SAXSdb — 3c4m

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Parathyroid hormone × 1 （P01270） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Parathyroid hormone × 1 （P01270） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALE_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–368； UniProt 26–392 作者链 B； PDB构建体 2–368； UniProt 26–392

Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor

Homo sapiens

UniProt Q03431

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Parathyroid hormone × 1 （P01270） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Parathyroid hormone × 1 （P01270） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PTHR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 375–533； UniProt 29–187 作者链 B； PDB构建体 375–533； UniProt 29–187

Parathyroid hormone

物种未注明

UniProt P01270

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor × 1 （P0AEX9,Q03431） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor × 1 （P0AEX9,Q03431） alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PTHY_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–20； UniProt 46–65 作者链 D； PDB构建体 1–20； UniProt 46–65

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3c4m
沉积日期 deposition_date	2008-01-30
结构标题 title	Structure of human parathyroid hormone in complex with the extracellular domain of its G-protein-coupled receptor (PTH1R)
关键词 keywords	;parathyroid hormone, G-protein-coupled receptor, Sugar transport, Transport, Cleavage on pair of basic residues, Disease mutation, Secreted, Dwarfism, Glycoprotein, Membrane, Receptor, Transducer, Transmembrane, MEMBRANE PROTEIN ;; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3c4m__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3c4m__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3c4m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.35 Å
Rg（电子密度）	26.42 Å
总 Rg	27.24 Å
原子数	3886
残基数	489
排除体积	69239 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3c4m__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3c4m__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor
分子量 formula_weight	60297.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	8349

MAKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFDDVMTKEEQIFLLHRAQAQCEKRLKEVLQRPASIMESDKGWTSASTSGKPRKDKASGKLYPESEEDKEAPTGSRYRGRPCLPEWDHILCWPLGAPGEVVAVPCPDYIYDFNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFLTNETREREVFDRLHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	, human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Parathyroid hormone
分子量 formula_weight	2546.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

LNSMERVEWLRKKLQDVHNFX

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	580

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3c4mc1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.15 — Parathyroid hormone fragments (residues between 1 and 39)
超家族 Superfamily superfamily	j.15.1 — Parathyroid hormone fragments (residues between 1 and 39)
家族 Family family	j.15.1.1 — Parathyroid hormone fragments (residues between 1 and 39)

结构域编号 domain_id	d3c4md1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.15 — Parathyroid hormone fragments (residues between 1 and 39)
超家族 Superfamily superfamily	j.15.1 — Parathyroid hormone fragments (residues between 1 and 39)
家族 Family family	j.15.1.1 — Parathyroid hormone fragments (residues between 1 and 39)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	3c4mA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	3c4mA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	3c4mA03
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1240 — Hormone receptor fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain

结构域编号 domain_id	3c4mB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	3c4mB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Periplasmic binding protein-like II

结构域编号 domain_id	3c4mB03
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1240 — Hormone receptor fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain

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晶胞边长 a length_a	62.919 Å
晶胞边长 b length_b	116.791 Å
晶胞边长 c length_c	78.416 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	108.80 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.950 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.1880
R_work r_work	0.1860
R_free r_free	0.2270

Structure of human parathyroid hormone in complex with the extracellular domain of its G-protein-coupled receptor (PTH1R)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Parathyroid hormone

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3c4m__assembly_1__model_1

3c4m__assembly_1__model_1 | I(q)

3c4m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of human parathyroid hormone in complex with the extracellular domain of its G-protein-coupled receptor (PTH1R)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Parathyroid hormone

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3c4m__assembly_1__model_1

3c4m__assembly_1__model_1 | I(q)

3c4m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)