3lk4

Crystal structure of CapZ bound to the uncapping motif from CD2AP

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 240.5 Å Quality: EXCELLENT

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-actin-capping protein subunit alpha-1

Gallus gallus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
10	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 1； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
11	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 4； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
12	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 7； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 S； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 V； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
9	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 1–286	未记录	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3LK4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1IZN Crystal Structure of Actin Filament Capping Protein CapZ 提交 2002-10-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；PEG3350, magnesium nitrate, MES-NAOH, Jeffamine M-600, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
1IZN Crystal Structure of Actin Filament Capping Protein CapZ 提交 2002-10-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–286（286 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；PEG3350, magnesium nitrate, MES-NAOH, Jeffamine M-600, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
2KXP Solution NMR structure of V-1 bound to capping protein (CP) 提交 2010-05-11	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 7–281（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein alpha1 subunit, 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein beta1 subunit, 0.35 mM [U-99% 2H] V-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 2H] capping protein alpha1 subunit, 0.35 mM [U-99% 2H] capping protein beta1 subunit, 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] V-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein alpha1 subunit, 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein beta1 subunit, 0.35 mM [U-99% 2H] M7C V-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KZ7 Solution structure of the CARMIL CAH3a/b domain bound to capping protein (CP) 提交 2010-06-12	实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；305 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPalpha subunit, 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPbeta subunit, 0.39 mM [U-2H] CARMIL CAH3a/b domain, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CARMIL CAH3a/b domain, 0.39 mM [U-2H] CPalpha subunit, 0.39 mM [U-2H] CPbeta subunit, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPalpha subunit, 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPbeta subunit, 0.39 mM [U-2H; spin labeled at 1 or 5 postions] CARMIL CAH3a/b domain, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
3AA0 Crystal structure of Actin Capping Protein in complex with the Cp-binding motif derived from CARMIL 提交 2009-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	CO3 CARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；18% PEG 400, 40MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
3AA1 Crystal structure of Actin capping protein in complex with the Cp-binding motif derived from CKIP-1 提交 2009-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；17.5% PEG 400, 30MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3AA6 Crystal structure of Actin capping protein in complex with the Cp-binding motif derived from CD2AP 提交 2009-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	BA BARIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% PEG 400, 20MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3AA7 Crystal structure of Actin capping protein 提交 2009-11-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	BA BARIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；12.5% PEG 400, 20MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.261
3AAA Crystal Structure of Actin capping protein in complex with V-1 提交 2009-11-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.35；293 K；10% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL, 20MM EDTA, 0.1M TRIS-HCL, pH 8.35, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.20 Å R-free 0.237
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3LK2 Crystal structure of CapZ bound to the uncapping motif from CARMIL 提交 2010-01-27	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10% w/v PEG 20000, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
3LK3 Crystal structure of CapZ bound to the CPI and CSI uncapping motifs from CARMIL 提交 2010-01-27	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2M KCl, 20% (w/v) PEG 3350 , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.68 Å R-free 0.248
7DS2 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1 C-terminus tail 提交 2020-12-30	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；22.5% (w/v) PEG 400, 0.1M HEPES-NaOH (pH = 7.0)	分辨率 1.95 Å R-free 0.183
7DS3 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-2 C-terminus tail 提交 2020-12-30	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 2.09 Å R-free 0.251
7DS4 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1 C-terminus tail F323K mutant 提交 2020-12-30	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) ethanol, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.85 Å R-free 0.259
7DS6 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (TWN-CDC) 提交 2020-12-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) ethanol, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.69 Å R-free 0.253
7DS8 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (CDN-TWC) 提交 2020-12-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4% (w/v) PEG 3350, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.95 Å R-free 0.233
7DSA Crystal structure of actin capping protein in complex with V-1 (space group P62) 提交 2020-12-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M Magnesium Acetate	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
7DSB Crystal structure of actin capping protein in complex with V-1 and twinfilin C-terminal tail 提交 2020-12-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) isopropanol, 0.1M HEPES-NaOH (pH = 7.5)	分辨率 2.44 Å R-free 0.248
9BLI Crystal structure of Actin capping protein in complex with a fragment of Legionella pneumophila RavB 提交 2024-04-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	FMT FORMIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10 mM Tris pH 8.0, 0.2 M ammonium formate, 0.15 M NaCl, 21% w/v PEG 3350, 30% ethylene glycol	分辨率 2.00 Å R-free 0.208

共 19 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAZA1_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 4； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 7； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 A； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 D； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 G； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 J； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 M； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 P； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 S； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 V； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 Y； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

Gallus gallus

UniProt P14315

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
10	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 2； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
11	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 5； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
12	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 8； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 Q； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 T； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 W； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
9	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 Z； UniProt 1–277	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） CD2-associated protein × 1 （Q9Y5K6）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3LK4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1IZN Crystal Structure of Actin Filament Capping Protein CapZ 提交 2002-10-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–277（277 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；PEG3350, magnesium nitrate, MES-NAOH, Jeffamine M-600, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
1IZN Crystal Structure of Actin Filament Capping Protein CapZ 提交 2002-10-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–277（277 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；PEG3350, magnesium nitrate, MES-NAOH, Jeffamine M-600, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
2KXP Solution NMR structure of V-1 bound to capping protein (CP) 提交 2010-05-11	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–271（270 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein alpha1 subunit, 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein beta1 subunit, 0.35 mM [U-99% 2H] V-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 2H] capping protein alpha1 subunit, 0.35 mM [U-99% 2H] capping protein beta1 subunit, 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] V-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein alpha1 subunit, 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] capping protein beta1 subunit, 0.35 mM [U-99% 2H] M7C V-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KZ7 Solution structure of the CARMIL CAH3a/b domain bound to capping protein (CP) 提交 2010-06-12	实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–277（277 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；305 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPalpha subunit, 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPbeta subunit, 0.39 mM [U-2H] CARMIL CAH3a/b domain, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CARMIL CAH3a/b domain, 0.39 mM [U-2H] CPalpha subunit, 0.39 mM [U-2H] CPbeta subunit, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPalpha subunit, 0.35 mM [U-99% 15N; U-80% 2H] CPbeta subunit, 0.39 mM [U-2H; spin labeled at 1 or 5 postions] CARMIL CAH3a/b domain, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
3AA0 Crystal structure of Actin Capping Protein in complex with the Cp-binding motif derived from CARMIL 提交 2009-11-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	突变：residues 244-277 deletion mutation	CO3 CARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；18% PEG 400, 40MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
3AA1 Crystal structure of Actin capping protein in complex with the Cp-binding motif derived from CKIP-1 提交 2009-11-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	突变：residues 244-277 deletion mutation	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；17.5% PEG 400, 30MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3AA6 Crystal structure of Actin capping protein in complex with the Cp-binding motif derived from CD2AP 提交 2009-11-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	突变：residues 244-277 deletion mutation	BA BARIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% PEG 400, 20MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3AA7 Crystal structure of Actin capping protein 提交 2009-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–244（244 aa）	突变：residues 244-277 deletion mutation	BA BARIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；12.5% PEG 400, 20MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.261
3AAA Crystal Structure of Actin capping protein in complex with V-1 提交 2009-11-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–277（277 aa）	未记录	IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.35；293 K；10% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL, 20MM EDTA, 0.1M TRIS-HCL, pH 8.35, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.20 Å R-free 0.237
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–277（277 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–277（277 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–277（277 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–277（277 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3AAE Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment 提交 2009-11-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–277（277 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 3350, 180MM TRI-AMMONIUM CITRATE, 100MM MES-NAOH, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.271
3LK2 Crystal structure of CapZ bound to the uncapping motif from CARMIL 提交 2010-01-27	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–243（243 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10% w/v PEG 20000, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
3LK3 Crystal structure of CapZ bound to the CPI and CSI uncapping motifs from CARMIL 提交 2010-01-27	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–277（277 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2M KCl, 20% (w/v) PEG 3350 , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.68 Å R-free 0.248
7DS2 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1 C-terminus tail 提交 2020-12-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；22.5% (w/v) PEG 400, 0.1M HEPES-NaOH (pH = 7.0)	分辨率 1.95 Å R-free 0.183
7DS3 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-2 C-terminus tail 提交 2020-12-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 2.09 Å R-free 0.251
7DS4 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1 C-terminus tail F323K mutant 提交 2020-12-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) ethanol, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.85 Å R-free 0.259
7DS6 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (TWN-CDC) 提交 2020-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) ethanol, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.69 Å R-free 0.253
7DS8 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (CDN-TWC) 提交 2020-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4% (w/v) PEG 3350, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.95 Å R-free 0.233
7DSA Crystal structure of actin capping protein in complex with V-1 (space group P62) 提交 2020-12-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M Magnesium Acetate	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
7DSB Crystal structure of actin capping protein in complex with V-1 and twinfilin C-terminal tail 提交 2020-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) isopropanol, 0.1M HEPES-NaOH (pH = 7.5)	分辨率 2.44 Å R-free 0.248
9BLI Crystal structure of Actin capping protein in complex with a fragment of Legionella pneumophila RavB 提交 2024-04-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	FMT FORMIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10 mM Tris pH 8.0, 0.2 M ammonium formate, 0.15 M NaCl, 21% w/v PEG 3350, 30% ethylene glycol	分辨率 2.00 Å R-free 0.208

共 19 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAPZB_CHICK
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 5； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 8； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 B； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 E； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 H； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 K； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 N； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 Q； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 T； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 W； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 Z； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277

CD2-associated protein

物种未注明

UniProt Q9Y5K6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
10	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 3； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
11	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 6； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
12	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 9； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 O； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 R； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 U； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272
9	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 0； UniProt 475–503	未记录	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG 400, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.99 Å R-free 0.272

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3LK4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2FEI Solution structure of the second SH3 domain of Human CMS protein 提交 2005-12-15	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 111–166（56 aa）片段：The second SH3 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.85；295 K；压力 1 NMR样品组成 1.0-2.0mM 15N, 13C-labeled CMS SH3 domain, 20mM phosphate buffer (pH 6.85), 50mM sodium chloride, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0-2.0mM 15N, 13C-labeled CMS SH3 domain, 20mM phosphate buffer (pH 6.85), 50mM sodium chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2J6F N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) BOUND TO CBL-B PEPTIDE 提交 2006-09-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；20% PEG3000, 0.1M ACETATE PH 5.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.218
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 L 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6K N-TERMINAL SH3 DOMAIN OF CMS (CD2AP HUMAN HOMOLOG) 提交 2006-09-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 1–62（62 aa）片段：SH3, RESIDUES 1-62	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.1；0.1 M SODIUM CITRATE PH 6.1, 25% PEG 4000, 20% ISOPROPANOL	分辨率 2.77 Å R-free 0.274
2J6O ATYPICAL POLYPROLINE RECOGNITION BY THE CMS N-TERMINAL SH3 DOMAIN. CMS:CD2 HETEROTRIMER 提交 2006-10-02	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–62（62 aa）片段：SH3 DOMAIN, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；20% PEG3000, 0.1M ACETATE PH 5.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.286
2J7I ATYPICAL POLYPROLINE RECOGNITION BY THE CMS N-TERMINAL SH3 DOMAIN. CMS:CD2 HETERODIMER 提交 2006-10-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–62（62 aa）片段：SH3 DOMAIN, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；30% PEG8000, 0.2M NACL, 0.1M TRIS-HCL PH 8.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.295
2J7I ATYPICAL POLYPROLINE RECOGNITION BY THE CMS N-TERMINAL SH3 DOMAIN. CMS:CD2 HETERODIMER 提交 2006-10-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–62（62 aa）片段：SH3 DOMAIN, RESIDUES 1-62	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；30% PEG8000, 0.2M NACL, 0.1M TRIS-HCL PH 8.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.295
3AA6 Crystal structure of Actin capping protein in complex with the Cp-binding motif derived from CD2AP 提交 2009-11-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 485–507（23 aa）片段：recidues 485-507	未记录	BA BARIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% PEG 400, 20MM BACL2, 100MM MES-NAOH, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3U23 Atomic resolution crystal structure of the 2nd SH3 domain from human CD2AP (CMS) in complex with a proline-rich peptide from human RIN3 提交 2011-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–168（60 aa）片段：unp residues 109-168	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 1.4 M tri-sodium citrate dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.11 Å R-free 0.167
4WCI Crystal structure of the 1st SH3 domain from human CD2AP (CMS) in complex with a proline-rich peptide (aa 378-393) from human RIN3 提交 2014-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–60（60 aa）片段：UNP residues 1-60	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Ca(ac) pH 4.2, 0.2 M Li2SO4 and 25% PEG 10 000	分辨率 1.65 Å R-free 0.219
4WCI Crystal structure of the 1st SH3 domain from human CD2AP (CMS) in complex with a proline-rich peptide (aa 378-393) from human RIN3 提交 2014-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–60（60 aa）片段：UNP residues 1-60	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Ca(ac) pH 4.2, 0.2 M Li2SO4 and 25% PEG 10 000	分辨率 1.65 Å R-free 0.219
4WCI Crystal structure of the 1st SH3 domain from human CD2AP (CMS) in complex with a proline-rich peptide (aa 378-393) from human RIN3 提交 2014-09-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–60（60 aa）片段：UNP residues 1-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Ca(ac) pH 4.2, 0.2 M Li2SO4 and 25% PEG 10 000	分辨率 1.65 Å R-free 0.219
4X1V Crystal structure of the 2nd SH3 domain from human CD2AP (CMS) in complex with a proline-rich peptide (aa 76-91) from human ARAP1 提交 2014-11-25	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–168（60 aa）片段：UNP residues 109-168	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 1.4 M tri-sodium citrate dehydrate	分辨率 1.58 Å R-free 0.200
7DS6 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (TWN-CDC) 提交 2020-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 496–507（12 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5% (w/v) PEG 3350, 5% (v/v) ethanol, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.69 Å R-free 0.253
7DS8 Crystal structure of actin capping protein in complex with twinflin-1/CD2AP CPI chimera peptide (CDN-TWC) 提交 2020-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 485–493（9 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4% (w/v) PEG 3350, 50mM Tris-HCl (pH = 7.0)	分辨率 1.95 Å R-free 0.233

共 11 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CD2AP_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 3； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 6； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 9； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 C； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 F； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 I； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 L； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 O； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 R； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 U； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503 作者链 X； PDB构建体 1–29； UniProt 475–503

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3lk4
沉积日期 deposition_date	2010-01-27
结构标题 title	Crystal structure of CapZ bound to the uncapping motif from CD2AP
关键词 keywords	;CapZ, CD2AP, actin filaments, uncapping, actin-filament regulators, protein-protein comple, Actin capping, Actin-binding, Cytoplasm, Cytoskeleton, PROTEIN BINDING ;; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	86.70 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	87.97 Å
零角强度 I(0) i0	7698500000.00
分子量 molecular_weight	730520.0 kDa
排除体积 excluded_volume	908240 Å³
包络体积 envelope_volume	1522100 Å³
水化壳体积 shell_volume	157720 Å³
包络直径 envelope_diameter	329.8 Å
壳层 Rg shell_rg	73.15 Å
包络 Rg envelope_rg	85.95 Å
形状 Rg shape_rg	87.96 Å
总 Rg total_rg	87.82 Å
总原子数 total_atoms	51470
残基数 n_residues	6435
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	240.5 Å
Rg (实空间) rg_real	80.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.13 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.3790e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6310e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	82.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	7613000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9199
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	80.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.382
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.444
角度范围 angular_range	— – 0.0900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.4317
最高正则化参数 α highest_alpha	303000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	19
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.990; Stabil: 0.990; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.020

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	F-actin-capping protein subunit alpha-1
分子量 formula_weight	33001.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D,G,J,M,P,S,V,Y,1,4,7
原子数 atom_count	54370

MADFEDRVSDEEKVRIAAKFITHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNMDQFTPVKIEGYDDQVLITEHGDLGNGRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPQPEDTESALKQWRDACDSALRAYVKDHYPNGFCTVYGKSIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAQVAAVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDSVQVSSDVQTAKEFIKIIENAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	bantam,chickens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2
分子量 formula_weight	31403.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E,H,K,N,Q,T,W,Z,2,5,8

MSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKTGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSIDAIPDNQKYKQLQRELSQVLTQRQIYIQPDN

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chickens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CD2-associated protein
分子量 formula_weight	3224.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F,I,L,O,R,U,X,0,3,6,9

VNFDDIASSENLLHLTANRPKMPGRRLPG

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2900

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

CATH v4.4 (48 domains)

结构域编号 domain_id	3lk4101
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4102
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4201
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4202
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4401
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4402
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4501
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4502
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4701
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4702
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4801
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4802
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4D02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4E01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4E02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4G01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4G02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4H01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4H02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4J01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4J02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4K01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4K02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4M01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4M02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4N01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4N02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4P01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4P02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4Q01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4Q02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4S01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4S02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4T01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4T02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4V01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4V02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4W01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4W02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4Y01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3lk4Y02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3lk4Z01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3lk4Z02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	59.728 Å
晶胞边长 b length_b	142.341 Å
晶胞边长 c length_c	192.999 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	89.99 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.990 Å
最低分辨率 resolution_low	19.984 Å
R 因子 r_factor	0.2277
R_work r_work	0.2253
R_free r_free	0.2722

Crystal structure of CapZ bound to the uncapping motif from CD2AP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-actin-capping protein subunit alpha-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CD2-associated protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

CATH v4.4 (48 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/lk/3lk4/3lk4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/lk/3lk4/3lk4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/lk/3lk4/3lk4.dat