SAXSdb — 4lg0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Forkhead box protein O1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 2 DNA 2 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 143–270	片段：DNA Binding Domain, UNP residues 143-270	Protein C-ets-1 × 1 （P14921） ;DNA (5'-D(DTPDTPDCPDAPDCPDGPDGPDTPDTPDTPDCPDCPDTPDGPDTPDTPDAPDTPDTPDGPDT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(DAPDAPDAPDCPDAPDAPDTPDAPDAPDCPDAPDGPDGPDAPDAPDAPDCPDCPDGPDTPDG)-3') ; × 1 CA CALCIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；30% PEG 400, 0.05M 2-Amino-2-hydroxymethyl-propane-1,3-diol, 0.1M potassium chloride, 0.01M magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.19 Å R-free 0.243

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4LG0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3CO6 Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to DBE1 DNA 提交 2008-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 C 151–249（99 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；22% PEG 4000, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.256
3CO7 Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to DBE2 DNA 提交 2008-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 C 151–266（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；21% PEG 4000, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.91 Å R-free 0.276
3CO7 Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to DBE2 DNA 提交 2008-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 F 151–266（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；21% PEG 4000, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.91 Å R-free 0.276
3COA Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to IRE DNA 提交 2008-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 C 151–266（116 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
3COA Crystal Structure of FoxO1 DBD Bound to IRE DNA 提交 2008-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 F 151–266（116 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；30% PEG 4000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
5DUI Identification of a new FoxO1 binding site that precludes CREB binding at the glucose-6-phosphatase catalytic subunit gene promoter 提交 2015-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 151–259（109 aa）片段：unp residues 151-259 链 B 151–259（109 aa）片段：unp residues 151-259	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14-18% PEG 8000 0.1M Ammonium sulfate 20mM Magnesium chloride 50mM MES pH 5.6 10% glycerol	分辨率 2.31 Å R-free 0.245
6LBI Crystal Structure of FOXO1-DBD homodimer bound to a palindromic DNA sequence 提交 2019-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 151–265（115 aa）链 D 151–265（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM NaAc, pH 4.7, 12%-18% PEG4000 (w/v), 200 mM NaCl, 10 mM MgCl2 and 1 mM TCEP.	分辨率 3.07 Å R-free 0.264
6LBI Crystal Structure of FOXO1-DBD homodimer bound to a palindromic DNA sequence 提交 2019-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 G 151–265（115 aa）链 H 151–265（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM NaAc, pH 4.7, 12%-18% PEG4000 (w/v), 200 mM NaCl, 10 mM MgCl2 and 1 mM TCEP.	分辨率 3.07 Å R-free 0.264
6LBI Crystal Structure of FOXO1-DBD homodimer bound to a palindromic DNA sequence 提交 2019-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 K 151–265（115 aa）链 L 151–265（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM NaAc, pH 4.7, 12%-18% PEG4000 (w/v), 200 mM NaCl, 10 mM MgCl2 and 1 mM TCEP.	分辨率 3.07 Å R-free 0.264
6QVW Solution structure of the free FOXO1 DNA binding domain 提交 2019-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 159–272（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 1 NMR样品组成 380 uM [U-13C; U-15N] FOXO1 DBD, 20 mM sodium phosphate, 50 mM potassium chloride, 2 mM TCEP, 100 % n/a n/a, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 19–29（11 aa）链 O 19–29（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 19–29（11 aa）链 P 19–29（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 19–29（11 aa）链 U 19–29（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
6QZR 14-3-3 sigma in complex with FOXO1 pT24 peptide 提交 2019-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 19–29（11 aa）链 T 19–29（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2M Sodium nitrate, 28% (w/v) PEG400, 5% (w/v) glycerol	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
8A62 Small molecule stabilizer (compound 2) for FOXO1 and 14-3-3 提交 2022-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 20–29（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 L7L (3~{S})-1-[3,5-bis(chloranyl)-4-oxidanyl-phenyl]carbonyl-~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]piperidine-3-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH 7.5, 0.19 M CaCl2, 5% glycerol, 24% PEG 400	分辨率 1.60 Å R-free 0.182
8A65 Small molecule stabilizer (compound 3) for FOXO1 and 14-3-3 提交 2022-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 21–28（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 L70 (3~{S})-1-[2-azanyl-3,5-bis(chloranyl)phenyl]carbonyl-~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]piperidine-3-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH 7.3, 0.19 M CaCl2, 5% glycerol, 25% PEG 400	分辨率 1.60 Å R-free 0.193

共 9 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FOXO1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–133； UniProt 143–270

Protein C-ets-1

Homo sapiens

UniProt P14921

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 2 DNA 2 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 331–440	片段：DNA binding domain, UNP residues 331-440	Forkhead box protein O1 × 1 （Q12778） ;DNA (5'-D(DTPDTPDCPDAPDCPDGPDGPDTPDTPDTPDCPDCPDTPDGPDTPDTPDAPDTPDTPDGPDT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(DAPDAPDAPDCPDAPDAPDTPDAPDAPDCPDAPDGPDGPDAPDAPDAPDCPDCPDGPDTPDG)-3') ; × 1 CA CALCIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；30% PEG 400, 0.05M 2-Amino-2-hydroxymethyl-propane-1,3-diol, 0.1M potassium chloride, 0.01M magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.19 Å R-free 0.243

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4LG0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1GVJ ETS-1 DNA BINDING AND AUTOINHIBITORY DOMAINS 提交 2002-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 297–441（145 aa）片段：RESIDUES 297-441 链 B 297–441（145 aa）片段：RESIDUES 297-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；297 K；0.2 M AMMONIUM ACETATE, 30% W/V PEG 4000, 0.1 M SODIUM CITRATE PH 5.6, PROTEIN CONCENTRATION 15 MG/ML PLUS 10 MM DTT, TEMPERATURE 297 K, FOR CRYOPROTECTION 10% OF PEG 400 WAS ADDED.	分辨率 1.53 Å R-free 0.235
2NNY Crystal structure of the Ets1 dimer DNA complex. 提交 2006-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 280–441（162 aa）片段：residues 280-441 链 B 280–441（162 aa）片段：residues 280-441	突变：C350S , C416S 突变：C350S , C416S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.2 M ammonium acetate 28% PEG 2000 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K, temperature 298K	分辨率 2.58 Å R-free 0.271
2STT SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE HUMAN ETS1/DNA COMPLEX, 25 STRUCTURES 提交 1996-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 320–415（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K	分辨率未提供
2STW SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE HUMAN ETS1/DNA COMPLEX, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 1996-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 320–415（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K	分辨率未提供
3MFK Ets1 complex with stromelysin-1 promoter DNA 提交 2010-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 280–441（162 aa）片段：UNP residues 280-441 链 B 280–441（162 aa）片段：UNP residues 280-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；15 mM ammonium chloride, 15 mM magnesium chloride, 0.7 M NDSB-195, 40 mM MES buffer (pH 6.5) and 11.5% v/v 2-Propanol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295 K	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
3RI4 Ets1 cooperative binding to widely separated sites on promoter DNA 提交 2011-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 64–225（162 aa）片段：UNP residues 280-441 链 D 64–225（162 aa）片段：UNP residues 280-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 sitting drop vapor diffusion and macroseeding；pH 8.5；295 K；200 mM ammonium chloride, 10 mM calcium chloride, 50 mM Tris-HCl buffer (pH 8.5), 18.5% v/v PEG MME 2000, 3% v/v glycerol, sitting drop vapor diffusion and macroseeding, temperature 295K	分辨率 3.00 Å R-free 0.284
3WTS Crystal structure of the complex comprised of ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG 4000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.05M TRIS HCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.279
3WTS Crystal structure of the complex comprised of ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG 4000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.05M TRIS HCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.279
3WTT Crystal structure of the complex comprised of phosphorylated ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.277
3WTT Crystal structure of the complex comprised of phosphorylated ETS1, RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.277
3WTU Crystal structure of the complex comprised of ETS1 (V170A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.282
3WTU Crystal structure of the complex comprised of ETS1 (V170A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.282
3WTV Crystal structure of the complex comprised of ETS1(V170G), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.284
3WTV Crystal structure of the complex comprised of ETS1(V170G), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；4% PEG 8000, 0.1M AMMONIUM ACETATE, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.284
3WTW Crystal structure of the complex comprised of ETS1(K167A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% ISOPROPANOL, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3WTW Crystal structure of the complex comprised of ETS1(K167A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；12% ISOPROPANOL, 0.02M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.05M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.264
3WTX Crystal structure of the complex comprised of ETS1(Y329A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：Y329A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE PH5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
3WTX Crystal structure of the complex comprised of ETS1(Y329A), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：Y329A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；10% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE PH5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
3WTY Crystal structure of the complex comprised of ETS1(G333P), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：G333P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；4% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3WTY Crystal structure of the complex comprised of ETS1(G333P), RUNX1, CBFBETA, and the tcralpha gene enhancer DNA 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 H 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	突变：G333P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；4% PEG 4000, 0.25M AMMONIUM ACETATE, 0.05M SODIUM ACETATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3WTZ Crystal structure of ETS-1 DNA binding and autoinhibitory domains (276-441) 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441 链 B 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；9% MPD, 6% PEG 6000, 0.1M HEPES, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.61 Å R-free 0.252
3WU0 Crystal structure of phosphorylated ETS-1 DNA binding and autoinhibitory domains (276-441) 提交 2014-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441 链 B 276–441（166 aa）片段：UNP RESIDUES 276-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；5% PEG 3000, 25% MPD, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.277
3WU1 Crystal structure of the ETS1-RUNX1-DNA ternary complex 提交 2014-04-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 333–441（109 aa）片段：UNP RESIDUES 333-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；11% PEG MME 550, 0.1M KCL, 0.015M MGCL2, 0.05M TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.249
4L0Y Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 1) 提交 2013-06-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 296–441（146 aa）片段：UNP residues 296-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；Plate-shaped crystals grown from 100 mM potassium chloride, 15 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 14% v/v PEG550 MME, 6% v/v glycerol, crystal size improved by macroseeding, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.245
4L0Z Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 2) 提交 2013-06-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 296–441（146 aa）片段：UNP residues 296-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；Square bipyramid-shaped crystals grown from 100 mM potassium chloride, 15 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 14% v/v PEG550 MME, 6% v/v glycerol, crystal size improved by macroseeding, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
4L18 Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 3) 提交 2013-06-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 296–441（146 aa）片段：UNP residues 296-441	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；2.5% w/v PEG4000, 5 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 5% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.280
4L18 Crystal structure of Runx1 and Ets1 bound to TCR alpha promoter (crystal form 3) 提交 2013-06-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 F 296–441（146 aa）片段：UNP residues 296-441	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；2.5% w/v PEG4000, 5 mM magnesium chloride hexahydrate, 25 mM MES, pH 5.6, 5% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.280
5ZMC Structural Basis for Reactivation of -146C>T Mutant TERT Promoter by cooperative binding of p52 and ETS1/2 提交 2018-04-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 331–441（111 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 2.0 M Ammonium sulphate	分辨率 2.99 Å R-free 0.288

共 20 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETS1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–112； UniProt 331–440

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4lg0
沉积日期 deposition_date	2013-06-27
结构标题 title	Structure of a ternary FOXO1-ETS1 DNA complex
关键词 keywords	;DEOXYRIBONUCLEIC ACID, COMPLEX (DNA-BINDING PROTEIN-DNA), PHOSPHOPROTEIN, PROTO-ONCOGENE, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX, WINGED HELIX, FORKHEAD DOMAIN, ETS BINDING DOMAIN, HELIX-TURN-HELIX, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION REGULATION, DNA-BINDING, PHOSPHORYLATION, NUCLEUS ;; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.54 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	22.16 Å
零角强度 I(0) i0	32455900.00
分子量 molecular_weight	35894.0 kDa
排除体积 excluded_volume	41438 Å³
包络体积 envelope_volume	53239 Å³
水化壳体积 shell_volume	20730 Å³
包络直径 envelope_diameter	77.4 Å
壳层 Rg shell_rg	28.08 Å
包络 Rg envelope_rg	22.44 Å
形状 Rg shape_rg	22.14 Å
总 Rg total_rg	22.86 Å
总原子数 total_atoms	2478
残基数 n_residues	237
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	74.9 Å
Rg (实空间) rg_real	22.56 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.54 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.2460e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.9230e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	32460000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8921
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	25.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.357
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.382
角度范围 angular_range	— – 0.3500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4218000.0000
实空间数据点数 n_real_points	67
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.874; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.978; Smooth: 0.995

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Forkhead box protein O1
分子量 formula_weight	14788.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2618

GPGYPGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein C-ets-1
分子量 formula_weight	13174.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MGGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDAD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(DTPDTPDCPDAPDCPDGPDGPDTPDTPDTPDCPDCPDTPDGPDTPDTPDAPDTPDTPDGP*DT)-3') ;
分子量 formula_weight	6401.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C

TTCACGGTTTCCTGTTATTGT

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(DAPDAPDAPDCPDAPDAPDTPDAPDAPDCPDAPDGPDGPDAPDAPDAPDCPDCPDGPDTP*DG)-3') ;
分子量 formula_weight	6482.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D

AAACAATAACAGGAAACCGTG

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	70

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4lg0A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	4lg0B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	68.658 Å
晶胞边长 b length_b	114.944 Å
晶胞边长 c length_c	136.325 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.190 Å
最低分辨率 resolution_low	43.938 Å
R 因子 r_factor	0.1968
R_work r_work	0.1945
R_free r_free	0.2430

fit	/app/data/saxs_computation/lg/4lg0/4lg0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/lg/4lg0/4lg0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/lg/4lg0/4lg0.dat

Structure of a ternary FOXO1-ETS1 DNA complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Forkhead box protein O1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein C-ets-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)