3j9t

Yeast V-ATPase state 1

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase subunit D

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATD_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–256； UniProt 1–256

V-type proton ATPase subunit F

物种未注明

UniProt P39111

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATF_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

V-type proton ATPase catalytic subunit A

物种未注明

UniProt P17255

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–282； UniProt 2–283 作者链 A； PDB构建体 283–616； UniProt 738–1071 作者链 C； PDB构建体 1–282； UniProt 2–283 作者链 C； PDB构建体 283–616； UniProt 738–1071 作者链 E； PDB构建体 1–282； UniProt 2–283 作者链 E； PDB构建体 283–616； UniProt 738–1071

V-type proton ATPase subunit B

物种未注明

UniProt P16140

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–517； UniProt 1–517 作者链 D； PDB构建体 1–517； UniProt 1–517 作者链 F； PDB构建体 1–517； UniProt 1–517

V-type proton ATPase subunit d

物种未注明

UniProt P32366

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VA0D_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–345； UniProt 1–345

V-type proton ATPase subunit G

物种未注明

UniProt P48836

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATG_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–114； UniProt 1–114 作者链 J； PDB构建体 1–114； UniProt 1–114 作者链 L； PDB构建体 1–114； UniProt 1–114

V-type proton ATPase subunit E

物种未注明

UniProt P22203

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATE_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–233； UniProt 1–233 作者链 I； PDB构建体 1–233； UniProt 1–233 作者链 K； PDB构建体 1–233； UniProt 1–233

V-type proton ATPase subunit H

物种未注明

UniProt P41807

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

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UniProt名称	VATH_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–478； UniProt 1–478

V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform

物种未注明

UniProt P32563

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

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UniProt名称	VPH1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–840； UniProt 1–840

V-type proton ATPase subunit C

物种未注明

UniProt P31412

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit c × 10 （P25515）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATC_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392

V-type proton ATPase subunit c

物种未注明

UniProt P25515

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	V-type proton ATPase subunit D × 1 （P32610） V-type proton ATPase subunit F × 1 （P39111） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P17255） V-type proton ATPase subunit B × 3 （P16140） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit G × 3 （P48836） V-type proton ATPase subunit E × 3 （P22203） V-type proton ATPase subunit H × 1 （P41807） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit C × 1 （P31412）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATL1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 S； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 T； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 U； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 V； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 W； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 X； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 Y； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 Z； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 a； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3j9t
沉积日期 deposition_date	2015-02-23
结构标题 title	Yeast V-ATPase state 1
关键词 keywords	V-ATPase, V-type ATPase, vacuolar-type ATPase, proton pump, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3j9t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3j9t__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3j9t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	74.39 Å
Rg（电子密度）	75.24 Å
总 Rg	75.39 Å
原子数	57659
残基数	7451
排除体积	1036300 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3j9t__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit D
分子量 formula_weight	29235.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M
原子数 atom_count	57659

MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIGYQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILDEVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEEPQGETLVADQEDDVIF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit F
分子量 formula_weight	13479.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRARVDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	V-type proton ATPase catalytic subunit A
分子量 formula_weight	67665.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.3.14, 3.1.-.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E

AGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGLTVGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYGSVFENSLISSHKILLPPRSRGTITWIAPAGEYTLDEKILEVEFDGKKSDFTLYHTWPVRVPRPVTEKLSADYPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTCIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDAIIYVGCGERGNEMAEVLMEFPELYTEMSGTKEPIMKRTTLVANTSNMPVAAREASIYTGITLAEYFRDQGKNVSMIADSSSRWAEALREISGRLGEMPADQGFPAYLGAKLASFYERAGKAVALGSPDRTGSVSIVAAVSPAGGDFSDPVTTATLGITQVFWGLDKKLAQRKHFPSINTSVSYSKYTNVLNKFYDSNYPEFPVLRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIKEDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQKAVANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEKLLSTMQERFAESTD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit B
分子量 formula_weight	57815.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F

MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVFEGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDTMNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKILDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit d
分子量 formula_weight	39822.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MEGVYFNIDNGFIEGVVRGYRNGLLSNNQYINLTQCDTLEDLKLQLSSTDYGNFLSSVSSESLTTSLIQEYASSKLYHEFNYIRDQSSGSTRKFMDYITYGYMIDNVALMITGTIHDRDKGEILQRCHPLGWFDTLPTLSVATDLESLYETVLVDTPLAPYFKNCFDTAEELDDMNIEIIRNKLYKAYLEDFYNFVTEEIPEPAKECMQTLLGFEADRRSINIALNSLQSSDIDPDLKSDLLPNIGKLYPLATFHLAQAQDFEGVRAALANVYEYRGFLETGNLEDHFYQLEMELCRDAFTQQFAISTVWAWMKSKEQEVRNITWIAECIAQNQRERINNYISVY

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit G
分子量 formula_weight	12738.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,H,J

MSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKAEAGVQGELAEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit E
分子量 formula_weight	26508.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,G,I

MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTIANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREYGEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit H
分子量 formula_weight	54482.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MGATKILMDSTHFNEIRSIIRSRSVAWDALARSEELSEIDASTAKALESILVKKNIGDGLSSSNNAHSGFKVNGKTLIPLIHLLSTSDNEDCKKSVQNLIAELLSSDKYGDDTVKFFQEDPKQLEQLFDVSLKGDFQTVLISGFNVVSLLVQNGLHNVKLVEKLLKNNNLINILQNIEQMDTCYVCIRLLQELAVIPEYRDVIWLHEKKFMPTLFKILQRATDSQLATRIVATNSNHLGIQLQYHSLLLIWLLTFNPVFANELVQKYLSDFLDLLKLVKITIKEKVSRLCISIILQCCSTRVKQHKKVIKQLLLLGNALPTVQSLSERKYSDEELRQDISNLKEILENEYQELTSFDEYVAELDSKLLCWSPPHVDNGFWSDNIDEFKKDNYKIFRQLIELLQAKVRNGDVNAKQEKIIIQVALNDITHVVELLPESIDVLDKTGGKADIMELLNHSDSRVKYEALKATQAIIGYTFK

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform
分子量 formula_weight	95625.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MAEKEEAIFRSAEMALVQFYIPQEISRDSAYTLGQLGLVQFRDLNSKVRAFQRTFVNEIRRLDNVERQYRYFYSLLKKHDIKLYEGDTDKYLDGSGELYVPPSGSVIDDYVRNASYLEERLIQMEDATDQIEVQKNDLEQYRFILQSGDEFFLKGDNTDSTSYMDEDMIDANGENIAAAIGASVNYVTGVIARDKVATLEQILWRVLRGNLFFKTVEIEQPVYDVKTREYKHKNAFIVFSHGDLIIKRIRKIAESLDANLYDVDSSNEGRSQQLAKVNKNLSDLYTVLKTTSTTLESELYAIAKELDSWFQDVTREKAIFEILNKSNYDTNRKILIAEGWIPRDELATLQARLGEMIARLGIDVPSIIQVLDTNHTPPTFHRTNKFTAGFQSICDCYGIAQYREINAGLPTIVTFPFMFAIMFGDMGHGFLMTLAALSLVLNEKKINKMKRGEIFDMAFTGRYIILLMGVFSMYTGFLYNDIFSKTMTIFKSGWKWPDHWKKGESITATSVGTYPIGLDWAWHGTENALLFSNSYKMKLSILMGFIHMTYSYFFSLANHLYFNSMIDIIGNFIPGLLFMQGIFGYLSVCIVYKWAVDWVKDGKPAPGLLNMLINMFLSPGTIDDELYPHQAKVQVFLLLMALVCIPWLLLVKPLHFKFTHKKKSHEPLPSTEADASSEDLEAQQLISAMDADDAEEEEVGSGSHGEDFGDIMIHQVIHTIEFCLNCVSHTASYLRLWALSLAHAQLSSVLWTMTIQIAFGFRGFVGVFMTVALFAMWFALTCAVLVLMEGTSAMLHSLRLHWVESMSKFFVGEGLPYEPFAFEYKDMEVAVASASSSASS

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit C
分子量 formula_weight	44241.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIGKIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLAAAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFKKNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYGLPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit c
分子量 formula_weight	16357.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,R,U,V,T,W,S,X,Z,a

MTELCPVYAPFFGAIGCASAIIFTSLGAAYGTAKSGVGICATCVLRPDLLFKNIVPVIMAGIIAIYGLVVSVLVCYSLGQKQALYTGFIQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGSSQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALLLNSRATQDVVC

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 53 domains

SCOP 2.08 (53 domains)

结构域编号 domain_id	d3j9ta1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.2 — N-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d3j9ta2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d3j9ta3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.5 — V1 ATP synthase A subunit, bulge domain-like
家族 Family family	b.84.5.1 — V1 ATP synthase A subunit, bulge domain-like

结构域编号 domain_id	d3j9ta4
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.2 — C-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase and A1 ATP sythase

结构域编号 domain_id	d3j9tb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.2 — N-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d3j9tb2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d3j9tb3
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.2 — C-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase and A1 ATP sythase

结构域编号 domain_id	d3j9tc1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.2 — N-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d3j9tc2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d3j9tc3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.5 — V1 ATP synthase A subunit, bulge domain-like
家族 Family family	b.84.5.1 — V1 ATP synthase A subunit, bulge domain-like

结构域编号 domain_id	d3j9tc4
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.2 — C-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase and A1 ATP sythase

结构域编号 domain_id	d3j9td1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.2 — N-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d3j9td2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d3j9td3
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.2 — C-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase and A1 ATP sythase

结构域编号 domain_id	d3j9te1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.2 — N-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d3j9te2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d3j9te3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.5 — V1 ATP synthase A subunit, bulge domain-like
家族 Family family	b.84.5.1 — V1 ATP synthase A subunit, bulge domain-like

结构域编号 domain_id	d3j9te4
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.2 — C-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase and A1 ATP sythase

结构域编号 domain_id	d3j9tf1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.49 — Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	b.49.1 — N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	b.49.1.2 — N-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase

结构域编号 domain_id	d3j9tf2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.11 — RecA protein-like (ATPase-domain)

结构域编号 domain_id	d3j9tf3
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.69 — Left-handed superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.69.1 — C-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases
家族 Family family	a.69.1.2 — C-terminal domain of A and B subunits of V1 ATP synthase and A1 ATP sythase

结构域编号 domain_id	d3j9tg1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.4 — V-type ATPase subunit E-like
家族 Family family	d.81.4.1 — V-type ATPase subunit E C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3j9tg2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.36 — V-type ATPase peripheral stalk subunit E coiled coil
家族 Family family	h.1.36.1 — V-type ATPase peripheral stalk subunit E coiled coil

结构域编号 domain_id	d3j9th_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.37 — V-type ATPase peripheral stalk subunit G coiled coil
家族 Family family	h.1.37.1 — V-type ATPase peripheral stalk subunit G coiled coil

结构域编号 domain_id	d3j9ti1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.4 — V-type ATPase subunit E-like
家族 Family family	d.81.4.1 — V-type ATPase subunit E C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3j9ti2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.36 — V-type ATPase peripheral stalk subunit E coiled coil
家族 Family family	h.1.36.1 — V-type ATPase peripheral stalk subunit E coiled coil

结构域编号 domain_id	d3j9tj_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.37 — V-type ATPase peripheral stalk subunit G coiled coil
家族 Family family	h.1.37.1 — V-type ATPase peripheral stalk subunit G coiled coil

结构域编号 domain_id	d3j9tk1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.81 — FwdE/GAPDH domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.81.4 — V-type ATPase subunit E-like
家族 Family family	d.81.4.1 — V-type ATPase subunit E C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3j9tk2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.36 — V-type ATPase peripheral stalk subunit E coiled coil
家族 Family family	h.1.36.1 — V-type ATPase peripheral stalk subunit E coiled coil

结构域编号 domain_id	d3j9tl_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.37 — V-type ATPase peripheral stalk subunit G coiled coil
家族 Family family	h.1.37.1 — V-type ATPase peripheral stalk subunit G coiled coil

结构域编号 domain_id	d3j9tm_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.20 — V-type ATPase central rotor subunit D
家族 Family family	h.4.20.1 — V1 ATP synthase D subunit

结构域编号 domain_id	d3j9tn_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.149 — AtpF-like
超家族 Superfamily superfamily	c.149.1 — AtpF-like
家族 Family family	c.149.1.1 — AtpF-like

结构域编号 domain_id	d3j9to_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.57 — Vacuolar ATP synthase subunit C
超家族 Superfamily superfamily	e.57.1 — Vacuolar ATP synthase subunit C
家族 Family family	e.57.1.1 — Vacuolar ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	d3j9tp_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.1 — ARM repeat
家族 Family family	a.118.1.9 — Regulatory subunit H of the V-type ATPase

结构域编号 domain_id	d3j9tq_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.40 — V-type ATP synthase subunit C
超家族 Superfamily superfamily	f.40.1 — V-type ATP synthase subunit C
家族 Family family	f.40.1.1 — V-type ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	d3j9tr1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tr2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9ts1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9ts2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tt1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tt2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tu1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tu2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tv1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tv2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tw1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tw2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tx1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tx2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9ty1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9ty2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tz1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d3j9tz2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	6.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	Maximum likelihood
颗粒数 num_particles	50503

Yeast V-ATPase state 1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase catalytic subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit d

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体