SAXSdb — 4i5u

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimeric cel6A

Trichoderma reesei

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 158–331 链 A； UniProt 425–471	未记录	ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.22 Å R-free 0.158

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4I5U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CB2 CELLOBIOHYDROLASE II, CATALYTIC DOMAIN, MUTANT Y169F 提交 1995-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC	突变：Y169F	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
1CB2 CELLOBIOHYDROLASE II, CATALYTIC DOMAIN, MUTANT Y169F 提交 1995-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC	突变：Y169F	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
1HGW CEL6A D175A mutant 提交 2000-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83-447	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH 10MM COCL2.	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
1HGW CEL6A D175A mutant 提交 2000-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83-447	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH 10MM COCL2.	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
1HGY CEL6A D221A mutant 提交 2000-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83-447	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 6 BMA beta-D-mannopyranose × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG6000, 10MM MES BUFFER., pH 6.00	分辨率 2.20 Å R-free 0.258
1HGY CEL6A D221A mutant 提交 2000-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83-447	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG6000, 10MM MES BUFFER., pH 6.00	分辨率 2.20 Å R-free 0.258
1QJW CEL6A (Y169F) WITH A NON-HYDROLYSABLE CELLOTETRAOSE 提交 1999-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83-447	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CD CADMIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH6.0, 10MM CDCL2., pH 6.00	分辨率 1.90 Å R-free 0.208
1QJW CEL6A (Y169F) WITH A NON-HYDROLYSABLE CELLOTETRAOSE 提交 1999-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 107–471（365 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83-447	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CD CADMIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH6.0, 10MM CDCL2., pH 6.00	分辨率 1.90 Å R-free 0.208
1QK0 CEL6A WITH A NON-HYDROLYSABLE CELLOTETRAOSE 提交 1999-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 85-447	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CO COBALT (II) ION × 1 IOB 3-IODO-BENZYL ALCOHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH6.0, 10MM COCL2., pH 6.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.221
1QK0 CEL6A WITH A NON-HYDROLYSABLE CELLOTETRAOSE 提交 1999-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 85-447	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CO COBALT (II) ION × 1 IOB 3-IODO-BENZYL ALCOHOL × 1 IOD IODIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH6.0, 10MM COCL2., pH 6.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.221
1QK2 WILD TYPE CEL6A WITH A NON-HYDROLYSABLE CELLOTETRAOSE 提交 1999-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 85-447	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH6.0, 10MM COCL2., pH 6.00	分辨率 2.00 Å R-free 0.222
1QK2 WILD TYPE CEL6A WITH A NON-HYDROLYSABLE CELLOTETRAOSE 提交 1999-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 85-447	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；20% PEG6000, 20MM MES BUFFER PH6.0, 10MM COCL2., pH 6.00	分辨率 2.00 Å R-free 0.222
3CBH THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF CELLOBIOHYDROLASE FROM TRICHODERMA REESEI 提交 1990-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 107–471（365 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
4AU0 Hypocrea jecorina Cel6A D221A mutant soaked with 6-chloro-4- methylumbelliferyl-beta-cellobioside 提交 2012-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 8 XZZ 6-chloro-7-hydroxy-4-methyl-2H-chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG5000 MONOMETHYL ETHER, 20MM NA -MES BUFFER PH6.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.235
4AU0 Hypocrea jecorina Cel6A D221A mutant soaked with 6-chloro-4- methylumbelliferyl-beta-cellobioside 提交 2012-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 XZZ 6-chloro-7-hydroxy-4-methyl-2H-chromen-2-one × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG5000 MONOMETHYL ETHER, 20MM NA -MES BUFFER PH6.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.235
4AX6 HYPOCREA JECORINA CEL6A D221A MUTANT SOAKED WITH 6-CHLORO-4- PHENYLUMBELLIFERYL-BETA-CELLOBIOSIDE 提交 2012-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 UWU 6-chloranyl-7-oxidanyl-4-phenyl-chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER (FLUKA) AND 20 MM SODIUM MES BUFFER, PH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.254
4AX6 HYPOCREA JECORINA CEL6A D221A MUTANT SOAKED WITH 6-CHLORO-4- PHENYLUMBELLIFERYL-BETA-CELLOBIOSIDE 提交 2012-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 5 UWU 6-chloranyl-7-oxidanyl-4-phenyl-chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER (FLUKA) AND 20 MM SODIUM MES BUFFER, PH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.254
4AX7 Hypocrea jecorina Cel6A D221A mutant soaked with 4-Methylumbelliferyl- beta-D-cellobioside 提交 2012-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 4MU 7-hydroxy-4-methyl-2H-chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER (FLUKA) AND 20 MM SODIUM MES BUFFER, PH 6.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.221
4AX7 Hypocrea jecorina Cel6A D221A mutant soaked with 4-Methylumbelliferyl- beta-D-cellobioside 提交 2012-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 4MU 7-hydroxy-4-methyl-2H-chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER (FLUKA) AND 20 MM SODIUM MES BUFFER, PH 6.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.221
4AX7 Hypocrea jecorina Cel6A D221A mutant soaked with 4-Methylumbelliferyl- beta-D-cellobioside 提交 2012-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 6 4MU 7-hydroxy-4-methyl-2H-chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER (FLUKA) AND 20 MM SODIUM MES BUFFER, PH 6.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.221
4AX7 Hypocrea jecorina Cel6A D221A mutant soaked with 4-Methylumbelliferyl- beta-D-cellobioside 提交 2012-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 109–471（363 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 109-471	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 7 4MU 7-hydroxy-4-methyl-2H-chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER (FLUKA) AND 20 MM SODIUM MES BUFFER, PH 6.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.221
4I5R Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A 提交 2012-11-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 158–331（174 aa）链 A 425–471（47 aa）	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.75；pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.50 Å R-free 0.181

共 11 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUX2_HYPJE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 46–219； UniProt 158–331 作者链 A； PDB构建体 312–358； UniProt 425–471

Chimeric cel6A

Trichoderma reesei

UniProt Q5G2D4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 339–430	未记录	ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.22 Å R-free 0.158

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4I5U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4I5R Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A 提交 2012-11-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 339–430（92 aa）	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.75；pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.50 Å R-free 0.181

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5G2D4_9PEZI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 220–311； UniProt 339–430

Chimeric cel6A

Trichoderma reesei

UniProt Q9C1S9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 117–161	未记录	ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.22 Å R-free 0.158

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4I5U	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BVW CELLOBIOHYDROLASE II (CEL6A) FROM HUMICOLA INSOLENS 提交 1998-09-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 91–450（360 aa）片段：CATALYTIC CORE DOMAIN RESIDUES 91-450	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 20 MG/ML IN WATER. CRYSTALLISATION IN 200MM MAGNESIUM ACETATE IN 100MM TRIETHANOLAMINE BUFFER AT PH 7.0. PRECIPITANT WAS 22%. POLYETHYLENE GLYCOL 8000.	分辨率 1.92 Å R-free 0.210
2BVW CELLOBIOHYDROLASE II (CEL6A) FROM HUMICOLA INSOLENS IN COMPLEX WITH GLUCOSE AND CELLOTETRAOSE 提交 1999-02-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 115–476（362 aa）片段：CATALYTIC CORE DOMAIN	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
2BVW CELLOBIOHYDROLASE II (CEL6A) FROM HUMICOLA INSOLENS IN COMPLEX WITH GLUCOSE AND CELLOTETRAOSE 提交 1999-02-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 115–476（362 aa）片段：CATALYTIC CORE DOMAIN	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
4I5R Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A 提交 2012-11-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 117–161（45 aa）	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.75；pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.50 Å R-free 0.181

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUX6_HUMIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–45； UniProt 117–161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4i5u
沉积日期 deposition_date	2012-11-29
结构标题 title	Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A
关键词 keywords	cellobiohydrolase, chimera protein, glycoside hydrolase, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.12 Å
零角强度 I(0) i0	26834600.00
分子量 molecular_weight	39909.0 kDa
排除体积 excluded_volume	49906 Å³
包络体积 envelope_volume	55108 Å³
水化壳体积 shell_volume	23238 Å³
包络直径 envelope_diameter	60.8 Å
壳层 Rg shell_rg	26.39 Å
包络 Rg envelope_rg	19.29 Å
形状 Rg shape_rg	19.08 Å
总 Rg total_rg	20.13 Å
总原子数 total_atoms	2820
残基数 n_residues	358
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	60.8 Å
Rg (实空间) rg_real	20.10 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.30 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.6830e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4060e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.13 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	26840000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9012
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	26.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.032
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.500
角度范围 angular_range	— – 0.3900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6818000.0000
实空间数据点数 n_real_points	71
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.918; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.969; Smooth: 0.988

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chimeric cel6A
分子量 formula_weight	39740.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.91
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3236

GNPFEGVQLWANNYYRSEVHTLAIPQITDPALRAAASAAAEVPSFLWLDTLDKTPLMEQTLADIRTANKNGGNYAGQFVVYDLPDRDCAALASNGEYSIADGGVAKYKNYIDTIRQIVVEYSDIRTLLVIEPDSLANLVTNLGTPKCANAQSAYLECINYAVTQLNLPNVAMYLDAGHAGWLGWPANLDPAAQLFANVYKNASSPRALRGLATNVANYNAWSIASPPPYTSPNPNYDEKHYIEAFAPLLRNQGFDAKFIVDTGRNGKQPTGQLEWGHWCNVKGTGFGVRPTANTGHELVDAFVWVKPGGESDGTSDPSAPRFDPHCALPDALQPAPQAGAWFQAYFVQLLTNANPSFLHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Trichoderma reesei
通用名 common_name	Trichoderma reesei, Trichoderma reesei
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	51453
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	TRIETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	150.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	327

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4i5ua_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.6 — 7-stranded beta/alpha barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.6.1 — Glycosyl hydrolases family 6, cellulases
家族 Family family	c.6.1.1 — Glycosyl hydrolases family 6, cellulases

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4i5uA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — 1, 4-beta cellobiohydrolase

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	158.599 Å
晶胞边长 b length_b	45.414 Å
晶胞边长 c length_c	58.194 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.47 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.220 Å
最低分辨率 resolution_low	35.308 Å
R 因子 r_factor	0.1434
R_work r_work	0.1426
R_free r_free	0.1584

fit	/app/data/saxs_computation/i5/4i5u/4i5u.fit
pddf	/app/data/pr_computation/i5/4i5u/4i5u.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/i5/4i5u/4i5u.dat

Crystal structure of a fungal chimeric cellobiohydrolase Cel6A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chimeric cel6A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)