3jck

Structure of the yeast 26S proteasome lid sub-complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

26S proteasome regulatory subunit RPN3

Saccharomyces cerevisiae S288c

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPN3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 46–438； UniProt 131–523

26S proteasome regulatory subunit RPN5

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt Q12250

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPN5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445

26S proteasome regulatory subunit RPN6

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt Q12377

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPN6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–434； UniProt 1–434

26S proteasome regulatory subunit RPN7

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt Q06103

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPN7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429

26S proteasome regulatory subunit RPN8

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt Q08723

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPN8_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–338； UniProt 1–338

26S proteasome regulatory subunit RPN9

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt Q04062

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPN9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–393； UniProt 1–393

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt P43588

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPN11_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–306； UniProt 1–306

26S proteasome regulatory subunit RPN12

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt P32496

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome complex subunit SEM1 × 1 （O94742） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPN12_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–274； UniProt 1–274

26S proteasome complex subunit SEM1

Saccharomyces cerevisiae S288c

UniProt O94742

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	26S proteasome regulatory subunit RPN3 × 1 （P40016） 26S proteasome regulatory subunit RPN5 × 1 （Q12250） 26S proteasome regulatory subunit RPN6 × 1 （Q12377） 26S proteasome regulatory subunit RPN7 × 1 （Q06103） 26S proteasome regulatory subunit RPN8 × 1 （Q08723） 26S proteasome regulatory subunit RPN9 × 1 （Q04062） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 × 1 （P43588） 26S proteasome regulatory subunit RPN12 × 1 （P32496） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SEM1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3jck
沉积日期 deposition_date	2015-12-20
结构标题 title	Structure of the yeast 26S proteasome lid sub-complex
关键词 keywords	Proteasome, deubiquitinase, Rpn11, protein homeostasis, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3jck__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3jck__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3jck__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.78 Å
Rg（电子密度）	56.02 Å
总 Rg	56.02 Å
原子数	22456
残基数	2777
排除体积	402930 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3jck__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`3jck__assembly_1__model_2`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`3jck__assembly_1__model_3`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`3jck__assembly_1__model_4`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`3jck__assembly_1__model_5`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit RPN3
分子量 formula_weight	49573.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	112285

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAEINCFMHLLVQLFLWDSKELEQLVEFNRKVVIPNLLCYYNLRSLNLINAKLWFYIYLSHETLARSSEEINSDNQNIILRSTMMKFLKIASLKHDNETKAMLINLILRDFLNNGEVDSASDFISKLEYPHTDVSSSLEARYFFYLSKINAIQLDYSTANEYIIAAIRKAPHNSKSLGFLQQSNKLHCCIQLLMGDIPELSFFHQSNMQKSLLPYYHLTKAVKLGDLKKFTSTITKYKQLLLKDDTYQLCVRLRSNVIKTGIRIISLTYKKISLRDICLKLNLDSEQTVEYMVSRAIRDGVIEAKINHEDGFIETTELLNIYDSEDPQQVFDERIKFANQLHDEYLVSMRYPEDKKTQQNEKSENGENDDDTLDGDLMDDMSDISDLDDLGFL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit RPN5
分子量 formula_weight	51840.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSRDAPIKADKDYSQILKEEFPKIDSLAQNDCNSALDQLLVLEKKTRQASDLASSKEVLAKIVDLLASRNKWDDLNEQLTLLSKKHGQLKLSIQYMIQKVMEYLKSSKSLDLNTRISVIETIRVVTENKIFVEVERARVTKDLVEIKKEEGKIDEAADILCELQVETYGSMEMSEKIQFILEQMELSILKGDYSQATVLSRKILKKTFKNPKYESLKLEYYNLLVKISLHKREYLEVAQYLQEIYQTDAIKSDEAKWKPVLSHIVYFLVLSPYGNLQNDLIHKIQNDNNLKKLESQESLVKLFTTNELMRWPIVQKTYEPVLNEDDLAFGGEANKHHWEDLQKRVIEHNLRVISEYYSRITLLRLNELLDLTESQTETYISDLVNQGIIYAKVNRPAKIVNFEKPKNSSQLLNEWSHNVDELLEHIETIGHLITKEEIMHGLQAK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit RPN6
分子量 formula_weight	49839.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSLPGSKLEEARRLVNEKQYNEAEQVYLSLLDKDSSQSSAAAGASVDDKRRNEQETSILELGQLYVTMGAKDKLREFIPHSTEYMMQFAKSKTVKVLKTLIEKFEQVPDSLDDQIFVCEKSIEFAKREKRVFLKHSLSIKLATLHYQKKQYKDSLALINDLLREFKKLDDKPSLVDVHLLESKVYHKLRNLAKSKASLTAARTAANSIYCPTQTVAELDLMSGILHCEDKDYKTAFSYFFESFESYHNLTTHNSYEKACQVLKYMLLSKIMLNLIDDVKNILNAKYTKETYQSRGIDAMKAVAEAYNNRSLLDFNTALKQYEKELMGDELTRSHFNALYDTLLESNLCKIIEPFECVEISHISKIIGLDTQQVEGKLSQMILDKIFYGVLDQGNGWLYVYETPNQDATYDSALELVGQLNKVVDQLFEKASVLY

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit RPN7
分子量 formula_weight	49016.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MVDVEEKSQEVEYVDPTVNRVPNYEVSEKAFLLTQSKVSIEQRKEAAEFVLAKIKEEEMAPYYKYLCEEYLVNNGQSDLEHDEKSDSLNEWIKFDQELYNELCKKNESKIKELNEKIQKLEEDDEGELEQAQAWINLGEYYAQIGDKDNAEKTLGKSLSKAISTGAKIDVMLTIARLGFFYNDQLYVKEKLEAVNSMIEKGGDWERRNRYKTYYGIHCLAVRNFKEAAKLLVDSLATFTSIELTSYESIATYASVTGLFTLERTDLKSKVIDSPELLSLISTTAALQSISSLTISLYASDYASYFPYLLETYANVLIPCKYLNRHADFFVREMRRKVYAQLLESYKTLSLKSMASAFGVSVAFLDNDLGKFIPNKQLNCVIDRVNGIVETNRPDNKNAQYHLLVKQGDGLLTKLQKYGAAVRLTGSDRV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit RPN8
分子量 formula_weight	38365.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSLQHEKVTIAPLVLLSALDHYERTQTKENKRCVGVILGDANSSTIRVTNSFALPFEEDEKNSDVWFLDHNYIENMNEMCKKINAKEKLIGWYHSGPKLRASDLKINELFKKYTQNNPLLLIVDVKQQGVGLPTDAYVAIEQVKDDGTSTEKTFLHLPCTIEAEEAEEIGVEHLLRDVRDQAAGGLSIRLTNQLKSLKGLQSKLKDVVEYLDKVINKELPINHTILGKLQDVFNLLPNLGTPDDDEIDVENHDRINISNNLQKALTVKTNDELMVIYISNLVRSIIAFDDLIENKIQNKKIQEQRVKDKQSKVSDDSESESGDKEATAPLIQRKNKKN

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit RPN9
分子量 formula_weight	45839.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MFNNHEIDTILSTLRMEADPSLHPLFEQFEKFYEEKLWFQLSESLTKFFDDAKSTPLRLRLYDNFVSKFYDKINQLSVVKYLLASLKDSKDFDESLKYLDDLKAQFQELDSKKQRNNGSKDHGDGILLIDSEIARTYLLKNDLVKARDLLDDLEKTLDKKDSIPLRITNSFYSTNSQYFKFKNDFNSFYYTSLLYLSTLEPSTSITLAERQQLAYDLSISALLGDKIYNFGELLHHPIMETIVNDSNYDWLFQLLNALTVGDFDKFDSLIKVQISKIPILAQHESFLRQKICLMTLIETVFVKNIRMLSFEDISKATHLPKDNVEHLVMRAISLGLLKGSIDQVNELVTISWVQPRIISGDQITKMKDRLVEWNDQVEKLGKKMEARGQSIWV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11
分子量 formula_weight	34442.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.19.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MERLQRLMMNSKVGSADTGRDDTKETVYISSIALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVNVVDVFAMPQSGTGVSVEAVDDVFQAKMMDMLKQTGRDQMVVGWYHSHPGFGCWLSSVDVNTQKSFEQLNSRAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLIDTGALINNLEPRQTTSNTGLLNKANIQALIHGLNRHYYSLNIDYHKTAKETKMLMNLHKEQWQSGLKMYDYEEKEESNLAATKSMVKIAEQYSKRIEEEKELTEEELKTRYVGRQDPKKHLSETADETLENNIVSVLTAGVNSVAIK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit RPN12
分子量 formula_weight	31952.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MPSLAELTKSLSIAFENGDYAACEKLLPPIKIELIKNNLLIPDLSIQNDIYLNDLMITKRILEVGALASIQTFNFDSFENYFNQLKPYYFSNNHKLSESDKKSKLISLYLLNLLSQNNTTKFHSELQYLDKHIKNLEDDSLLSYPIKLDRWLMEGSYQKAWDLLQSGSQNISEFDSFTDILKSAIRDEIAKNTELSYDFLPLSNIKALLFFNNEKETEKFALERNWPIVNSKVYFNNQSKEKADYEDEMMHEEDQKTNIIEKAMDYAISIENIV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	26S proteasome complex subunit SEM1
分子量 formula_weight	10397.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MSTDVAAAQAQSKIDLTKKKNEEINKKSLEEDDEFEDFPIDTWANGETIKSNAVTQTNIWEENWDDVEVDDDFTNELKAELDRYKRENQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288c
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3jckC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 —

结构域编号 domain_id	3jckE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	140 — Cytidine Deaminase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytidine Deaminase, domain 2

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	projection matching
颗粒数 num_particles	109396

Structure of the yeast 26S proteasome lid sub-complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

26S proteasome regulatory subunit RPN3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit RPN5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit RPN6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit RPN7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit RPN8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit RPN9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit RPN12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome complex subunit SEM1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

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