SAXSdb — 4i5r

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimeric cel6A

Trichoderma reesei

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	TRIETHYLENE GLYCOL × 1 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACETATE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUX2_HYPJE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 46–219； UniProt 158–331 作者链 A； PDB构建体 312–358； UniProt 425–471

Chimeric cel6A

Trichoderma reesei

UniProt Q5G2D4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	TRIETHYLENE GLYCOL × 1 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACETATE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5G2D4_9PEZI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 220–311； UniProt 339–430

Chimeric cel6A

Trichoderma reesei

UniProt Q9C1S9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	TRIETHYLENE GLYCOL × 1 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACETATE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUX6_HUMIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–45； UniProt 117–161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4i5r
沉积日期 deposition_date	2012-11-28
结构标题 title	Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A
关键词 keywords	cellobiohydrolase, chimera protein, glycoside hydrolase, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4i5r__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4i5r__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4i5r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.71 Å
Rg（电子密度）	19.44 Å
总 Rg	20.41 Å
原子数	2824
残基数	364
排除体积	49596 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4i5r__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chimeric cel6A
分子量 formula_weight	39771.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3175

GNPFEGVQLWANNYYRSEVHTLAIPQITDPALRAAASAVAEVPSFMWLDTLDKTPLMEQTLADIRTANKNGGNYAGQFVVYDLPDRDCAALASNGEYSIADGGVAKYKNYIDTIRQIVVEYSDIRTLLVIEPDSLANLVTNLGTPKCANAQSAYLECINYAVTQLNLPNVAMYLDAGHAGWLGWPANQDPAAQLFANVYKNASSPRALRGLATNVANYNAWSIASPPSYTSPNPNYDEKHYIEAFAPLLRNQGFDAKFIVDTGRNGKQPTGQLEWGHWCNVKGTGFGVRPTANTGHELVDAFVWVKPGGESDGTSDSSAPRFDSHCALPDALQPAPQAGAWFQAYFVQLLTNANPSFLHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Trichoderma reesei
通用名 common_name	Trichoderma reesei, Trichoderma reesei
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	51453
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	TRIETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	150.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	278

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4i5ra1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.6 — 7-stranded beta/alpha barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.6.1 — Glycosyl hydrolases family 6, cellulases
家族 Family family	c.6.1.1 — Glycosyl hydrolases family 6, cellulases

结构域编号 domain_id	d4i5ra2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4i5rA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — 1, 4-beta cellobiohydrolase

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晶胞边长 a length_a	158.610 Å
晶胞边长 b length_b	45.262 Å
晶胞边长 c length_c	58.602 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.21 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.500 Å
最低分辨率 resolution_low	35.309 Å
R 因子 r_factor	0.1557
R_work r_work	0.1543
R_free r_free	0.1808

Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4i5r__assembly_1__model_1

4i5r__assembly_1__model_1 | I(q)

4i5r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4i5r__assembly_1__model_1

4i5r__assembly_1__model_1 | I(q)

4i5r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)