Transferrin receptor protein 1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 120–760 | 片段:UNP residues 120-760 | Serotransferrin × 2 (P02787) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;5% PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 10% 1,2-propanediol, pH Hepes 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K | 分辨率 3.25 Å R-free 0.289 |
| 2 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 B; UniProt 120–760 | 片段:UNP residues 120-760 | Serotransferrin × 2 (P02787) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;5% PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 10% 1,2-propanediol, pH Hepes 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K | 分辨率 3.25 Å R-free 0.289 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 3S9N | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11QC Human transferrin receptor ectodomain 提交 2026-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
122–760(639 aa)
链 B
122–760(639 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 11RN Complex of B19V VP1u RBD and human transferrin receptor ectodomain 提交 2026-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
122–758(637 aa)
链 B
122–758(637 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 1CX8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE ECTODOMAIN OF HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
链 B
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SM SAMARIUM (III) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;291 K;2.4 M KCl 10 mM KPi 1.5% PEG 20K, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 1CX8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE ECTODOMAIN OF HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
链 D
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SM SAMARIUM (III) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;291 K;2.4 M KCl 10 mM KPi 1.5% PEG 20K, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 1CX8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE ECTODOMAIN OF HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
链 F
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SM SAMARIUM (III) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;291 K;2.4 M KCl 10 mM KPi 1.5% PEG 20K, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 1CX8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE ECTODOMAIN OF HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 G
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
链 H
122–760(639 aa)
片段:RESIDUES 122-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SM SAMARIUM (III) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;291 K;2.4 M KCl 10 mM KPi 1.5% PEG 20K, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 1DE4 HEMOCHROMATOSIS PROTEIN HFE COMPLEXED WITH TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-11-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
121–760(640 aa)
片段:ECTODOMAIN
链 F
121–760(640 aa)
片段:ECTODOMAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG 8000, TRIS, TRIMETHYLAMINE HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 1DE4 HEMOCHROMATOSIS PROTEIN HFE COMPLEXED WITH TRANSFERRIN RECEPTOR 提交 1999-11-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 I
121–760(640 aa)
片段:ECTODOMAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG 8000, TRIS, TRIMETHYLAMINE HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 1SUV Structure of Human Transferrin Receptor-Transferrin Complex 提交 2004-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
122–760(639 aa)
链 B
122–760(639 aa)
|
未记录 | CO3 CARBONATE ION × 4 FE FE (III) ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
|
分辨率 7.50 Å |
| 2NSU Crystal structure of the ectodomain of human transferrin receptor fitted into a cryo-EM reconstruction of canine parvovirus and feline transferrin receptor complex 提交 2006-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
122–760(639 aa)
片段:THE ECTODOMAIN OF HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR
链 B
122–760(639 aa)
片段:THE ECTODOMAIN OF HUMAN TRANSFERRIN RECEPTOR
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
0.02M TRIS-HCL;pH 7.5;0.02M TRIS-HCL
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;PLUNGED IN LIQUID ETHANE
|
分辨率 27.00 Å |
| 3KAS Machupo virus GP1 bound to human transferrin receptor 1 提交 2009-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
121–760(640 aa)
片段:residues 121-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 12 K POTASSIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;1.6 M sodium potassium phosphate, 150 mM NaCl, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.238 |
| 3S9L Complex between transferrin receptor 1 and transferrin with iron in the N-Lobe, cryocooled 2 提交 2011-06-01 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
120–760(641 aa)
片段:UNP residues 120-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;5% PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 10% 1,2-propanediol, pH Hepes 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.22 Å R-free 0.314 |
| 3S9L Complex between transferrin receptor 1 and transferrin with iron in the N-Lobe, cryocooled 2 提交 2011-06-01 | 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
120–760(641 aa)
片段:UNP residues 120-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;5% PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 10% 1,2-propanediol, pH Hepes 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.22 Å R-free 0.314 |
| 3S9M Complex between transferrin receptor 1 and transferrin with iron in the N-Lobe, cryocooled 1 提交 2011-06-01 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
120–760(641 aa)
片段:UNP residues 120-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 2 FE FE (III) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;5% PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 20% 1,2-propanediol, pH Hepes 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.332 |
| 3S9M Complex between transferrin receptor 1 and transferrin with iron in the N-Lobe, cryocooled 1 提交 2011-06-01 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
120–760(641 aa)
片段:UNP residues 120-760
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 2 FE FE (III) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;5% PEG 3350, 0.2 M MgCl2, 20% 1,2-propanediol, pH Hepes 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.332 |
| 6D03 Cryo-EM structure of a Plasmodium vivax invasion complex essential for entry into human reticulocytes; one molecule of parasite ligand. 提交 2018-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
121–760(640 aa)
链 B
121–760(640 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 4 CO3 CARBONATE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 6D04 Cryo-EM structure of a Plasmodium vivax invasion complex essential for entry into human reticulocytes; two molecules of parasite ligand, subclass 1. 提交 2018-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
121–760(640 aa)
链 B
121–760(640 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 4 CO3 CARBONATE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.74 Å |
| 6D05 Cryo-EM structure of a Plasmodium vivax invasion complex essential for entry into human reticulocytes; two molecules of parasite ligand, subclass 2. 提交 2018-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
121–760(640 aa)
链 B
121–760(640 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 4 CO3 CARBONATE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6GSR Single Particle Cryo-EM map of human Transferrin receptor 1 - H-Ferritin complex at 5.5 Angstrom resolution. 提交 2018-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric |
链 Ab
121–760(640 aa)
链 Aq
121–760(640 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 6H5I Single Particle Cryo-EM map of human Transferrin receptor 1 - H-Ferritin complex. 提交 2018-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric |
链 Ab
121–760(640 aa)
链 Aq
121–760(640 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6OKD Crystal Structure of human transferrin receptor in complex with a cystine-dense peptide 提交 2019-04-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
121–760(640 aa)
片段:ligand binding domain
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;PEG 6000, Mes
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.187 |
| 6OKD Crystal Structure of human transferrin receptor in complex with a cystine-dense peptide 提交 2019-04-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
121–760(640 aa)
片段:ligand binding domain
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;PEG 6000, Mes
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.187 |
| 6W3H Brain delivery of therapeutic proteins using an Fc fragment blood-brain barrier transport vehicle in mice and monkeys 提交 2020-03-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
326–379(54 aa)
链 D
194–296(103 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;297.15 K;20-25% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH6.5, and 0.2M LiSO4
|
分辨率 3.38 Å R-free 0.318 |
| 6W3H Brain delivery of therapeutic proteins using an Fc fragment blood-brain barrier transport vehicle in mice and monkeys 提交 2020-03-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
326–379(54 aa)
链 C
194–296(103 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;297.15 K;20-25% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH6.5, and 0.2M LiSO4
|
分辨率 3.38 Å R-free 0.318 |
| 6WRV Crystal structure of computationally designed protein 3DS18 in complex with the human Transferrin receptor ectodomain 提交 2020-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
121–759(639 aa)
链 B
121–759(639 aa)
链 E
121–759(639 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.1M Sodium Malonate pH 7, 0.1M HEPES pH 7, 0.5% Jeffamine ED-2001 pH 7
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.236 |
| 6WRW Crystal structure of computationally designed protein 2DS25.5 in complex with the human Transferrin receptor ectodomain 提交 2020-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
121–760(640 aa)
链 B
121–760(640 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1M BICINE pH 8.5, 12% (w/v) monomethyl ether 550
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.235 |
| 6WRX Crystal structure of computationally designed protein 2DS25.1 in complex with the human Transferrin receptor ectodomain 提交 2020-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
121–760(640 aa)
链 B
121–760(640 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M HEPES pH 7.5, 12% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.225 |
| 6Y76 AP01 - a redesigned transferrin receptor apical domain 提交 2020-02-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
197–378(182 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium fluoride and 20% v/v PEG 3350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.275 |
| 6Y76 AP01 - a redesigned transferrin receptor apical domain 提交 2020-02-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
197–378(182 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium fluoride and 20% v/v PEG 3350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.275 |
| 7ZQS Cryo-EM Structure of Human Transferrin Receptor 1 bound to DNA Aptamer 提交 2022-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–760(760 aa)
链 D
1–760(760 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.54 Å |
| 8P0Z AP01-S2.3 - a variant of a redesigned transferrin receptor apical domain 提交 2023-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
197–299(103 aa)
链 A
332–377(46 aa)
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未记录 | NA SODIUM ION × 2 BO3 BORIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;11 mg/mL protein in 20 mM HEPES, pH 6.8, 150 mM NaCl mixed with 100 mM MIB buffer, pH 7.5, and 24 % PEG in a ratio 1:2
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分辨率 1.88 Å R-free 0.236 |
| 9GH7 Complex of human TfR1 with a potent bicyclic peptide 提交 2024-08-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
89–760(672 aa)
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 A1ILE 1-(3,5-diethanoyl-1,3,5-triazinan-1-yl)ethanone × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.1 M ammonium tartrate dibasic pH 7.0, 12% (w/v) PEG 3350.
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分辨率 2.08 Å R-free 0.235 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TFR1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 14–654; UniProt 120–760 作者链 B; PDB构建体 14–654; UniProt 120–760 |