2kc2

NMR structure of the F1 domain (residues 86-202) of the talin

Method: SOLUTION NMR Dmax: 51.5 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Talin-1

Mus musculus

UniProt P26039

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 86–202 片段:F1 domain (residues 86-202) 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient NMR样品组成:0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] F1-1, 10 % [U-100% 2H] D2O-2, 2 mM DTT-3, 50 mM sodium chloride-4, 20 mM sodium phosphate-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:0.6 mM [U-100% 15N] F1-6, 10 % [U-100% 2H] D2O-7, 2 mM DTT-8, 50 mM sodium chloride-9, 20 mM sodium phosphate-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 50 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TLN1_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 12–128; UniProt 86–202

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2kc2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2kc2
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2kc2
沉积日期 deposition_date2008-12-13
结构标题 titleNMR structure of the F1 domain (residues 86-202) of the talin
关键词 keywordsTalin, FERM, F1, ADHESION, Cell membrane, Cell projection, Cytoplasm, Cytoskeleton, Membrane, Phosphoprotein, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.91
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.51
零角强度 I(0) i0349377000.00
分子量 molecular_weight150010.0 kDa
排除体积 excluded_volume186380 ų
包络体积 envelope_volume79821 ų
水化壳体积 shell_volume27534 ų
包络直径 envelope_diameter92.7
壳层 Rg shell_rg31.73
包络 Rg envelope_rg25.23
形状 Rg shape_rg18.46
总 Rg total_rg19.30
总原子数 total_atoms21240
残基数 n_residues1280
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax51.5
Rg (实空间) rg_real17.78
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.08
I(0) (实空间) i0_real3.3260e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.9540e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal19.10
I(0) (倒空间) i0_reciprocal349400000.0000
解质量估计 total_estimate0.6763
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary19.3
偏度 Skewness skewness0.403
峰度 Kurtosis kurtosis-0.335
角度范围 angular_range— – 0.4200 −1
当前正则化参数 α current_alpha3.6080
最高正则化参数 α highest_alpha1836000.0000
实空间数据点数 n_real_points73
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.003; Oscil: 0.945; Stabil: 0.985; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)