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4hea

Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 266.8 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NADH-quinone oxidoreductase subunit 1

物种未注明

UniProt Q56222

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–438 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–438 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 J 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 S 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 J 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 S 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NQO1_THET8
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–438； UniProt 1–438 作者链 B； PDB构建体 1–438； UniProt 1–438

NADH-quinone oxidoreductase subunit 2

物种未注明

UniProt Q56221

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 2； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 K 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 T 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 K 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 T 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO2_THET8
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 C； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181

NADH-quinone oxidoreductase subunit 3

物种未注明

UniProt Q56223

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 3； UniProt 1–783 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–783 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 L 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 U 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 L 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 U 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO3_THET8
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 1–783； UniProt 1–783 作者链 D； PDB构建体 1–783； UniProt 1–783

NADH-quinone oxidoreductase subunit 4

物种未注明

UniProt Q56220

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 4； UniProt 1–409 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–409 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 M 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 V 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 M 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 V 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO4_THET8
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 4； PDB构建体 1–409； UniProt 1–409 作者链 E； PDB构建体 1–409； UniProt 1–409

NADH-quinone oxidoreductase subunit 5

物种未注明

UniProt Q56219

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 5； UniProt 1–207 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 1–207 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 N 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 W 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 N 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 W 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
5B3P Nqo5 of the trypsin-resistant fragment (1-134) in P212121 form 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–134（134 aa） 片段：UNP residues 1-134
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；200mM calcium chloride, 25% PEG 4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.209
5B3Q Nqo5 of the trypsin-resistant fragment (1-134) in P63 form 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–134（134 aa） 片段：UNP residues 1-134
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10% PEG 1000, 10% PEG 8000
分辨率 3.00 Å R-free 0.234
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 18 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NQO5_THET8
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 1–207； UniProt 1–207 作者链 F； PDB构建体 1–207； UniProt 1–207

NADH-quinone oxidoreductase subunit 6

物种未注明

UniProt Q56218

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 6； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 O 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 X 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 O 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 X 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO6_THET8
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 6； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 G； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181

NADH-quinone oxidoreductase subunit 9

物种未注明

UniProt Q56224

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 9； UniProt 1–182 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 O； UniProt 1–182 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 P 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Y 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 8 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 P 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Y 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO9_THET8
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 9； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 O； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

NADH-quinone oxidoreductase subunit 15

物种未注明

UniProt Q5SKZ7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 7； UniProt 1–129 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 1–129 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Q 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Z 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
3M9S Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2010-03-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 4.50 Å
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 15 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO15_THET8
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 7； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129 作者链 I； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

Putative uncharacterized protein TTHA1528

物种未注明

UniProt Q5SI52

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 W； UniProt 1–131 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 X； UniProt 1–131 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1WN9 Crystal structure of the hypothetical protein TT1805 from Thermus thermophillus HB8 提交 2004-07-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–131（131 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACY ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG 8000, 0.1M NaCacodylate, 170mM ZnAcetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.58 Å R-free 0.246
1WNA Crystal structure of the hypothetical protein TT1805 from Thermus thermophillus HB8 提交 2004-07-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–131（131 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；13% PEG 8000, 20% glycerol, 40mM Potassium dihydrogen phosphate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.58 Å R-free 0.229
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 X 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 X 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 X 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 X 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 X 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 X 1–131（131 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229

共 8 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q5SI52_THET8
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 X； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

NADH-quinone oxidoreductase subunit 7

物种未注明

UniProt Q56217

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–119 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 P； UniProt 1–119 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–119（119 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 P 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 P 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 P 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 P 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 P 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 P 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 11 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO7_THET8
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–119； UniProt 1–119 作者链 P； PDB构建体 1–119； UniProt 1–119

NADH-quinone oxidoreductase subunit 10

物种未注明

UniProt Q56225

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 1–176 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 R； UniProt 1–176 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–176（176 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 R 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 R 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 R 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 R 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 R 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 R 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–176（176 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 11 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO10_THET8
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176 作者链 R； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176

NADH-quinone oxidoreductase subunit 11

物种未注明

UniProt Q56226

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 K； UniProt 1–95 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 S； UniProt 1–95 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–95（95 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 S 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 S 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 S 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 S 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 S 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 S 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–95（95 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 11 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO11_THET8
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95 作者链 S； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

NADH-quinone oxidoreductase subunit 12

物种未注明

UniProt Q56227

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 L； UniProt 1–606 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 T； UniProt 1–606 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–606（606 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 T 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 T 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 T 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 T 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 T 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 T 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–606（606 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 11 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO12_THET8
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–606； UniProt 1–606 作者链 T； PDB构建体 1–606； UniProt 1–606

NADH-quinone oxidoreductase subunit 13

物种未注明

UniProt Q56228

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 M； UniProt 1–469 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 U； UniProt 1–469 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–469（469 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–469（469 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 11 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO13_THET8
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–469； UniProt 1–469 作者链 U； PDB构建体 1–469； UniProt 1–469

NADH-quinone oxidoreductase subunit 14

物种未注明

UniProt Q56229

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 N； UniProt 1–427 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 V； UniProt 1–427 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 （Q60019） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 I 1–427（427 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 V 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 V 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 V 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 V 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 V 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 V 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–427（427 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 11 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO14_THET8
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 V； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427

NADH-quinone oxidoreductase subunit 8

物种未注明

UniProt Q60019

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 1–365 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白拷贝数一致 链 Q； UniProt 1–365 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit 5 × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit 6 × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 9 × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） Putative uncharacterized protein TTHA1528 × 1 （Q5SI52） NADH-quinone oxidoreductase subunit 7 × 1 （Q56217） NADH-quinone oxidoreductase subunit 10 × 1 （Q56225） NADH-quinone oxidoreductase subunit 11 × 1 （Q56226） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 （Q56227） NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 （Q56228） NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 （Q56229） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 3.30 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4HEA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
4HE8 Crystal structure of the membrane domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–365（365 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；100 mM phosphate-citrate pH 4.5, 26% (v/v) PEG300, 5 mM CHAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.30 Å R-free 0.263
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–365（365 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO8_THET8
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 Q； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4hea

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4hea
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4hea
沉积日期 deposition_date2012-10-03
结构标题 titleCrystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus
关键词 keywordsNADH-quinone oxidoreductase, complex I, oxidoreductase, proton pump, membrane protein, NADH, menaquinone, cytoplasmic membrane; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier96.18 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron100.80 Å
零角强度 I(0) i013182700000.00
分子量 molecular_weight1050400.0 kDa
排除体积 excluded_volume1342700 ų
包络体积 envelope_volume2134300 ų
水化壳体积 shell_volume195120 ų
包络直径 envelope_diameter367.5 Å
壳层 Rg shell_rg77.03 Å
包络 Rg envelope_rg100.30 Å
形状 Rg shape_rg101.00 Å
总 Rg total_rg99.76 Å
总原子数 total_atoms73998
残基数 n_residues9540
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax266.8 Å
Rg (实空间) rg_real90.13 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.37 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2640e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.8250e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal90.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal12940000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9164
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary116.7 Å
偏度 Skewness skewness0.297
峰度 Kurtosis kurtosis-0.582
角度范围 angular_range— – 0.0800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.5650
最高正则化参数 α highest_alpha160200000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.017; Oscil: 0.996; Stabil: 0.976; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.001
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

CATH v4.4 (30 domains)

结构域编号 domain_id4hea101
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1450 —
结构域编号 domain_id4hea102
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11540 — NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit
结构域编号 domain_id4hea103
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily600 —
结构域编号 domain_id4hea104
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1440 — de novo design (two linked rop proteins)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily230 — NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit, iron-sulphur binding domain
结构域编号 domain_id4hea201
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1590 — NADH-quinone oxidoreductase subunit E
结构域编号 domain_id4hea202
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Glutaredoxin
结构域编号 domain_id4hea400
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology645 — Cytochrome-c3 Hydrogenase; chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome-c3 Hydrogenase, chain B
结构域编号 domain_id4hea600
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12280 —
结构域编号 domain_id4hea700
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology920 — Metal Transport, Frataxin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — NADH-quinone oxidoreductase, subunit 15
结构域编号 domain_id4hea900
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3270 —
结构域编号 domain_id4heaA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1610 — NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3
结构域编号 domain_id4heaB01
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1450 —
结构域编号 domain_id4heaB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily11540 — NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit
结构域编号 domain_id4heaB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily600 —
结构域编号 domain_id4heaB04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1440 — de novo design (two linked rop proteins)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily230 — NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit, iron-sulphur binding domain
结构域编号 domain_id4heaC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1590 — NADH-quinone oxidoreductase subunit E
结构域编号 domain_id4heaC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Glutaredoxin
结构域编号 domain_id4heaE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology645 — Cytochrome-c3 Hydrogenase; chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome-c3 Hydrogenase, chain B
结构域编号 domain_id4heaG00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12280 —
结构域编号 domain_id4heaI00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology920 — Metal Transport, Frataxin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — NADH-quinone oxidoreductase, subunit 15
结构域编号 domain_id4heaJ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1200 — NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ
结构域编号 domain_id4heaK00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3510 —
结构域编号 domain_id4heaL02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2700 —
结构域编号 domain_id4heaO00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3270 —
结构域编号 domain_id4heaP00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1610 — NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3
结构域编号 domain_id4heaR00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1200 — NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ
结构域编号 domain_id4heaS00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3510 —
结构域编号 domain_id4heaT02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily2700 —
结构域编号 domain_id4heaW00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1530 — hypothetical protein tt1805
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TTHA1528-like
结构域编号 domain_id4heaX00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1530 — hypothetical protein tt1805
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TTHA1528-like
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)