UNP P52732 residues 366-391,UNP Q15691 residues 210-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；24% (w/v) PEE797, 100 mM CaCl2, 100 mM MOPS pH 7.0, 0.1% (w/v) octylglucoside	分辨率 2.01 Å R-free 0.247
5JV3 The neck-linker and alpha 7 helix of Homo sapiens Eg5 fused to EB1 提交 2016-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 210–257（48 aa）片段：UNP P52732 residues 366-391,UNP Q15691 residues 210-257 链 D 210–257（48 aa）片段：UNP P52732 residues 366-391,UNP Q15691 residues 210-257	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；24% (w/v) PEE797, 100 mM CaCl2, 100 mM MOPS pH 7.0, 0.1% (w/v) octylglucoside	分辨率 2.01 Å R-free 0.247
5JVM The neck-linker and alpha 7 helix of Mus musculus KIF3C 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 207–257（51 aa）片段：UNP O35066 residues 374-402,UNP Q15691 residues 207-257 链 B 207–257（51 aa）片段：UNP O35066 residues 374-402,UNP Q15691 residues 207-257	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；30% (w/v) pentaerythritol ethoxylate (PEE) 797, 1.5% (w/v) ethylene glycol monoethylether, 400 mM MgCl2, 100 mM bis-tris propane pH 9.0	分辨率 1.57 Å R-free 0.205
5JVP The neck-linker and alpha 7 helix of Homo sapiens CENP-E 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 210–257（48 aa）片段：UNP Q02224 residues 336-375,UNP Q15691 residues 210-257	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CD CADMIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；18% (w/v) MEPEG 2000, 175 mM Li2SO4, 100 mM MES pH 6.0, 1 mM CdCl2	分辨率 2.10 Å R-free 0.274
5JVP The neck-linker and alpha 7 helix of Homo sapiens CENP-E 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 210–257（48 aa）片段：UNP Q02224 residues 336-375,UNP Q15691 residues 210-257	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CD CADMIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；18% (w/v) MEPEG 2000, 175 mM Li2SO4, 100 mM MES pH 6.0, 1 mM CdCl2	分辨率 2.10 Å R-free 0.274
5JVP The neck-linker and alpha 7 helix of Homo sapiens CENP-E 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 210–257（48 aa）片段：UNP Q02224 residues 336-375,UNP Q15691 residues 210-257 链 D 210–257（48 aa）片段：UNP Q02224 residues 336-375,UNP Q15691 residues 210-257	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；18% (w/v) MEPEG 2000, 175 mM Li2SO4, 100 mM MES pH 6.0, 1 mM CdCl2	分辨率 2.10 Å R-free 0.274
5JVP The neck-linker and alpha 7 helix of Homo sapiens CENP-E 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 210–257（48 aa）片段：UNP Q02224 residues 336-375,UNP Q15691 residues 210-257 链 F 210–257（48 aa）片段：UNP Q02224 residues 336-375,UNP Q15691 residues 210-257	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；18% (w/v) MEPEG 2000, 175 mM Li2SO4, 100 mM MES pH 6.0, 1 mM CdCl2	分辨率 2.10 Å R-free 0.274
5JVR The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257 链 B 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；32% (w/v) polyethylene glycol dimethyl ether (DMPEG) 500, 30 mM MgCl2, 10 mM diethylenetriamine, 100 mM sodium 3-[4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazinyl]propanesulfonic acid (HEPPS) pH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.234
5JVR The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257 链 D 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；32% (w/v) polyethylene glycol dimethyl ether (DMPEG) 500, 30 mM MgCl2, 10 mM diethylenetriamine, 100 mM sodium 3-[4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazinyl]propanesulfonic acid (HEPPS) pH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.234
5JVR The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257 链 F 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；32% (w/v) polyethylene glycol dimethyl ether (DMPEG) 500, 30 mM MgCl2, 10 mM diethylenetriamine, 100 mM sodium 3-[4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazinyl]propanesulfonic acid (HEPPS) pH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.234
5JVR The neck-linker of Mus musculus KIF3A fused to the alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257 链 H 207–257（51 aa）片段：UNP P28741 residues 352-359,UNP P17210 residues 345-358,UNP Q15691 residues 207-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；32% (w/v) polyethylene glycol dimethyl ether (DMPEG) 500, 30 mM MgCl2, 10 mM diethylenetriamine, 100 mM sodium 3-[4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazinyl]propanesulfonic acid (HEPPS) pH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.234
5JVS The neck-linker + DAL and alpha 7 helix of Drosophila melanogaster Kinesin-1 fused to EB1 提交 2016-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 207–257（51 aa）片段：UNP P17210 residues 334-365,UNP Q15691 residues 207-257	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；100 mM sodium acetate pH 5.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 400, 80 mM MgCl2, 3 mM ZnSO4	分辨率 2.25 Å R-free 0.236
5JVU The neck-linker and alpha 7 helix of Drosophila melanogaster kinesin-1 fused to EB1 提交 2016-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 207–257（51 aa）片段：UNP P17210 residues 334-365,UNP Q15691 residues 207-257 链 B 207–257（51 aa）片段：UNP P17210 residues 334-365,UNP Q15691 residues 207-257	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；20% (w/v) methoxy polyethylene glycol (MEPEG) 5000, 100 mM Li2SO4, 100 mM MES/Acetate pH 5.5, 10 mM gamma-caprolactone	分辨率 1.95 Å R-free 0.243
5JX1 The neck-linker and alpha 7 helix of Mus musculus KIF3A fused to EB1 提交 2016-05-12	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 210–257（48 aa）片段：UNP P28741 residues 352-376,UNP Q15691 residues 210-257	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；24% (w/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 10% (w/v) PEG 4000, 100 mM CaCl2, 100 mM (3-(N-morpholino)propanesulfonic acid) (MOPS) pH 7.0, 1 mM CdCl2	分辨率 1.67 Å R-free 0.228
5N74 Microtubule end binding protein complex 提交 2017-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 191–248（58 aa）链 B 191–248（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；100 mM PCTP buffer, pH 4, supplemented with 25% PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
5N74 Microtubule end binding protein complex 提交 2017-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 191–248（58 aa）链 D 191–248（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；100 mM PCTP buffer, pH 4, supplemented with 25% PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
5N74 Microtubule end binding protein complex 提交 2017-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 191–248（58 aa）链 F 191–248（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；100 mM PCTP buffer, pH 4, supplemented with 25% PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
5N74 Microtubule end binding protein complex 提交 2017-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 191–248（58 aa）链 H 191–248（58 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；100 mM PCTP buffer, pH 4, supplemented with 25% PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
5WLQ Crystal Structure of Amino Acids 1677-1755 of Human Beta Cardiac Myosin Fused to Gp7 and Eb1 提交 2017-07-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 208–257（50 aa）片段：UNP P13848 residues 2-48 UNP Q15691 residues 208-256, UNP P12883 residues 1677-1755	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 TMO trimethylamine oxide × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；1.6 M Ammonium Aulfate, 500 mM Trimethyl Ammonium N-Oxide, 100 mM Bis-tris Propane pH 9.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.236
6YF5 Lamin A 17-70 coil1A dimer stabilized by C-terminal capping 提交 2020-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 215–251（37 aa）链 B 215–251（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；277 K；35.7% (w/v) 1,6-hexanediol, 5% (w/v) PEG 1K and 0.1 M trisodium citrate dihydrate	分辨率 1.83 Å R-free 0.255
6YF5 Lamin A 17-70 coil1A dimer stabilized by C-terminal capping 提交 2020-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 215–251（37 aa）链 D 215–251（37 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；277 K；35.7% (w/v) 1,6-hexanediol, 5% (w/v) PEG 1K and 0.1 M trisodium citrate dihydrate	分辨率 1.83 Å R-free 0.255
6YSH Lamin A 1-70 coil1A dimer stabilized by C-terminal capping 提交 2020-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 215–251（37 aa）链 B 215–250（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；0.1M NaH2PO4 H2O,0.1M KH2PO4,2.0M NaCl,0.1M Mes H20 pH 6	分辨率 2.83 Å R-free 0.281
9CO5 Crystal Structure of Macrocycle mediated complex of FKBP12 and MAPRE1 提交 2024-07-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 193–252（60 aa）	未记录	A1AZI (5S,14R,16aS,21R,28S,30aR)-14-[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl]-24,24,28-trimethyl-2-methylidene-1,3,4,17,18,19,20,24,25,28,29,30a-dodecahydro-2H,14H-9,13-(metheno)dipyrido[1,2-d:1',2'-o][1,10,18,4,7,15]trioxatriazacyclotetracosine-6,16,22,23,27,30(7H,16aH)-hexone × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；1.5 M LiSO4, 0.1 M CH3COONa pH 4.6	分辨率 2.77 Å R-free 0.225
9SMX CM1-activated gTuRC in complex with nascent alpha-E254D mutant microtubules 提交 2025-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：73-meric	链 AC 190–255（66 aa）链 CC 190–255（66 aa）链 Cc 190–255（66 aa）链 EC 190–255（66 aa）链 Ec 190–255（66 aa）链 GC 190–255（66 aa）链 Gc 190–255（66 aa）链 MC 190–255（66 aa）链 Mc 190–255（66 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å

共 31 个其他 PDB 条目、48 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MARE1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–6； UniProt 262–267

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2hl3
沉积日期 deposition_date	2006-07-06
结构标题 title	Crystal structure of the A49M mutant CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) in complex with human EB1 C-terminal hexapeptide
关键词 keywords	;microtubule binding, dynactin, cytoskeleton associated protein, p150Glued, EB1, +TIP protein Complex structure, EEY/F-COO- sequence motif, CLIP-170, alpha-tubulin, structural protein ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.79 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.13 Å
零角强度 I(0) i0	5250930.00
分子量 molecular_weight	16588.0 kDa
排除体积 excluded_volume	20768 Å³
包络体积 envelope_volume	25186 Å³
水化壳体积 shell_volume	12468 Å³
包络直径 envelope_diameter	62.9 Å
壳层 Rg shell_rg	22.67 Å
包络 Rg envelope_rg	18.21 Å
形状 Rg shape_rg	18.09 Å
总 Rg total_rg	19.01 Å
总原子数 total_atoms	1169
残基数 n_residues	151
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	65.3 Å
Rg (实空间) rg_real	18.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.56 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.2510e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.9280e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.84 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	5251000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8594
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	17.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.361
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.532
角度范围 angular_range	— – 0.4250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1095000.0000
实空间数据点数 n_real_points	74
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.790; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.803; Smooth: 0.998

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Dynactin-1
分子量 formula_weight	10369.5 kDa
突变 mutation	A49M
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	1236

GSHMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGMTLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Microtubule-associated protein RP/EB family member 1
分子量 formula_weight	825.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

EEQEEY

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	67

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2hl3A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	190 — CAP Gly-rich-like domain

结构域编号 domain_id	2hl3B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	190 — CAP Gly-rich-like domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	43.062 Å
晶胞边长 b length_b	55.068 Å
晶胞边长 c length_c	66.221 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.030 Å
最低分辨率 resolution_low	42.330 Å
R 因子 r_factor	0.1848
R_work r_work	0.1830
R_free r_free	0.2234

fit	/app/data/saxs_computation/hl/2hl3/2hl3.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hl/2hl3/2hl3.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hl/2hl3/2hl3.dat

Crystal structure of the A49M mutant CAP-Gly domain of human Dynactin-1 (p150-Glued) in complex with human EB1 C-terminal hexapeptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dynactin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Microtubule-associated protein RP/EB family member 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)