SAXSdb — 3lnm

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel subunit beta-2

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera × 4 （P15387,P63142） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POTASSIUM ION × 20 water × 8	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 8	F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera × 4 （P15387,P63142） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 48 POTASSIUM ION × 20 water × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCAB2_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–333； UniProt 36–367 作者链 C； PDB构建体 2–333； UniProt 36–367

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera

Rattus norvegicus

UniProt P15387

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POTASSIUM ION × 20 water × 8	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 48 POTASSIUM ION × 20 water × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNB1_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 286–317； UniProt 274–305 作者链 D； PDB构建体 286–317； UniProt 274–305

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera

Rattus norvegicus

UniProt P63142

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POTASSIUM ION × 20 water × 8	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 48 POTASSIUM ION × 20 water × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNA2_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 20–285； UniProt 1–266 作者链 B； PDB构建体 318–514； UniProt 303–499 作者链 D； PDB构建体 20–285； UniProt 1–266 作者链 D； PDB构建体 318–514； UniProt 303–499

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3lnm
沉积日期 deposition_date	2010-02-02
结构标题 title	F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera channel
关键词 keywords	;voltage-gated potassium channel-beta subunit complex, Acetylation, Cytoplasm, Ion transport, Ionic channel, NADP, Phosphoprotein, Potassium, Potassium transport, Transport, Voltage-gated channel, Glycoprotein, Lipoprotein, Membrane, Palmitate, Potassium channel, Transmembrane, MEMBRANE PROTEIN, TRANSPORT PROTEIN ;; MEMBRANE PROTEIN, TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3lnm__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3lnm__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3lnm__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.38 Å
Rg（电子密度）	51.55 Å
总 Rg	51.52 Å
原子数	23385
残基数	2860
排除体积	421390 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3lnm__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3lnm__assembly_2__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2
分子量 formula_weight	37353.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	11308

MLQFYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEHLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASNAEQLMENIGAIQVLPKLSSSIVHEIDSILGNKPYSKKDYRS

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	brown rat,rat,rats
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	pichia pastoris

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera
分子量 formula_weight	58860.7 kDa
突变 mutation	C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MAHHHHHHHHHHGLVPRGSMTVATGDPVDEAAALPGHPQDTYDPEADHESSERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLGDPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGEEAMEMFREDEGYIKEEERPLPENEFQRQVWLLFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENEDMHGGGVTFHTYSQSTIGYQQSTSFTDPFFIVETLCIIWWSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERDSQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPTTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYLQVTSSPKIPSSPDLKKSRSASTISKSDYMEIQEGVNNSNEDFREENLKTANSTLANTNYVNITKMLTDV

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	brown rat,rat,rats
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Pichia pastoris

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
分子量 formula_weight	743.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	(1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate
分子量 formula_weight	749.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	13

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	243

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3lnma_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.7 — NAD(P)-linked oxidoreductase
家族 Family family	c.1.7.1 — Aldo-keto reductases (NADP)

结构域编号 domain_id	d3lnmc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.7 — NAD(P)-linked oxidoreductase
家族 Family family	c.1.7.1 — Aldo-keto reductases (NADP)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	3lnmA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — NADP-dependent oxidoreductase domain

结构域编号 domain_id	3lnmB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	3lnmB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	3lnmB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	3lnmC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — NADP-dependent oxidoreductase domain

结构域编号 domain_id	3lnmD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	3lnmD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	3lnmD03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

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晶胞边长 a length_a	144.271 Å
晶胞边长 b length_b	144.271 Å
晶胞边长 c length_c	284.060 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 4 21 2
空间群编号 int_tables_number	90
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	49.640 Å
R 因子 r_factor	0.2110
R_work r_work	0.2110
R_free r_free	0.2470

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera channel

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel subunit beta-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3lnm__assembly_2__model_1

3lnm__assembly_2__model_1 | I(q)

3lnm__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera channel

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel subunit beta-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3lnm__assembly_2__model_1

3lnm__assembly_2__model_1 | I(q)

3lnm__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)