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1Z1Z
NMR structure of the gpu tail protein from lambda bacteriophage
提交 2005-03-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–131(131 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.8;293 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM KCl;压力 1
NMR样品组成
0.9 mM gpU, U-15N,13C, 10 mM Tris-d11, pH 7.8, 50 mM potassium chloride, 0.02% sodium azide, 10% D2O, 90% H2O | 10% D2O, 90% H2O
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分辨率未提供
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3FZ2
Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-D74A)
提交 2009-01-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–131(131 aa)
链 B
1–131(131 aa)
链 E
1–131(131 aa)
链 F
1–131(131 aa)
链 I
1–131(131 aa)
链 K
1–131(131 aa)
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突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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SO4 SULFATE ION × 7
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.2M Di-ammonium tartrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.283
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3FZ2
Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-D74A)
提交 2009-01-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 C
1–131(131 aa)
链 D
1–131(131 aa)
链 G
1–131(131 aa)
链 H
1–131(131 aa)
链 J
1–131(131 aa)
链 L
1–131(131 aa)
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突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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SO4 SULFATE ION × 6
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.2M Di-ammonium tartrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.283
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3FZ2
Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-D74A)
提交 2009-01-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
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链 A
1–131(131 aa)
链 B
1–131(131 aa)
链 C
1–131(131 aa)
链 D
1–131(131 aa)
链 E
1–131(131 aa)
链 F
1–131(131 aa)
链 G
1–131(131 aa)
链 H
1–131(131 aa)
链 I
1–131(131 aa)
链 J
1–131(131 aa)
链 K
1–131(131 aa)
链 L
1–131(131 aa)
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突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:D74A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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SO4 SULFATE ION × 13
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.2M Di-ammonium tartrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.283
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8IYD
Tail cap of phage lambda tail
提交 2023-04-04
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 30
PDB 声明:30-meric
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链 G
1–131(131 aa)
链 K
1–131(131 aa)
链 Q
1–131(131 aa)
链 U
1–131(131 aa)
链 W
1–131(131 aa)
链 u
1–131(131 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 3.10 Å
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8K37
Structure of the bacteriophage lambda neck
提交 2023-07-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
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链 A
1–131(131 aa)
链 B
1–131(131 aa)
链 C
1–131(131 aa)
链 D
1–131(131 aa)
链 E
1–131(131 aa)
链 F
1–131(131 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å
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8XOW
Mature virion portal of bacteriophage lambda
提交 2024-01-02
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:36-meric
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链 U
1–131(131 aa)
链 U1
1–131(131 aa)
链 U2
1–131(131 aa)
链 U3
1–131(131 aa)
链 U4
1–131(131 aa)
链 U5
1–131(131 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 3.32 Å
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8XPM
Mature virion portal of phage lambda with DNA
提交 2024-01-04
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 66
PDB 声明:68-meric
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链 U
1–131(131 aa)
链 U1
1–131(131 aa)
链 U2
1–131(131 aa)
链 U3
1–131(131 aa)
链 U4
1–131(131 aa)
链 U5
1–131(131 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 3.90 Å
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8XQB
Mature virion portal vertex of bacteriophage lambda
提交 2024-01-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 71
PDB 声明:71-meric
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链 U
1–131(131 aa)
链 U1
1–131(131 aa)
链 U2
1–131(131 aa)
链 U3
1–131(131 aa)
链 U4
1–131(131 aa)
链 U5
1–131(131 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 4.07 Å
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