2lsv

The NMR high resolution structure of yeast Tah1 in complex with the Hsp90 C-terminal tail

Method: SOLUTION NMR Dmax: 35.8 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TPR repeat-containing protein associated with Hsp90

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P25638

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 2–111 未记录 ATP-dependent molecular chaperone HSP82 × 1 (P02829) SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 7.2;288 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient NMR样品组成:1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 1 mM protein_2, 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成:1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 1 mM protein_2, 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TAH1_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–110; UniProt 2–111

ATP-dependent molecular chaperone HSP82

物种未注明

UniProt P02829

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 701–709 片段:C-terminal tail TPR repeat-containing protein associated with Hsp90 × 1 (P25638) SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 7.2;288 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient NMR样品组成:1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 1 mM protein_2, 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成:1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 1 mM protein_2, 10 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 47 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HSP82_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–9; UniProt 701–709

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2lsv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2lsv
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2lsv
沉积日期 deposition_date2012-05-07
结构标题 titleThe NMR high resolution structure of yeast Tah1 in complex with the Hsp90 C-terminal tail
关键词 keywordsCHAPERONE-BINDING PROTEIN-CHAPERONE complex; CHAPERONE-BINDING PROTEIN/CHAPERONE
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier17.92
回转半径 Rg (电子) rg_electron17.95
零角强度 I(0) i01083060000.00
分子量 molecular_weight268240.0 kDa
排除体积 excluded_volume331750 ų
包络体积 envelope_volume80300 ų
水化壳体积 shell_volume24497 ų
包络直径 envelope_diameter86.0
壳层 Rg shell_rg34.15
包络 Rg envelope_rg30.77
形状 Rg shape_rg17.99
总 Rg total_rg18.24
总原子数 total_atoms37200
残基数 n_residues2380
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax35.8
Rg (实空间) rg_real13.11
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.04
I(0) (实空间) i0_real8.7460e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.7480e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.50
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1083000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6044
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary17.4
偏度 Skewness skewness0.191
峰度 Kurtosis kurtosis-0.410
角度范围 angular_range— – 0.4450 −1
当前正则化参数 α current_alpha5.1310
最高正则化参数 α highest_alpha389500.0000
实空间数据点数 n_real_points75
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.122; Oscil: 0.988; Stabil: 0.966; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2lsvA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetratricopeptide repeat domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)