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1CHH
STRUCTURAL STUDIES OF THE ROLES OF RESIDUES 82 AND 85 AT THE INTERACTIVE FACE OF CYTOCHROME C
提交 1994-06-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.97 Å
|
|
1CHI
STRUCTURAL STUDIES OF THE ROLES OF RESIDUES 82 AND 85 AT THE INTERACTIVE FACE OF CYTOCHROME C
提交 1994-06-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
|
|
1CHJ
STRUCTURAL STUDIES OF THE ROLES OF RESIDUES 82 AND 85 AT THE INTERACTIVE FACE OF CYTOCHROME C
提交 1994-06-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1CIE
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C
提交 1994-09-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.80 Å
|
|
1CIF
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C
提交 1994-09-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1CIG
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C
提交 1994-09-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.80 Å
|
|
1CIH
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL EFFECTS OF MULTIPLE MUTATIONS AT DISTAL SITES IN CYTOCHROME C
提交 1994-09-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.80 Å
|
|
1CRG
THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C
提交 1993-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
|
|
1CRH
THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C
提交 1993-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1CRI
THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C
提交 1993-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
|
|
1CRJ
THE ROLE OF A CONSERVED INTERNAL WATER MOLECULE AND ITS ASSOCIATED HYDROGEN BOND NETWORK IN CYTOCHROME C
提交 1993-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.05 Å
|
|
1CSU
REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C
提交 1994-10-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.81 Å
|
|
1CSV
REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C
提交 1994-10-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1CSW
REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C
提交 1994-10-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1CSX
REPLACEMENTS IN A CONSERVED LEUCINE CLUSTER IN THE HYDROPHOBIC HEME POCKET OF CYTOCHROME C
提交 1994-10-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1CTY
MUTATION OF TYROSINE-67 IN CYTOCHROME C SIGNIFICANTLY ALTERS THE LOCAL HEME ENVIRONMENT
提交 1993-02-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.20 Å
|
|
1CTZ
MUTATION OF TYROSINE-67 IN CYTOCHROME C SIGNIFICANTLY ALTERS THE LOCAL HEME ENVIRONMENT
提交 1993-02-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1FHB
THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURE OF THE CYANIDE ADDUCT OF A MET80ALA VARIANT OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE ISO-1-CYTOCHROME C. IDENTIFICATION OF LIGAND-RESIDUE INTERACTIONS IN THE DISTAL HEME CAVITY
提交 1995-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
突变:H39Q, M80A, C102S
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CYN CYANIDE ION × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
1IRV
CYTOCHROME C ISOZYME 1, REDUCED, MUTANT WITH ILE 75 REPLACED BY MET AND CYS 102 REPLACED BY THR
提交 1996-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
突变:I75M, C102T
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1IRW
CYTOCHROME C ISOZYME 1, REDUCED, MUTANT WITH ASN 52 REPLACED BY ALA AND CYS 102 REPLACED BY THR
提交 1996-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
突变:N52A, C102T
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
|
|
1KYO
YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C
提交 2002-02-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:23-meric
|
链 W
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
HEC HEME C × 7
SMA STIGMATELLIN A × 2
FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.97 Å
R-free 0.268
|
|
1LMS
Structural model for an alkaline form of ferricytochrome c
提交 2002-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
突变:K72A,K79A,C102T
|
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 11.1;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM phosphate;压力 1
NMR样品组成
2mM protein | 50 mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O; pH 11.1
|
分辨率未提供
|
|
1NMI
Solution structure of the imidazole complex of iso-1 cytochrome c
提交 2003-01-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
未记录
|
IMD IMIDAZOLE × 1
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K
NMR样品组成
1mM iso-1 cytochrome c, 120mM d5imidazole | H2O
NMR样品组成
1mM 15N labeled iso-1 cytochrome c, 120mM d5imidazole | H2O
|
分辨率未提供
|
|
1RAP
THE STRUCTURE AND FUNCTION OF OMEGA LOOP A REPLACEMENTS IN CYTOCHROME C
提交 1992-08-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.25 Å
|
|
1RAQ
THE STRUCTURE AND FUNCTION OF OMEGA LOOP A REPLACEMENTS IN CYTOCHROME C
提交 1992-08-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
1S6V
Structure of a cytochrome c peroxidase-cytochrome c site specific cross-link
提交 2004-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
2–108(107 aa)
|
突变:A81C, C102T
|
IOD IODIDE ION × 1
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350, KI, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.243
|
|
1S6V
Structure of a cytochrome c peroxidase-cytochrome c site specific cross-link
提交 2004-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
2–108(107 aa)
|
突变:A81C, C102T
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350, KI, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.243
|
|
1U74
Electron Transfer Complex between cytochrome C and cytochrome C peroxidase
提交 2004-08-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
突变:C102S
|
PO4 PHOSPHATE ION × 1
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG 3350, sodium chloride, n-octyl-beta-D-glucoside, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.287
|
|
1U74
Electron Transfer Complex between cytochrome C and cytochrome C peroxidase
提交 2004-08-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–108(108 aa)
|
突变:C102S
|
PO4 PHOSPHATE ION × 1
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG 3350, sodium chloride, n-octyl-beta-D-glucoside, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.287
|
|
1YCC
HIGH-RESOLUTION REFINEMENT OF YEAST ISO-1-CYTOCHROME C AND COMPARISONS WITH OTHER EUKARYOTIC CYTOCHROMES C
提交 1990-05-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.23 Å
|
|
1YFC
Solution nmr structure of a yeast iso-1-ferrocytochrome C
提交 1996-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
突变:C102S
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K
|
分辨率未提供
|
|
1YIC
THE OXIDIZED SACCHAROMYCES CEREVISIAE ISO-1-CYTOCHROME C, NMR, 20 STRUCTURES
提交 1997-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
突变:C102S
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
2B0Z
Crystal structure of the protein-protein complex between F82I cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2005-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
突变:F82I
|
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.289
|
|
2B10
Crystal Structure of the Protein-Protein Complex between F82S cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2005-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
突变:F82S
|
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;PEG 3350, NaCl, BOG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.306
|
|
2B10
Crystal Structure of the Protein-Protein Complex between F82S cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2005-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–108(108 aa)
|
突变:F82S
|
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;PEG 3350, NaCl, BOG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.306
|
|
2B11
Crystal structure of the protein-protein complex between F82W cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2005-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
突变:F82W
|
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;PEG 3350, NaCl, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.293
|
|
2B11
Crystal structure of the protein-protein complex between F82W cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2005-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–108(108 aa)
|
突变:F82W
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;PEG 3350, NaCl, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.293
|
|
2B12
Crystal structure of the protein-protein complex between F82Y cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2005-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
突变:F82Y
|
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;PEG 3350, NaCl, BOG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.02 Å
R-free 0.268
|
|
2BCN
Solvent isotope effects on interfacial protein electron transfer between cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2005-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
突变:C107S
|
ZNH PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING ZN × 2
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;295 K;PEG3350, NaCl, BOG, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.230
|
|
2GB8
Solution structure of the complex between yeast iso-1-cytochrome c and yeast cytochrome c peroxidase
提交 2006-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
未记录
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;301 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成
0.3-0.4mM Cc(Fe3+)-CcP(Fe3+), 1:1 complex; 20mM NaPi, 100mM NaCl pH 6.0 | 20mM NaPi, 100mM NaCl pH 6.0
|
分辨率未提供
|
|
2HV4
NMR solution structure refinement of yeast iso-1-ferrocytochrome c
提交 2006-07-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成
2-3 mM cytochrome c, 50 mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-3 mM cytochrome c U-15N, 50 mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-3 mM cytochrome c U-15N,13C, 50 mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2JQR
Solution model of crosslinked complex of cytochrome c and adrenodoxin
提交 2007-06-07
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:V28C, C102T
|
HEC HEME C × 1
FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;285 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7.4;301 K;离子强度(mmCIF原始值)0.4;压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM [U-98% 15N] CcV28C, 0.2-0.6 mM AdxL80C, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-98% 15N] AdxL80C, 0.2-0.6 mM CcV28C, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-98% 15N] CcV28C, 5 mM DTT, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-98% 15N] AdxL80C, 5 mM DTT, 20 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2JTI
Solution structure of the yeast iso-1-cytochrome c (T12A) : yeast cytochrome c peroxidase complex
提交 2007-08-01
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
突变:T12A,C102T
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;303 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.3-0.4 mM [U-15N] CC, 0.3-0.4 mM CCP, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2LIR
NMR Solution Structure of Yeast Iso-1-cytochrome c Mutant P71H in oxidized states
提交 2011-08-31
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:P71H, K72A, C102T
|
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;293 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM entity_1-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM entity_1-2, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2LIT
NMR Solution Structure of Yeast Iso-1-cytochrome c Mutant P71H in reduced states
提交 2011-08-31
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:P71H, K72A, C102T
|
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;293 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM entity_1-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM entity_1-2, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2MHM
Solution structure of cytochrome c Y67H
提交 2013-11-26
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:Y67H
|
HEC HEME C × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;293 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成
1 mM cytc c y67h-1, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM cytc c y67h-2, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2N18
Dominant form of the low-affinity complex of yeast cytochrome c and cytochrome c peroxidase
提交 2015-03-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
3–109(107 aa)
片段:UNP residues 3-109
链 C
2–109(108 aa)
片段:UNP residues 2-109
|
突变:A81C, C102T
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
HEC HEME C × 2
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)15;压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM [U-2H; U-15N] CcP, 0.4 mM Cc, 0.4 mM Cc1, 20 mM sodium phosphate, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2ORL
Solution structure of the cytochrome c- para-aminophenol adduct
提交 2007-02-03
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEC HEME C × 1
4NL 4-AMINOPHENOL × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM phosphate buffer;压力 1
NMR样品组成
2-3mM Cytochrome c U-15N, 50mM phosphate buffer, pH 7.0, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2PCC
CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN ELECTRON TRANSFER PARTNERS, CYTOCHROME C PEROXIDASE AND CYTOCHROME C
提交 1993-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–108(108 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.30 Å
|
|
2PCC
CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN ELECTRON TRANSFER PARTNERS, CYTOCHROME C PEROXIDASE AND CYTOCHROME C
提交 1993-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–108(108 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.30 Å
|
|
2YCC
OXIDATION STATE-DEPENDENT CONFORMATIONAL CHANGES IN CYTOCHROME C
提交 1991-01-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–108(108 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SO4 SULFATE ION × 1
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.90 Å
|
|
3TYI
Crystal Structure of Cytochrome c - p-Sulfonatocalix[4]arene Complexes
提交 2011-09-26
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;293.15 K;26 % PEG 8000, 100 mM Magnesium Chloride, 50 mM Sodium Chloride, 50 mM Sodium Cacodylate pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.198
|
|
3TYI
Crystal Structure of Cytochrome c - p-Sulfonatocalix[4]arene Complexes
提交 2011-09-26
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;293.15 K;26 % PEG 8000, 100 mM Magnesium Chloride, 50 mM Sodium Chloride, 50 mM Sodium Cacodylate pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.198
|
|
4MU8
Crystal structure of an oxidized form of yeast iso-1-cytochrome c at pH 8.8
提交 2013-09-20
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:K78A, C108S
|
HEC HEME C × 1
SO4 SULFATE ION × 4
TBU TERTIARY-BUTYL ALCOHOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.8;293 K;90% ammonia sulfate, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.8), 4% tert-butanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.154
|
|
4MU8
Crystal structure of an oxidized form of yeast iso-1-cytochrome c at pH 8.8
提交 2013-09-20
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
突变:K78A, C108S
|
HEC HEME C × 1
SO4 SULFATE ION × 4
TBU TERTIARY-BUTYL ALCOHOL × 2
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.8;293 K;90% ammonia sulfate, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.8), 4% tert-butanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.154
|
|
4N0K
Atomic resolution crystal structure of a cytochrome c-calixarene complex
提交 2013-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–107(106 aa)
|
突变:R13E
|
HEC HEME C × 1
T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.180
|
|
4N0K
Atomic resolution crystal structure of a cytochrome c-calixarene complex
提交 2013-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–107(106 aa)
|
突变:R13E
|
HEC HEME C × 1
T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.180
|
|
4P4Q
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c
提交 2014-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
7–109(103 aa)
片段:UNP residues 7-109
|
未记录
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.278
|
|
4P4Q
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c
提交 2014-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
7–109(103 aa)
片段:UNP residues 7-109
|
未记录
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.278
|
|
4Q5P
Lysine-Ligated Yeast Iso-1 Cytochrome C
提交 2014-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4–109(106 aa)
片段:UNP residues 7-109
|
突变:T78C, K79G
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.2 M ammonium phosphate, pH 8.1, 30% w/v PEG300, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.204
|
|
4Q5P
Lysine-Ligated Yeast Iso-1 Cytochrome C
提交 2014-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
4–109(106 aa)
片段:UNP residues 7-109
|
突变:T78C, K79G
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.2 M ammonium phosphate, pH 8.1, 30% w/v PEG300, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.204
|
|
4Q5P
Lysine-Ligated Yeast Iso-1 Cytochrome C
提交 2014-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
4–109(106 aa)
片段:UNP residues 7-109
|
突变:T78C, K79G
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.2 M ammonium phosphate, pH 8.1, 30% w/v PEG300, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.204
|
|
4QAO
Lysine-ligated cytochrome c with F82H
提交 2014-05-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4–107(104 aa)
片段:UNP residues 8-109
|
突变:T78C, K79G, F82H
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;28% w/v PEG, 0.3 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.223
|
|
4QAO
Lysine-ligated cytochrome c with F82H
提交 2014-05-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
4–107(104 aa)
片段:UNP residues 8-109
|
突变:T78C, K79G, F82H
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;28% w/v PEG, 0.3 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.223
|
|
4QAO
Lysine-ligated cytochrome c with F82H
提交 2014-05-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
4–107(104 aa)
片段:UNP residues 8-109
|
突变:T78C, K79G, F82H
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;28% w/v PEG, 0.3 M ammonium phosphate, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.223
|
|
4YE1
A cytochrome c plus calixarene structure - alternative ligand binding mode
提交 2015-02-23
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:R13E
|
HEC HEME C × 1
T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.160
|
|
4YE1
A cytochrome c plus calixarene structure - alternative ligand binding mode
提交 2015-02-23
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
突变:R13E
|
HEC HEME C × 1
T3Y 25,26,27,28-tetrahydroxypentacyclo[19.3.1.1~3,7~.1~9,13~.1~15,19~]octacosa-1(25),3(28),4,6,9(27),10,12,15(26),16,18,21,23-dodecaene-5,11,17,23-tetrasulfonic acid × 2
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;18 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM sodium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.160
|
|
5CIB
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to 2,4-dimethylaniline with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
2–109(108 aa)
片段:iso-1 cytochrome c
链 D
2–109(108 aa)
片段:iso-1 cytochrome c
|
未记录
|
HEC HEME C × 4
51S 2,4-dimethylaniline × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 3.01 Å
R-free 0.304
|
|
5CIC
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to 3-aminobenzotrifluoride with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
2–109(108 aa)
链 D
2–109(108 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 4
51R 3-(trifluoromethyl)aniline × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.228
|
|
5CID
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to o-toluidine with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
2–109(108 aa)
链 D
2–109(108 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 4
51V 2-methylaniline × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.268
|
|
5CIE
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) bound to aniline with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
2–109(108 aa)
链 D
2–109(108 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 4
ANL ANILINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.294
|
|
5CIF
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.268
|
|
5CIF
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191F) with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.268
|
|
5CIG
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.298
|
|
5CIG
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191G) with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
2–109(108 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.298
|
|
5CIH
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191Y) with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.310
|
|
5CIH
Complex of yeast cytochrome c peroxidase (W191Y) with iso-1 cytochrome c
提交 2015-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG 3350 15-15%, 100 mM NaAcetate, 175 mM NaCl
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.310
|
|
5KKE
Crystal Structure of a Domain-swapped Dimer of Yeast Iso-1-cytochrome c with CYMAL5
提交 2016-06-21
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:K72A, C102S
|
HEC HEME C × 2
SO4 SULFATE ION × 4
CM5 5-CYCLOHEXYL-1-PENTYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2
CL CHLORIDE ION × 2
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;Reservior solution: 77% Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.5
Protein Solution: 18 mg/mL in 75 % Ammonium Sulfate
Detergent Solution: 2.5 mM CYMAL-5 in deionized water
Mixed 2:2:1
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.204
|
|
5KLU
Crystal Structure of a Domain-swapped Dimer of Yeast Iso-1-cytochrome c with omega-undecylenyl-beta-D-maltopyranoside
提交 2016-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4–109(106 aa)
链 B
4–109(106 aa)
|
突变:K72A, C102S
突变:K72A, C102S
|
HEC HEME C × 2
6UZ omega-undecylenyl-beta-D-maltopyranoside × 2
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;Reservior: 90% ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.5
Protein: 8 mg/mL in 75% ammonium sulfate
Detergent: 12 mM w-undecylenyl-b-D-maltopyranoside in deionized water
Mixed 2:2:1
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.256
|
|
5KPF
Crystal structure of cytochrome c - Phenyl-trisulfonatocalix[4]arene complex
提交 2016-07-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
NO3 NITRATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;20 mM PEG 3350, 200 mM Ammonium Nitrate pH 6.3
cyt c-sclx4 seed (grown in 18% PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM NaOAc pH 5.6)
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.207
|
|
5KPF
Crystal structure of cytochrome c - Phenyl-trisulfonatocalix[4]arene complex
提交 2016-07-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
6VJ Phenyl-trisulfonatocalix[4]arene × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;20 mM PEG 3350, 200 mM Ammonium Nitrate pH 6.3
cyt c-sclx4 seed (grown in 18% PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM NaOAc pH 5.6)
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.207
|
|
5LFT
Crystal structure of cytochrome c - Bromo-trisulfonatocalix[4]arene complexes
提交 2016-07-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
BR BROMIDE ION × 2
6VB Bromo-trisulfonatocalix[4]arene × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;30% PEG 8000, 50 mM NaCl, 100 mM MgCl2, 50 mM NaOAc pH 5.6
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.239
|
|
5LYC
Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene
提交 2016-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3–109(107 aa)
链 B
3–109(107 aa)
|
突变:C102T
突变:C102T
|
HEC HEME C × 2
7AZ phosphonato-calix[6]arene × 2
SO4 SULFATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;3.15M ammonium sulfate
100 mM sodium citrate pH 5.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.199
|
|
5NCV
Crystal Structure of Cytochrome c in complex with p-Methylphosphonatocalix[4]arene
提交 2017-03-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
突变:T-5A, C102T
|
HEC HEME C × 1
8TE p-Methylphosphonatocalix[4]arene × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;20 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 50 mM sodium acetate (pH 5.6). [Cytochrome c] = 0.75 mM and [Methylphosphonatocalix[4]arene] = 0.3 mM
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.201
|
|
5NCV
Crystal Structure of Cytochrome c in complex with p-Methylphosphonatocalix[4]arene
提交 2017-03-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3–109(107 aa)
|
突变:T-5A, C102T
|
HEC HEME C × 1
8TE p-Methylphosphonatocalix[4]arene × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;20 % PEG 8000, 50 mM NaCl, 50 mM sodium acetate (pH 5.6). [Cytochrome c] = 0.75 mM and [Methylphosphonatocalix[4]arene] = 0.3 mM
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.201
|
|
5T7H
Crystal structure of dimeric yeast iso-1-cytochrome C with CYMAL6
提交 2016-09-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–109(109 aa)
链 D
1–109(109 aa)
|
突变:K72A, C10S
突变:K72A, C10S
|
SO4 SULFATE ION × 4
ZE7 6-cyclohexylhexan-1-ol × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;75% (NH4)2SO4, AN 86% (NH4)2SO4 AND
0.1 M TRIS RESERVOIR SOLUTION, AND 5.6 MM CYMAL-6., PH 7.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.248
|
|
5T7H
Crystal structure of dimeric yeast iso-1-cytochrome C with CYMAL6
提交 2016-09-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–109(109 aa)
链 C
1–109(109 aa)
|
突变:K72A, C10S
突变:K72A, C10S
|
SO4 SULFATE ION × 5
ZE7 6-cyclohexylhexan-1-ol × 2
HEC HEME C × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;75% (NH4)2SO4, AN 86% (NH4)2SO4 AND
0.1 M TRIS RESERVOIR SOLUTION, AND 5.6 MM CYMAL-6., PH 7.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.248
|
|
6EGY
Crystal structure of cytochrome c in complex with mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene
提交 2017-09-12
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEC HEME C × 1
SO4 SULFATE ION × 1
B4T mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.6 M sodium citrate, 0.1 M Sodium Chloride, and 0.1 M Sodium Sulfate
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.273
|
|
6EGY
Crystal structure of cytochrome c in complex with mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene
提交 2017-09-12
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEC HEME C × 1
B4T mono-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.6 M sodium citrate, 0.1 M Sodium Chloride, and 0.1 M Sodium Sulfate
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.273
|
|
6EGZ
Crystal structure of cytochrome c in complex with di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene
提交 2017-09-12
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–109(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEC HEME C × 1
B4X di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 1
SO4 SULFATE ION × 1
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.6 M Sodium Citrate, 0.1 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Sulfate
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.247
|
|
6EGZ
Crystal structure of cytochrome c in complex with di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene
提交 2017-09-12
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
突变:C102T
|
HEC HEME C × 1
B4X di-PEGylated sulfonatocalix[4]arene × 3
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.6 M Sodium Citrate, 0.1 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Sulfate
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.247
|
|
6GD6
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, H3 form with ammonium sulfate
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 1
SO4 SULFATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.75 M ammonium sulfate
0.2 M NaCl
(2x protein solution : 1x crystallisation condition)
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.136
|
|
6GD7
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, H3 form with PEG
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;5 % PEG 3350
(2x protein solution : 1x crystallisation condition)
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.183
|
|
6GD8
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;24 % PEG 3350
0.27 M NaCl
0.09 M MES pH 5.5
(2x protein solution : 1x crystallisation condition)
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.200
|
|
6GD8
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;24 % PEG 3350
0.27 M NaCl
0.09 M MES pH 5.5
(2x protein solution : 1x crystallisation condition)
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.200
|
|
6GD8
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;24 % PEG 3350
0.27 M NaCl
0.09 M MES pH 5.5
(2x protein solution : 1x crystallisation condition)
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.200
|
|
6GD8
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P31 form
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;24 % PEG 3350
0.27 M NaCl
0.09 M MES pH 5.5
(2x protein solution : 1x crystallisation condition)
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.200
|
|
6GD9
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P43212 form
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 4
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;1.85 M ammonium sulfate
0.1 M HEPES pH 7.0
0.2 M NaCl
(2x protein solution : 1x crystallisation condition)
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.286
|
|
6GDA
Cytochrome c in complex with Sulfonato-calix[8]arene, P43212 form soaked with Spermine
提交 2018-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
突变:C102T, T-5A
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
SO4 SULFATE ION × 9
SPM SPERMINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.1 M ammonium sulfate
0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.243
|
|
6P41
Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232E) in complex with iso-1 cytochrome c
提交 2019-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.273
|
|
6P41
Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232E) in complex with iso-1 cytochrome c
提交 2019-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.273
|
|
6P42
Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232H) in complex with iso-1 cytochrome c
提交 2019-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%, L-proline
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.271
|
|
6P42
Yeast cytochrome c peroxidase (W191Y:L232H) in complex with iso-1 cytochrome c
提交 2019-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
7–109(103 aa)
|
未记录
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100 mM sodium acetate,175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 18%-20%, L-proline
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.271
|
|
6P43
Yeast cytochrome c peroxidase in complex with iso-1 cytochrome c (Y48K)
提交 2019-05-25
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
2–109(108 aa)
|
突变:Y48K
|
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100 mM sodium acetate, 175 mM NaCl, 5 mM n-octyl-B-D-glucoside, polyethylene glycol 3350 14%-20%
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.228
|
|
6RGI
Partially unfolded cytochrome c in complex with sulfonatocalix[6]arene
提交 2019-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
FWQ p-sulfonatocalix[6]arene × 1
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;11 % PEG 8000, 0.1 M imidazole, 2 mM sulfonato-calix[6]arene
|
分辨率 2.64 Å
R-free 0.250
|
|
6RSI
cytochrome c co-crystallized with 25 eq. sulfonato-calix[8]arene - structure 0
提交 2019-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.20 M ammonium sulfate, 0.05 M sulfonato-calix[8]arene.
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.199
|
|
6RSJ
Cytochrome c co-crystallized with 20 eq. sulfonato-calix[8]arene and soaked with 25 eq. spermine - structure I
提交 2019-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
SPM SPERMINE × 2
SO4 SULFATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.2 M Ammonium sulfate, 0.04 M sulfonato-calix[8]arene
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.212
|
|
6RSK
Cytochrome c co-crystallized with 20 eq. sulfonato-calix[8]arene and 15 eq. spermine - structure II
提交 2019-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
SO4 SULFATE ION × 6
SPM SPERMINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.2 M Ammonium sulfate, 0.04 M sulfonato-calix[8]arene, 0.03 M spermine
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.222
|
|
6RSK
Cytochrome c co-crystallized with 20 eq. sulfonato-calix[8]arene and 15 eq. spermine - structure II
提交 2019-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
SO4 SULFATE ION × 5
SPM SPERMINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.2 M Ammonium sulfate, 0.04 M sulfonato-calix[8]arene, 0.03 M spermine
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.222
|
|
6RSL
Cytochrome c co-crystallized with 10 eq. sulfonato-calix[8]arene and 25 eq. spermine (dry-coating method) - structure III
提交 2019-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
SPM SPERMINE × 4
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.20 M Ammonium sulfate, 0.02 M sulfonato-calix[8]arene, 0.05 M spermine
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.265
|
|
6RSL
Cytochrome c co-crystallized with 10 eq. sulfonato-calix[8]arene and 25 eq. spermine (dry-coating method) - structure III
提交 2019-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 3
SPM SPERMINE × 4
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.10 M HEPES pH 7.5, 0.15 M NaCl, 2.20 M Ammonium sulfate, 0.02 M sulfonato-calix[8]arene, 0.05 M spermine
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.265
|
|
6S8Y
Crystal structure of cytochrome c in complex with a sulfonated quinoline-derived foldamer
提交 2019-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
ZN ZINC ION × 3
ACT ACETATE ION × 2
L0T 8-acetamido-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[(2-carboxy-4-sulfonato-quinolin-8-yl)carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]-4-sulfonato-quinolin-8-yl]carbamoyl]quinoline-4-sulfonate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;293 K;5 % PEG 3350, 100 mM sodium acetate pH 4.5, 200 mM zinc acetate
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.267
|
|
6SUY
Yeast cytochrome c in complex with an octa-anionic calix[4]arene
提交 2019-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–109(108 aa)
链 B
2–109(108 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 2
LVT octa-anionic calix[4]arene × 2
NA SODIUM ION × 2
SO4 SULFATE ION × 5
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;3.15 M Ammonium sulfate + 0.1 M sodium citrate pH 5.0
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.179
|
|
6Y0J
Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene
提交 2020-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.269
|
|
6Y0J
Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene
提交 2020-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3–109(107 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 1
7AZ phosphonato-calix[6]arene × 2
EVB sulfonato-calix[8]arene × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.269
|
|
6Y0J
Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene
提交 2020-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
3–109(107 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 1
7AZ phosphonato-calix[6]arene × 1
EVB sulfonato-calix[8]arene × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.269
|
|
6Y0J
Cytochrome c in complex with phosphonato-calix[6]arene and sulfonato-calix[8]arene
提交 2020-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
3–109(107 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 1
7AZ phosphonato-calix[6]arene × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.269
|
|
7BBT
Structure of cytochrome c in complex with a p-benzyl-sulfonato-calix[8]arene-PEG pseudorotaxane
提交 2020-12-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3–109(107 aa)
链 B
3–109(107 aa)
链 C
3–109(107 aa)
链 D
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 4
T8W 4-[[49,50,51,52,53,54,55,56-octahydroxy-11,17,23,29,35,41,47-heptakis[(4-sulfonatophenyl)methyl]-5-nonacyclo[43.3.1.13,7.19,13.115,19.121,25.127,31.133,37.139,43]hexapentaconta-1(49),3,5,7(56),9,11,13(55),15,17,19(54),21,23,25(53),27,29,31(52),33,35,37(51),39,41,43(50),45,47-tetracosaenyl]methyl]benzenesulfonate × 3
15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20 % PEG 3350
200mM Ammonium formate
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分辨率 3.02 Å
R-free 0.261
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|
7MRI
Crystal structure of N63T yeast iso-1-cytochrome c
提交 2021-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG1000
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.208
|
|
7MRI
Crystal structure of N63T yeast iso-1-cytochrome c
提交 2021-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
3–109(107 aa)
|
未记录
|
HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG1000
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.208
|
|
7MRI
Crystal structure of N63T yeast iso-1-cytochrome c
提交 2021-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
3–109(107 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG1000
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.208
|
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7PR2
Cocrystal of cytochrome c and sulfonato-thiacalix[4]arene
提交 2021-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3–109(107 aa)
链 B
3–109(107 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 2
80M sulfonato-thiacalix[4]arene × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;25% PEG 3350, 100 mM tri-Sodium citrate pH 5.6, 100 mM Magnesium chloride
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分辨率 1.73 Å
R-free 0.251
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7PR3
Cocrystal Form I of a cytochrome c, sulfonato-thiacalix[4]arene - zinc cluster
提交 2021-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3–109(107 aa)
链 B
3–109(107 aa)
链 C
3–109(107 aa)
链 D
3–109(107 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 4
ZN ZINC ION × 33
80M sulfonato-thiacalix[4]arene × 6
PO4 PHOSPHATE ION × 6
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;20% PEG 3350, 100 mM sodium acetate pH 5.6, 30 mM zinc acetate
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分辨率 2.37 Å
R-free 0.253
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7PR4
Cocrystal Form II of a cytochrome c, sulfonato-thiacalix[4]arene - zinc cluster
提交 2021-09-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3–109(107 aa)
|
未记录
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HEC HEME C × 1
80M sulfonato-thiacalix[4]arene × 1
ZN ZINC ION × 6
PO4 PHOSPHATE ION × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;20% PEG 3350, 100 mM sodium acetate pH 5.6, 10 mM zinc acetate
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分辨率 1.32 Å
R-free 0.225
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9Q39
Structure of a sortase-linked cytochrome c peroxidase - cytochrome c fusion protein
提交 2025-08-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
7–109(103 aa)
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未记录
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PO4 PHOSPHATE ION × 1
HEC HEME C × 1
HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;295 K;Upon purification, CcP-GGSG(2x)LPATGGG was buffer exchanged into filtered nanopure water and concentrated to 0.5 mM. Initial crystal hits were obtained using a Gryphon robot (Arts Robbins Instrument). Larger crystals were optimized via vapor diffusion in 4 microliter sitting drops, which were mixed 1:1 with well solution (14-20 % PEG 8000, 40 mM KH2PO4, 20 % glycerol, pH 3.0-5.5). Crystals growing under these conditions formed within a week.
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分辨率 3.24 Å
R-free 0.331
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